94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3132 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3132  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 458 aa  894    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415164  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2913  polysaccharide biosynthesis protein  80.57 
 
 		 458 aa  724    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.953336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2723  polysaccharide biosynthesis protein  96.94 
 
 		 458 aa  794    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180264  normal  0.985794 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2583  polysaccharide biosynthesis protein  99.13 
 
 		 458 aa  888    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0998  hypothetical protein  35.71 
 
 		 455 aa  265  8.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238749  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2965  polysaccharide biosynthesis protein  38.28 
 
 		 500 aa  236  7e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2873  polysaccharide biosynthesis protein  38.57 
 
 		 500 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354363  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  34.46 
 
 		 448 aa  210  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2408  polysaccharide biosynthesis protein  35 
 
 		 471 aa  197  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0847  polysaccharide biosynthesis protein  35.1 
 
 		 457 aa  196  6e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4254  polysaccharide biosynthesis protein  31.05 
 
 		 465 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.16434 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2377  polysaccharide biosynthesis protein  29.05 
 
 		 446 aa  92.8  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.992066 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 502 aa  87.4  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  22.68 
 
 		 492 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  26.94 
 
 		 508 aa  81.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  26.8 
 
 		 489 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  26.63 
 
 		 503 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  22.56 
 
 		 487 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  24.93 
 
 		 486 aa  70.9  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4554  polysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 		 471 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  26.11 
 
 		 501 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  22.47 
 
 		 490 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  21.26 
 
 		 483 aa  64.7  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2459  polysaccharide biosynthesis protein  26.6 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  23.68 
 
 		 493 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2007  polysaccharide biosynthesis protein  25.56 
 
 		 442 aa  63.9  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0855349 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  25.24 
 
 		 501 aa  63.9  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  24.75 
 
 		 500 aa  63.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0846  polysaccharide biosynthesis protein  20.79 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  hitchhiker  0.00594876 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  24.16 
 
 		 503 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  25.48 
 
 		 501 aa  61.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  23.18 
 
 		 500 aa  60.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1083  PST family polysaccharide exporter  26.32 
 
 		 467 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3839  polysaccharide biosynthesis protein  24.31 
 
 		 507 aa  60.1  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  22.16 
 
 		 487 aa  60.1  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  24.29 
 
 		 510 aa  59.7  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0382  polysaccharide biosynthesis protein  22.38 
 
 		 467 aa  59.7  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.399639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1190  polysaccharide biosynthesis protein  25.74 
 
 		 490 aa  59.3  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  23.89 
 
 		 497 aa  58.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  24.06 
 
 		 510 aa  58.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  23.26 
 
 		 507 aa  58.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  25.41 
 
 		 487 aa  58.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  24.93 
 
 		 488 aa  57.8  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3770  polysaccharide biosynthesis protein  23.92 
 
 		 497 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3400  polysaccharide biosynthesis protein  22.11 
 
 		 493 aa  57.4  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46143  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  21.84 
 
 		 483 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1061  membrane protein  26.2 
 
 		 512 aa  55.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  24.77 
 
 		 509 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  25.71 
 
 		 484 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  21.45 
 
 		 476 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3680  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 515 aa  53.5  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5889  polysaccharide biosynthesis protein  23.73 
 
 		 493 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2706  polysaccharide biosynthesis protein  25.18 
 
 		 510 aa  53.5  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.513472 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  25.26 
 
 		 498 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2414  polysaccharide biosynthesis protein  22.92 
 
 		 492 aa  53.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1426  polysaccharide biosynthesis protein  23.92 
 
 		 455 aa  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4129  polysaccharide biosynthesis protein  26.86 
 
 		 477 aa  52  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  22.1 
 
 		 477 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 		 494 aa  52  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2587  polysaccharide biosynthesis protein  24.46 
 
 		 508 aa  51.2  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  23.31 
 
 		 493 aa  51.2  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3346  polysaccharide biosynthesis protein  23.55 
 
 		 472 aa  51.2  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176331  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  25.83 
 
 		 508 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0730  putative polysaccharide transport protein  24.35 
 
 		 505 aa  50.4  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 		 503 aa  50.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 		 475 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  25.52 
 
 		 509 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  20.59 
 
 		 479 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 		 480 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2888  polysaccharide biosynthesis protein  29.76 
 
 		 494 aa  47.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0315028 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  22.85 
 
 		 490 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  20.42 
 
 		 479 aa  47.8  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  24.83 
 
 		 497 aa  47  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02464  probable polysaccharide transport protein  22.87 
 
 		 488 aa  46.2  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  25.71 
 
 		 504 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2685  polysaccharide biosynthesis protein  24.05 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.698647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1044  hypothetical protein  23.61 
 
 		 506 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2347  polysaccharide biosynthesis protein  21.37 
 
 		 499 aa  45.8  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3847  PST family polysaccharide export protein  25.29 
 
 		 437 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1083  polysaccharide biosynthesis protein  19.59 
 
 		 484 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.945146  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  25.07 
 
 		 502 aa  45.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  21.14 
 
 		 502 aa  45.1  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1696  polysaccharide biosynthesis protein  22.49 
 
 		 454 aa  45.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.235327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  25.36 
 
 		 504 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3801  polysaccharide biosynthesis export protein-like  21.61 
 
 		 420 aa  44.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01297  Polysaccharide biosynthesis protein  24.63 
 
 		 483 aa  44.3  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.833887  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1890  polysaccharide biosynthesis protein  26.15 
 
 		 507 aa  44.3  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2949  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 		 455 aa  43.9  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.484076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4055  polysaccharide biosynthesis protein  24.64 
 
 		 469 aa  43.9  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  28.44 
 
 		 429 aa  43.9  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  22.16 
 
 		 444 aa  43.9  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2629  polysaccharide biosynthesis protein  29.55 
 
 		 504 aa  43.5  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  23.5 
 
 		 451 aa  43.1  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>