More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4530 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4530  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 449 aa  931    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4434  phage integrase family site specific recombinase  61.37 
 
 		 427 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51650  putative integrase  60.53 
 
 		 426 aa  522  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000506916  hitchhiker  0.0000630791 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36590  phage integrase  53.65 
 
 		 415 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.706618  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60140  xerD-like putative integrase  72.09 
 
 		 306 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000287702  hitchhiker  0.00000000219898 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1421  Phage integrase  49.64 
 
 		 468 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.602834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4797  phage integrase  36.98 
 
 		 308 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4048  integrase family protein  35.4 
 
 		 343 aa  197  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.900099 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3686  putative phage integrase  34.74 
 
 		 322 aa  196  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0710  integrase family protein  33.11 
 
 		 324 aa  182  8.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3356  phage integrase family protein  34.17 
 
 		 352 aa  181  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0401  integrase family protein  33.78 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.663201  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4117  integrase family protein  33.44 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.944065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0001  integrase  32.95 
 
 		 265 aa  152  8.999999999999999e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0743  phage integrase family site specific recombinase  38.71 
 
 		 102 aa  82  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0507  tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0296  tyrosine recombinase XerD  27.98 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.672808 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  27.8 
 
 		 291 aa  66.2  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0098  integrase family protein  25.75 
 
 		 298 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0626  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.42 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0142  integrase family protein  22.71 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  27.06 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  24.51 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2512  tyrosine recombinase XerD  29.41 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0533  tyrosine recombinase XerD  27.17 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2735  tyrosine recombinase XerD  29.41 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.206607 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0010  tyrosine recombinase XerC  24.32 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  28.11 
 
 		 332 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7575  tyrosine recombinase XerD subunit  27.32 
 
 		 308 aa  62.4  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1196  tyrosine recombinase XerD  27.38 
 
 		 309 aa  62.4  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0670859  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0750  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.83 
 
 		 311 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3700  phage integrase family protein  26.34 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1698  integrase family protein  24.82 
 
 		 314 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1847  integrase family protein  29.63 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0523  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.78 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0726  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.22 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218987  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3398  integrase  25.47 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.292469  normal  0.438437 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4150  integrase family protein  27.71 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  27.98 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  26.22 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1634  integrase family protein  25.9 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3407  integrase family protein  26.67 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07060  site-specific recombinase XerD  28.49 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.273434 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0967  phage integrase family protein  27.92 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0911  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.61 
 
 		 333 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0118  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.61 
 
 		 333 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0393  tyrosine recombinase XerD  26.04 
 
 		 319 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543195  normal  0.555297 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0409  Phage integrase  23.86 
 
 		 317 aa  59.3  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.383536  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0914  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.61 
 
 		 333 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1246  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2504  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.61 
 
 		 329 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0722  phage integrase family protein  27.22 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0599364 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0669  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.61 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0369  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.61 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1067  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.61 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  22.7 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1201  phage integrase  29.59 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0529826  normal  0.150621 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0530  tyrosine recombinase XerD  26.04 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.931339  normal  0.0955198 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0447  tyrosine recombinase XerC  24.54 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  21.77 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2478  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.61 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0183983 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0737  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.61 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.088128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  24.4 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0590  tyrosine recombinase XerD  27.03 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2583  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.92 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  24.54 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1948  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.92 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2559  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.92 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  27.44 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0393  tyrosine recombinase XerC  24.51 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  25.75 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0738  integrase/recombinase  24.07 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2607  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.61 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  24.07 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1360  integrase/recombinase  24.16 
 
 		 306 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6099899999999998e-31 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5891  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.93 
 
 		 316 aa  57  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2147  phage integrase  23.49 
 
 		 411 aa  57  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3532  phage integrase  23.49 
 
 		 411 aa  57  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.346968  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  20.83 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2172  tyrosine recombinase XerD  29.38 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0616277  normal  0.178894 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1146  tyrosine recombinase XerD  26.99 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0677  integrase family protein  27.81 
 
 		 291 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.92563 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0380  tyrosine recombinase XerC  24.07 
 
 		 304 aa  56.2  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  26.22 
 
 		 332 aa  56.6  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  23.2 
 
 		 299 aa  56.2  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0488  tyrosine recombinase XerD  26.04 
 
 		 319 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  25.31 
 
 		 299 aa  56.2  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  23.67 
 
 		 300 aa  56.2  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  26.88 
 
 		 304 aa  56.6  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  25.48 
 
 		 303 aa  56.2  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0394  tyrosine recombinase XerC  23.62 
 
 		 299 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3631  tyrosine recombinase XerC  23.62 
 
 		 299 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  24.39 
 
 		 307 aa  56.2  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  25.58 
 
 		 328 aa  56.2  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0393  tyrosine recombinase XerC  23.62 
 
 		 299 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  25.9 
 
 		 373 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  20.79 
 
 		 309 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2544  tyrosine recombinase XerC  23.93 
 
 		 318 aa  55.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774585  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1915  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.32 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  hitchhiker  0.00138491 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  23.53 
 
 		 302 aa  55.5  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1547  phage integrase family protein  25.75 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.268843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>