More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_75017 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  79.78 
 
 		 443 aa  734    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29121  predicted protein  74.59 
 
 		 429 aa  656    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.429141  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  73.35 
 
 		 450 aa  682    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  100 
 
 		 446 aa  914    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564069 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28219  predicted protein  72.52 
 
 		 447 aa  653    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  44.76 
 
 		 404 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  51.4 
 
 		 389 aa  336  5e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  52.01 
 
 		 407 aa  333  3e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  45.03 
 
 		 407 aa  333  5e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  45.61 
 
 		 412 aa  332  6e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  43.25 
 
 		 436 aa  332  7.000000000000001e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  49.22 
 
 		 407 aa  331  2e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  48.91 
 
 		 407 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  48.91 
 
 		 407 aa  327  3e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  46.06 
 
 		 400 aa  326  5e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  50.48 
 
 		 402 aa  324  2e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  45.53 
 
 		 394 aa  323  4e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  43.71 
 
 		 431 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  48.62 
 
 		 422 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.592005 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  46.2 
 
 		 393 aa  320  3.9999999999999996e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  47.04 
 
 		 421 aa  320  3.9999999999999996e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  46.89 
 
 		 412 aa  319  6e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  46.88 
 
 		 405 aa  318  1e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  50.68 
 
 		 393 aa  317  2e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  53.82 
 
 		 398 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30617  predicted protein  42.74 
 
 		 443 aa  311  1e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.580577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  47.52 
 
 		 405 aa  310  2e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30067  predicted protein  51.94 
 
 		 403 aa  309  5.9999999999999995e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  45.94 
 
 		 412 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  54.14 
 
 		 284 aa  308  2.0000000000000002e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  43.15 
 
 		 438 aa  305  7e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  44.86 
 
 		 408 aa  306  7e-82  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  42.66 
 
 		 426 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  50 
 
 		 403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  48.97 
 
 		 404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  46.37 
 
 		 416 aa  303  4.0000000000000003e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  49.82 
 
 		 410 aa  299  8e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02213  proteasome regulatory particle subunit Rpt2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07050)  43.21 
 
 		 460 aa  296  4e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0288941 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  46.86 
 
 		 390 aa  296  4e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  48.76 
 
 		 410 aa  296  7e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  53.28 
 
 		 389 aa  295  1e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  49.3 
 
 		 407 aa  294  2e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  47.97 
 
 		 379 aa  294  3e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54032  26S protease regulatory subunit 4 homolog (TAT-binding homolog 5)  41.19 
 
 		 434 aa  293  4e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0833723 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  46.62 
 
 		 387 aa  293  4e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  50.76 
 
 		 405 aa  293  6e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52887  26S proteasome regulatory subunit  47.64 
 
 		 427 aa  291  1e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  50.77 
 
 		 386 aa  290  3e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  49.12 
 
 		 389 aa  290  3e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  44.82 
 
 		 465 aa  290  4e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  48.94 
 
 		 405 aa  290  5.0000000000000004e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  48.59 
 
 		 413 aa  289  8e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9090  predicted protein  37.64 
 
 		 431 aa  288  1e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  47.8 
 
 		 406 aa  287  2.9999999999999996e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  51.24 
 
 		 414 aa  286  4e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  47.72 
 
 		 407 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  46.92 
 
 		 429 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  45.2 
 
 		 464 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1266  proteasome-activating nucleotidase  49.1 
 
 		 404 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  47.14 
 
 		 425 aa  282  8.000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  49.62 
 
 		 415 aa  281  2e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  49.63 
 
 		 417 aa  280  3e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  43.55 
 
 		 422 aa  275  1.0000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  41.93 
 
 		 410 aa  270  5e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  47.6 
 
 		 739 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.78 
 
 		 732 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.22 
 
 		 768 aa  232  1e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  44.53 
 
 		 641 aa  232  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.22 
 
 		 769 aa  231  2e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0518  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.28 
 
 		 636 aa  231  2e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000475149  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.18 
 
 		 610 aa  231  2e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.36 
 
 		 639 aa  231  2e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.77 
 
 		 610 aa  230  3e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  43.75 
 
 		 681 aa  230  4e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.05 
 
 		 684 aa  229  9e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1770  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.8 
 
 		 651 aa  228  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.292571  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.14 
 
 		 650 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.19 
 
 		 738 aa  226  6e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  42.02 
 
 		 639 aa  226  6e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0538  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.36 
 
 		 659 aa  226  7e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673684  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0801  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.14 
 
 		 651 aa  226  8e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000253513  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  43.36 
 
 		 643 aa  225  9e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3352  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.14 
 
 		 654 aa  226  9e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000888182  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0085  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.58 
 
 		 619 aa  225  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0128077  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.45 
 
 		 630 aa  225  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.89 
 
 		 614 aa  225  1e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.14 
 
 		 602 aa  225  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  43.36 
 
 		 640 aa  225  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3555  ATP-dependent metalloprotease  43.75 
 
 		 647 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00594001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  43.75 
 
 		 647 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  43.75 
 
 		 647 aa  224  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  43.75 
 
 		 644 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.58 
 
 		 672 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0566  ATP-dependent metalloprotease  43.75 
 
 		 649 aa  224  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000344177  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3592  ATP-dependent metalloprotease  43.75 
 
 		 647 aa  224  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000114537  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.68 
 
 		 620 aa  224  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  43.75 
 
 		 644 aa  224  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.97 
 
 		 615 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  43.75 
 
 		 647 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000163816  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  43.75 
 
 		 647 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>