44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3244 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3244  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 421 aa  846    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0109073  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3801  polysaccharide biosynthesis export protein-like  38.06 
 
 		 420 aa  281  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  30.12 
 
 		 423 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0846  polysaccharide biosynthesis protein  29.19 
 
 		 421 aa  147  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  hitchhiker  0.00594876 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2685  polysaccharide biosynthesis protein  28.36 
 
 		 424 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.698647 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2007  polysaccharide biosynthesis protein  24.58 
 
 		 442 aa  99  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0855349 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1696  polysaccharide biosynthesis protein  26.39 
 
 		 454 aa  91.7  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.235327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2949  polysaccharide biosynthesis protein  27.95 
 
 		 455 aa  87.4  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.484076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1426  polysaccharide biosynthesis protein  26.22 
 
 		 455 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.62 
 
 		 476 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  26.61 
 
 		 483 aa  55.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01297  Polysaccharide biosynthesis protein  23.81 
 
 		 483 aa  56.2  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.833887  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1942  polysaccharide biosynthesis protein  23.55 
 
 		 491 aa  54.3  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1187  polysaccharide biosynthesis protein  23.42 
 
 		 488 aa  53.5  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  22.39 
 
 		 492 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5180  polysaccharide biosynthesis protein  22.6 
 
 		 467 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  23.94 
 
 		 508 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  23.21 
 
 		 503 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  23.21 
 
 		 510 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  23.21 
 
 		 510 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  23.21 
 
 		 510 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  23.21 
 
 		 510 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  21.99 
 
 		 492 aa  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  22.92 
 
 		 509 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  21.88 
 
 		 486 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  22.39 
 
 		 492 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 		 492 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  22.09 
 
 		 492 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  21.83 
 
 		 483 aa  51.2  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  21.74 
 
 		 492 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  21.74 
 
 		 492 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  22.39 
 
 		 492 aa  50.4  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  20.65 
 
 		 448 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  22.38 
 
 		 487 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2408  polysaccharide biosynthesis protein  23.27 
 
 		 471 aa  48.5  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  23.1 
 
 		 493 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  20 
 
 		 492 aa  47.4  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0777  polysaccharide biosynthesis protein  19.16 
 
 		 504 aa  47.8  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  23.97 
 
 		 488 aa  47  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  21.3 
 
 		 489 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  23.15 
 
 		 494 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  23.33 
 
 		 497 aa  45.8  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3400  polysaccharide biosynthesis protein  21.63 
 
 		 493 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46143  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 		 502 aa  43.1  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>