More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2358 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  702    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  82.46 
 
 		 342 aa  567  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  56.1 
 
 		 333 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  56.68 
 
 		 335 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  56.38 
 
 		 335 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  57.54 
 
 		 336 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  56.19 
 
 		 335 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  51.08 
 
 		 331 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  48.34 
 
 		 331 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25400  Anti-sigma factor, FecR family  54.5 
 
 		 277 aa  251  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  33.95 
 
 		 327 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  34.48 
 
 		 357 aa  149  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  32.44 
 
 		 328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  29.27 
 
 		 350 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  32.93 
 
 		 320 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  32.71 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  32.8 
 
 		 328 aa  133  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  30.18 
 
 		 339 aa  132  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  32.26 
 
 		 345 aa  129  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  29.88 
 
 		 320 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  36.65 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  31.38 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1968  anti-FecI sigma factor, FecR  29.97 
 
 		 336 aa  127  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  36.2 
 
 		 268 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  30.34 
 
 		 329 aa  122  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  31.75 
 
 		 326 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  29.6 
 
 		 324 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  29.76 
 
 		 320 aa  120  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  27.98 
 
 		 335 aa  119  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  31.8 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  26.91 
 
 		 314 aa  115  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  28.75 
 
 		 311 aa  115  8.999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  27.42 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  31.51 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  32.94 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  30.07 
 
 		 320 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  29.94 
 
 		 338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0142  anti-FecI sigma factor, FecR  30.56 
 
 		 359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26324  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2125  anti-FecI sigma factor, FecR  31.04 
 
 		 333 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  32.61 
 
 		 334 aa  113  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  28.34 
 
 		 318 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  25.61 
 
 		 336 aa  112  9e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  30.36 
 
 		 327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  30.82 
 
 		 315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  29.57 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  29.3 
 
 		 320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2396  putative FecR  30.1 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0170576  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  31.19 
 
 		 337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  28.79 
 
 		 333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  29.41 
 
 		 324 aa  109  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  28.06 
 
 		 321 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  31.65 
 
 		 344 aa  109  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  28.4 
 
 		 351 aa  106  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  28.62 
 
 		 309 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  31.75 
 
 		 326 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0654  anti-FecI sigma factor, FecR  36.49 
 
 		 319 aa  106  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  30.45 
 
 		 328 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  31.75 
 
 		 326 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4834  transmembrane sensor  27.99 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895358  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  29.04 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40220  Anti-sigma factor protein, FecR family  33.83 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1133  anti-FecI sigma factor, FecR  31.41 
 
 		 322 aa  105  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  34.2 
 
 		 274 aa  104  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2817  putative regulatory protein  25.48 
 
 		 373 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00787345  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  31.25 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1833  FecR protein  27.46 
 
 		 306 aa  102  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  30.6 
 
 		 328 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  27.47 
 
 		 330 aa  102  9e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  27.93 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2144  anti-FecI sigma factor, FecR  34.74 
 
 		 283 aa  101  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2952  anti-FecI sigma factor, FecR  32.09 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633834 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4160  anti-FecI sigma factor, FecR  28.48 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0228  putative transmembrane sensor  32.42 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  27.04 
 
 		 301 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4232  anti-FecI sigma factor, FecR  27.94 
 
 		 329 aa  99.4  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  27.36 
 
 		 318 aa  99.4  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1586  anti-FecI sigma factor, FecR  32.49 
 
 		 311 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546792  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  26.27 
 
 		 368 aa  99  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  27.73 
 
 		 315 aa  99  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1076  anti-FecI sigma factor, FecR  28.88 
 
 		 347 aa  98.6  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4012  FecR protein  29.35 
 
 		 333 aa  99  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55540  transmembrane sensor  28.57 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0301883 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3665  anti-FecI sigma factor, FecR  29.11 
 
 		 311 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234972 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4751  anti-FecI sigma factor, FecR  32.19 
 
 		 344 aa  98.2  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal  0.56762 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4367  anti-FecI sigma factor, FecR  26.77 
 
 		 329 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1931  FecR protein  27.05 
 
 		 320 aa  98.2  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.167252  normal  0.0413006 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0873  anti-FecI sigma factor, FecR  27.94 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3504  anti-FecI sigma factor, FecR  27.94 
 
 		 348 aa  97.4  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2427  anti-FecI sigma factor, FecR  28.62 
 
 		 324 aa  97.1  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  28.39 
 
 		 329 aa  97.1  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  28.3 
 
 		 327 aa  97.1  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1718  putative transmembrane sensor  28.39 
 
 		 329 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  30 
 
 		 320 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5853  anti-FecI sigma factor, FecR  30.04 
 
 		 375 aa  95.9  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0884  putative FecR  29.08 
 
 		 318 aa  95.5  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0244  putative regulatory protein  24.78 
 
 		 345 aa  94.7  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3323  anti-FecI sigma factor, FecR  29.65 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5130  putative FecR  28.08 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  29.15 
 
 		 317 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2187  anti-FecI sigma factor, FecR  29.05 
 
 		 318 aa  94  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.779531  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>