More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_3329 on replicon NC_009359
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009359  OSTLU_3329  Oxa1 family transporter: 60 KD inner membrane protein OxaA-like protein  100 
 
 
264 aa  534  1e-151  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0596791  normal  0.543331 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_3334  Oxa1 family transporter: 60 KD inner membrane protein OxaA-like protein  43.48 
 
 
271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.890029  normal  0.0824042 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43657  predicted protein  38.37 
 
 
425 aa  187  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46411  predicted protein  37.65 
 
 
467 aa  169  4e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2235  60 kDa inner membrane insertion protein  36.49 
 
 
300 aa  122  7e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.971455  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3326  60 kDa inner membrane insertion protein  35.24 
 
 
229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010032  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0817  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.72 
 
 
632 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  33.82 
 
 
223 aa  115  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3328  60 kDa inner membrane insertion protein  32.87 
 
 
604 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348306  normal  0.0506937 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3074  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.88 
 
 
614 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.374984  normal  0.974517 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0069  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.56 
 
 
621 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.090165  decreased coverage  0.00200731 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0683  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.02 
 
 
629 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902315  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0705  60 kDa inner membrane insertion protein  30.58 
 
 
268 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00153536  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0376  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.41 
 
 
609 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388979  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  32.88 
 
 
532 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  34.23 
 
 
548 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3703  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.96 
 
 
609 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.45 
 
 
541 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.49 
 
 
517 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  29.72 
 
 
609 aa  109  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1201  60 kDa inner membrane insertion protein  31.94 
 
 
600 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00276614 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  30.64 
 
 
539 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  32.57 
 
 
547 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.42 
 
 
607 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  34.63 
 
 
536 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4982  60 kDa inner membrane insertion protein  29.77 
 
 
351 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.91 
 
 
541 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.49 
 
 
541 aa  106  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.88 
 
 
531 aa  105  6e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.54 
 
 
518 aa  105  8e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.88 
 
 
597 aa  105  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0455  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.96 
 
 
620 aa  105  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  30.47 
 
 
330 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  30.77 
 
 
553 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2760  60 kDa inner membrane insertion protein  29.69 
 
 
341 aa  103  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644122  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  29.95 
 
 
542 aa  103  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0524  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.88 
 
 
536 aa  103  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2761  60 kDa inner membrane insertion protein  30.84 
 
 
607 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00156277  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.64 
 
 
540 aa  103  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1921  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.41 
 
 
616 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.010841  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  30.24 
 
 
540 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4135  60 kDa inner membrane insertion protein  29.77 
 
 
219 aa  103  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251596  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  34.1 
 
 
559 aa  103  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0095  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.41 
 
 
597 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.05 
 
 
610 aa  102  9e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2630  YidC translocase/secretase  29.49 
 
 
616 aa  102  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  0.0394817 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.05 
 
 
610 aa  101  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4889  OxaA-like protein precursor  28.64 
 
 
260 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4731  OxaA-like protein precursor  28.64 
 
 
260 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.569831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4746  OxaA-like protein precursor  28.64 
 
 
260 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  30.47 
 
 
345 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2351  60 kDa inner membrane insertion protein  29.49 
 
 
616 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0911692 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5263  OxaA-like protein precursor  28.64 
 
 
260 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0782  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.44 
 
 
579 aa  101  1e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5131  OxaA-like protein precursor  28.64 
 
 
260 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3503  60 kDa inner membrane insertion protein  29.63 
 
 
617 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0094107 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  31.06 
 
 
566 aa  101  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  26.36 
 
 
255 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  26.82 
 
 
258 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  27.78 
 
 
614 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2141  60 kDa inner membrane insertion protein  33.01 
 
 
601 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5176  OxaA-like protein precursor  28.64 
 
 
260 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3431  OxaA-like protein precursor  26.98 
 
 
256 aa  99.8  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000222653  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4312  60 kDa inner membrane insertion protein  30.35 
 
 
543 aa  99.8  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.301696  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  32.38 
 
 
542 aa  99.8  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  30.73 
 
 
544 aa  99.4  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000135714  unclonable  0.000000000155498 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7326  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.66 
 
 
621 aa  99.4  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0080  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.41 
 
 
597 aa  99.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0122237  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3610  OxaA-like protein precursor  28.9 
 
 
257 aa  99.4  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0636  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.26 
 
 
622 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9053  60 kDa inner membrane insertion protein  28.69 
 
 
328 aa  99.4  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.514683 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5161  OxaA-like protein precursor  28.18 
 
 
260 aa  99  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5081  60 kDa inner membrane insertion protein  29.77 
 
 
624 aa  99  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373544  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  27.27 
 
 
255 aa  99  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4848  OxaA-like protein precursor  28.18 
 
 
260 aa  99  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08476  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.04 
 
 
622 aa  99  8e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.13 
 
 
554 aa  98.6  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  29.82 
 
 
544 aa  98.6  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0082  OxaA-like protein precursor  28.18 
 
 
260 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27010  preprotein translocase subunit YidC  30.19 
 
 
350 aa  98.6  9e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5166  OxaA-like protein precursor  28.18 
 
 
260 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.13 
 
 
554 aa  98.6  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.64 
 
 
553 aa  98.6  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.66 
 
 
530 aa  98.6  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  27.91 
 
 
255 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  27.91 
 
 
255 aa  98.6  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  27.91 
 
 
255 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  27.91 
 
 
255 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  27.91 
 
 
255 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.66 
 
 
530 aa  98.2  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.66 
 
 
528 aa  98.2  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  26.91 
 
 
255 aa  98.2  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3121  60 kDa inner membrane insertion protein  30.61 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000331776  hitchhiker  0.0000000745371 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3157  60 kDa inner membrane insertion protein  32.99 
 
 
534 aa  97.1  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.199862  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5377  YidC translocase/secretase  28.04 
 
 
605 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  30.28 
 
 
545 aa  97.1  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.71 
 
 
555 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0293  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.5 
 
 
579 aa  96.7  3e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.56 
 
 
595 aa  96.7  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.51 
 
 
546 aa  96.7  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>