55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3801 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3801  polysaccharide biosynthesis export protein-like  100 
 
 		 420 aa  837    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3244  polysaccharide biosynthesis protein  35.78 
 
 		 421 aa  283  5.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0109073  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2685  polysaccharide biosynthesis protein  36.57 
 
 		 424 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.698647 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  29.46 
 
 		 423 aa  178  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0846  polysaccharide biosynthesis protein  29.29 
 
 		 421 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  hitchhiker  0.00594876 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2949  polysaccharide biosynthesis protein  27.73 
 
 		 455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.484076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1426  polysaccharide biosynthesis protein  25.38 
 
 		 455 aa  110  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1696  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 		 454 aa  110  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.235327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2007  polysaccharide biosynthesis protein  24.28 
 
 		 442 aa  104  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0855349 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01297  Polysaccharide biosynthesis protein  22.09 
 
 		 483 aa  70.9  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.833887  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  22.25 
 
 		 448 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 		 486 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  22.71 
 
 		 483 aa  63.5  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2408  polysaccharide biosynthesis protein  23.77 
 
 		 471 aa  57  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  21.1 
 
 		 487 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  23.3 
 
 		 488 aa  57  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1942  polysaccharide biosynthesis protein  23.95 
 
 		 491 aa  55.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  22.71 
 
 		 484 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  25.56 
 
 		 484 aa  53.1  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4254  polysaccharide biosynthesis protein  21.35 
 
 		 465 aa  52.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.16434 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2414  polysaccharide biosynthesis protein  25.45 
 
 		 492 aa  52.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  22.22 
 
 		 493 aa  50.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  20.6 
 
 		 476 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  20.35 
 
 		 492 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  24.23 
 
 		 489 aa  49.7  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  20.35 
 
 		 492 aa  49.3  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  20.35 
 
 		 492 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  22.59 
 
 		 494 aa  49.7  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2965  polysaccharide biosynthesis protein  24.64 
 
 		 500 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  20.06 
 
 		 492 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  20.35 
 
 		 492 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  19.53 
 
 		 492 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  25.31 
 
 		 490 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  22.19 
 
 		 502 aa  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  24.71 
 
 		 488 aa  47.8  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  20.7 
 
 		 510 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2873  polysaccharide biosynthesis protein  23.77 
 
 		 500 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354363  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  20.7 
 
 		 510 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  20.7 
 
 		 510 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  20.7 
 
 		 503 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  20.7 
 
 		 510 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  19.82 
 
 		 492 aa  47  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  19.82 
 
 		 492 aa  47  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  18.26 
 
 		 479 aa  47  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  23.08 
 
 		 492 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  19.89 
 
 		 502 aa  45.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 		 507 aa  44.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  25.31 
 
 		 503 aa  44.3  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1187  polysaccharide biosynthesis protein  18.18 
 
 		 488 aa  43.9  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  20 
 
 		 474 aa  43.9  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  23.2 
 
 		 509 aa  43.9  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  20 
 
 		 475 aa  43.9  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  23.74 
 
 		 508 aa  43.5  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  20.45 
 
 		 490 aa  43.5  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  19.83 
 
 		 492 aa  43.1  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>