More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43657 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43657  predicted protein  100 
 
 
425 aa  858    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_3334  Oxa1 family transporter: 60 KD inner membrane protein OxaA-like protein  48.75 
 
 
271 aa  242  7.999999999999999e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.890029  normal  0.0824042 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46411  predicted protein  39.66 
 
 
467 aa  214  1.9999999999999998e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_3329  Oxa1 family transporter: 60 KD inner membrane protein OxaA-like protein  38.37 
 
 
264 aa  187  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0596791  normal  0.543331 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.79 
 
 
531 aa  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.2 
 
 
518 aa  144  3e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.5 
 
 
575 aa  140  6e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.32 
 
 
554 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.32 
 
 
554 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  31.47 
 
 
553 aa  139  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  32.77 
 
 
330 aa  138  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.67 
 
 
553 aa  137  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  36.92 
 
 
223 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  33.47 
 
 
547 aa  137  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.22 
 
 
517 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.49 
 
 
532 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.29 
 
 
555 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  33.2 
 
 
556 aa  134  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  31.76 
 
 
345 aa  133  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.65 
 
 
555 aa  133  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.26 
 
 
581 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.45 
 
 
555 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.45 
 
 
554 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.85 
 
 
552 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4312  60 kDa inner membrane insertion protein  32.69 
 
 
543 aa  130  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.301696  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.45 
 
 
554 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.85 
 
 
552 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0524  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.51 
 
 
536 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2235  60 kDa inner membrane insertion protein  32.89 
 
 
300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.971455  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.45 
 
 
553 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.27 
 
 
560 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.45 
 
 
553 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.2 
 
 
567 aa  130  7.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.45 
 
 
552 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.45 
 
 
552 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.27 
 
 
560 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  30.77 
 
 
532 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0354  60 kDa inner membrane insertion protein  28.92 
 
 
589 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.265544  normal  0.0945801 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.87 
 
 
560 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.87 
 
 
560 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.57 
 
 
578 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.15 
 
 
557 aa  128  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  32.2 
 
 
557 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.03 
 
 
584 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.17 
 
 
550 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  30.68 
 
 
537 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.38 
 
 
541 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.36 
 
 
558 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.36 
 
 
558 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.36 
 
 
558 aa  127  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.36 
 
 
558 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.36 
 
 
558 aa  127  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  30.86 
 
 
542 aa  127  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.36 
 
 
558 aa  127  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.77 
 
 
557 aa  127  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.36 
 
 
558 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.57 
 
 
578 aa  127  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  29.08 
 
 
540 aa  126  6e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2600  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  32.94 
 
 
567 aa  126  6e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.417089 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3326  60 kDa inner membrane insertion protein  31.84 
 
 
229 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010032  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.1 
 
 
526 aa  126  9e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  31.47 
 
 
562 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.47 
 
 
563 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.23 
 
 
595 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.68 
 
 
541 aa  125  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  30.62 
 
 
548 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.33 
 
 
541 aa  124  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.47 
 
 
540 aa  124  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  30.67 
 
 
536 aa  124  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.2 
 
 
600 aa  124  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  29.88 
 
 
536 aa  124  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  33.06 
 
 
542 aa  124  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  30.95 
 
 
614 aa  124  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  30.28 
 
 
562 aa  123  5e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.74 
 
 
610 aa  123  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.74 
 
 
610 aa  123  6e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.47 
 
 
560 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.8 
 
 
607 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2197  60 kDa inner membrane insertion protein  33.2 
 
 
551 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.297594  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1254  60 kDa inner membrane insertion protein  28.63 
 
 
628 aa  121  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000727923  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  31.22 
 
 
539 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  27.38 
 
 
566 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.34 
 
 
528 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  31.4 
 
 
609 aa  121  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.34 
 
 
530 aa  121  3e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1196  60 kDa inner membrane insertion protein  25.88 
 
 
313 aa  121  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000975332  decreased coverage  0.000283466 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.49 
 
 
530 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  30.61 
 
 
542 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3542  YidC translocase/secretase  30.4 
 
 
569 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  29.56 
 
 
545 aa  119  7e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3617  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.13 
 
 
577 aa  119  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.320662 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  29.07 
 
 
551 aa  119  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  29.75 
 
 
552 aa  119  7.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0217  protein translocase subunit yidC  28.87 
 
 
583 aa  119  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.498573  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  30.63 
 
 
258 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2396  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.13 
 
 
582 aa  119  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4793  protein translocase subunit yidC  30 
 
 
565 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2521  protein translocase subunit yidC  35.11 
 
 
225 aa  119  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0677656  hitchhiker  0.0000441825 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0455  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.37 
 
 
620 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.6 
 
 
546 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>