More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1467 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1467  ribonuclease  100 
 
 		 1031 aa  2078    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00760754  normal  0.972482 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  50.61 
 
 		 503 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  50.76 
 
 		 531 aa  385  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  50.24 
 
 		 496 aa  385  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  50.76 
 
 		 503 aa  382  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0738  ribonuclease  49.16 
 
 		 740 aa  382  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  49.52 
 
 		 496 aa  379  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  50.51 
 
 		 500 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0469  ribonuclease, Rne/Rng family  51.01 
 
 		 503 aa  370  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.108374  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  45.48 
 
 		 543 aa  357  5e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0350  ribonuclease  48.99 
 
 		 507 aa  355  2e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000520175  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  45.45 
 
 		 530 aa  350  6e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  45.45 
 
 		 564 aa  348  4e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  44.44 
 
 		 559 aa  341  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0098  ribonuclease  44.95 
 
 		 517 aa  338  2.9999999999999997e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  44.19 
 
 		 489 aa  332  2e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  40.7 
 
 		 496 aa  331  6e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  40.7 
 
 		 496 aa  331  6e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  43.25 
 
 		 562 aa  328  2.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002387  cytoplasmic axial filament protein CafA and Ribonuclease G  44.44 
 
 		 489 aa  329  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  43.69 
 
 		 489 aa  325  3e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  40.15 
 
 		 492 aa  324  7e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  42.4 
 
 		 494 aa  323  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03106  ribonuclease G  43.43 
 
 		 489 aa  318  3e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00482179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0460  ribonuclease, Rne/Rng family  43.43 
 
 		 489 aa  318  3e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.305617  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3729  ribonuclease G  43.43 
 
 		 489 aa  318  3e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0310546  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3436  ribonuclease G  43.43 
 
 		 489 aa  318  3e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0339083  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4563  ribonuclease G  43.43 
 
 		 489 aa  318  3e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal  0.973198 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0460  ribonuclease G  43.43 
 
 		 489 aa  318  3e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0238321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3278  ribonuclease G  43.43 
 
 		 489 aa  318  3e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0640043  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3542  ribonuclease G  43.43 
 
 		 489 aa  318  3e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0424  ribonuclease  41.83 
 
 		 613 aa  318  4e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000319461  hitchhiker  0.0000523275 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0487  RNAse G  40.95 
 
 		 528 aa  315  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.258598  normal  0.0128564 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3561  ribonuclease G  42.17 
 
 		 489 aa  313  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.026013  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3730  ribonuclease G  42.17 
 
 		 489 aa  313  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0965713 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3633  ribonuclease G  42.17 
 
 		 489 aa  313  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490544 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3562  ribonuclease G  42.17 
 
 		 489 aa  313  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3668  ribonuclease G  42.17 
 
 		 489 aa  313  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.612174 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3673  ribonuclease G  41.61 
 
 		 489 aa  312  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36069  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  39.02 
 
 		 497 aa  311  2.9999999999999997e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  41.44 
 
 		 492 aa  311  2.9999999999999997e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3831  ribonuclease G  41.12 
 
 		 489 aa  311  4e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  39.02 
 
 		 497 aa  311  4e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  40.91 
 
 		 487 aa  310  1.0000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3683  ribonuclease G  41.67 
 
 		 489 aa  310  1.0000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1194  ribonuclease G  41.12 
 
 		 489 aa  309  2.0000000000000002e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  hitchhiker  0.001915 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12690  Ribonuclease E/G  41.25 
 
 		 485 aa  308  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0256  ribonuclease G  41.12 
 
 		 489 aa  309  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0912281  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0482  ribonuclease  40.48 
 
 		 528 aa  309  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000399886  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0469  ribonuclease G  41.12 
 
 		 489 aa  309  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0841799  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0402  ribonuclease G  41.12 
 
 		 489 aa  309  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.124199  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2657  ribonuclease E and G  42.37 
 
 		 490 aa  308  4.0000000000000004e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121341  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2082  ribonuclease  40.97 
 
 		 491 aa  308  4.0000000000000004e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0267  ribonuclease G  40.63 
 
 		 489 aa  308  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  40.35 
 
 		 490 aa  307  5.0000000000000004e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00268  ribonuclease G  40.91 
 
 		 488 aa  307  6e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  39.25 
 
 		 483 aa  307  7e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  39.04 
 
 		 489 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  40.5 
 
 		 485 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  40.5 
 
 		 485 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1975  ribonuclease G  39.29 
 
 		 501 aa  303  8.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.767333  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1941  ribonuclease  41.46 
 
 		 484 aa  303  8.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0724052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1735  ribonuclease  39.75 
 
 		 499 aa  303  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  38.54 
 
 		 489 aa  301  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  38.54 
 
 		 489 aa  301  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0487  ribonuclease G  42.42 
 
 		 489 aa  299  1e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0311265  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4407  ribonuclease G  40.15 
 
 		 489 aa  300  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0408475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2236  ribonuclease G  42 
 
 		 487 aa  300  1e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0860  RNAse G  40.5 
 
 		 485 aa  299  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3750  ribonuclease G  42.17 
 
 		 502 aa  299  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.580214  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0471  ribonuclease G  42.42 
 
 		 502 aa  299  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3468  ribonuclease G  41.92 
 
 		 502 aa  298  3e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.893805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3644  ribonuclease G  41.92 
 
 		 502 aa  298  3e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0483  ribonuclease G  41.92 
 
 		 488 aa  298  4e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.605278 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4094  ribonuclease G  41.67 
 
 		 488 aa  297  6e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  46.3 
 
 		 1194 aa  297  7e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2724  ribonuclease  39.11 
 
 		 493 aa  297  7e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.590844  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2271  ribonuclease G  41.85 
 
 		 493 aa  296  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0501  ribonuclease G  41.16 
 
 		 502 aa  296  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.188021  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  45.68 
 
 		 1427 aa  296  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0842  RNAse G  40.75 
 
 		 492 aa  296  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0915958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2690  ribonuclease, Rne/Rng family  36.85 
 
 		 508 aa  296  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.251844  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  44.44 
 
 		 908 aa  295  3e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0578  ribonuclease G  41.16 
 
 		 502 aa  295  3e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.4987  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  40.49 
 
 		 496 aa  295  3e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3818  ribonuclease G  41.16 
 
 		 502 aa  295  4e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0526  ribonuclease G  41.16 
 
 		 488 aa  295  4e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1719  ribonuclease, Rne/Rng family  37.66 
 
 		 495 aa  295  4e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0522  ribonuclease G  41.16 
 
 		 488 aa  295  4e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.440198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1914  ribonuclease G  37.66 
 
 		 495 aa  294  5e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01887  ribonuclease G  41.16 
 
 		 499 aa  294  5e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4556  ribonuclease G  38.1 
 
 		 485 aa  294  7e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  44.14 
 
 		 1007 aa  294  7e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12490  ribonuclease, Rne/Rng family  42.69 
 
 		 1093 aa  293  1e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  45.94 
 
 		 702 aa  293  1e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0407  ribonuclease G  41.92 
 
 		 500 aa  291  3e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.52955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3196  ribonuclease G  36.93 
 
 		 517 aa  292  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0274  ribonuclease G  42.07 
 
 		 491 aa  292  3e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3734  ribonuclease G  41.16 
 
 		 496 aa  291  3e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3527  ribonuclease  38.42 
 
 		 515 aa  291  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255196  normal  0.0164409 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>