More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0876 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0876  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 518 aa  1055    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2707  tRNA modification GTPase TrmE  47.97 
 
 		 466 aa  438  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622975  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12578  putative tRNA modification GTPase  47.77 
 
 		 469 aa  431  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1430  tRNA modification GTPase TrmE  47.53 
 
 		 461 aa  422  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1904  tRNA modification GTPase TrmE  45.94 
 
 		 472 aa  402  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  44.18 
 
 		 460 aa  394  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0089  tRNA modification GTPase TrmE  46.15 
 
 		 455 aa  392  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  47.46 
 
 		 458 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1201  hypothetical protein  44.4 
 
 		 455 aa  363  3e-99  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128445 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2316  tRNA modification GTPase TrmE  44.42 
 
 		 456 aa  361  2e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.64098  normal  0.135497 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  41.21 
 
 		 473 aa  346  7e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0217  tRNA modification GTPase TrmE  40.17 
 
 		 476 aa  345  1e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0500389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0153  tRNA modification GTPase TrmE  43.5 
 
 		 475 aa  342  9e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2025  tRNA modification GTPase TrmE  42.49 
 
 		 473 aa  342  1e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  43.5 
 
 		 458 aa  341  2e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  43.5 
 
 		 458 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0100  tRNA modification GTPase TrmE  41.35 
 
 		 473 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.651435  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2373  tRNA modification GTPase TrmE  41.06 
 
 		 473 aa  323  5e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2760  tRNA modification GTPase TrmE  43.79 
 
 		 462 aa  320  5e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.4484  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  38.03 
 
 		 458 aa  319  7e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2779  tRNA modification GTPase TrmE  39.54 
 
 		 473 aa  318  1e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  38.27 
 
 		 459 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  38.2 
 
 		 458 aa  313  4.999999999999999e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  38.81 
 
 		 460 aa  312  9e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0097  tRNA modification GTPase TrmE  37.9 
 
 		 455 aa  311  2.9999999999999997e-83  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  36.63 
 
 		 463 aa  310  4e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  36.9 
 
 		 456 aa  310  4e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  39.92 
 
 		 462 aa  305  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  38.4 
 
 		 458 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  38.16 
 
 		 455 aa  304  2.0000000000000002e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  38.32 
 
 		 455 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  37.55 
 
 		 450 aa  302  1e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  38.22 
 
 		 461 aa  302  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  37.39 
 
 		 458 aa  301  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  36.85 
 
 		 458 aa  301  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  37 
 
 		 464 aa  301  2e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  35.38 
 
 		 462 aa  298  1e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  37.31 
 
 		 461 aa  298  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  37.55 
 
 		 450 aa  298  2e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  36.76 
 
 		 458 aa  298  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  36.65 
 
 		 458 aa  296  4e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  39.61 
 
 		 454 aa  296  8e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  36.86 
 
 		 455 aa  296  8e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  37.01 
 
 		 458 aa  295  9e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  37.01 
 
 		 458 aa  295  9e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  37.01 
 
 		 458 aa  295  9e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  37.01 
 
 		 458 aa  295  9e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  36.92 
 
 		 458 aa  295  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  37.01 
 
 		 458 aa  295  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  38.56 
 
 		 456 aa  295  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  36.92 
 
 		 458 aa  295  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  35.59 
 
 		 455 aa  293  5e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  37.88 
 
 		 461 aa  293  5e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  37 
 
 		 460 aa  292  8e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  37.76 
 
 		 455 aa  291  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  34.59 
 
 		 461 aa  292  1e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  37.95 
 
 		 454 aa  291  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5742  tRNA modification GTPase TrmE  37.15 
 
 		 456 aa  286  9e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  38.22 
 
 		 447 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  40.89 
 
 		 461 aa  283  5.000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  35.53 
 
 		 459 aa  283  8.000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  37.03 
 
 		 465 aa  281  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1733  tRNA modification GTPase TrmE  35.04 
 
 		 452 aa  281  2e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000059641  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4089  tRNA modification GTPase TrmE  39.92 
 
 		 448 aa  281  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5611  tRNA modification GTPase TrmE  37.61 
 
 		 456 aa  281  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  36.15 
 
 		 463 aa  281  3e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  37.5 
 
 		 457 aa  280  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  36.21 
 
 		 459 aa  279  8e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5133  tRNA modification GTPase TrmE  36.97 
 
 		 456 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  35.54 
 
 		 461 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0070  tRNA modification GTPase TrmE  34.82 
 
 		 444 aa  277  3e-73  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.868206  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  36.92 
 
 		 460 aa  277  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3315  tRNA modification GTPase TrmE  37.37 
 
 		 458 aa  276  8e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2572  GTPase  39.15 
 
 		 459 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.329632  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3161  tRNA modification GTPase TrmE  38.72 
 
 		 471 aa  274  3e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.258894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  37.12 
 
 		 455 aa  274  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4200  tRNA modification GTPase TrmE  37.71 
 
 		 448 aa  273  5.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0153583 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  35.53 
 
 		 459 aa  273  5.000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  35.53 
 
 		 459 aa  273  5.000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04098  tRNA modification GTPase  36.55 
 
 		 462 aa  273  6e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  35.94 
 
 		 460 aa  273  6e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3622  tRNA modification GTPase TrmE  38.27 
 
 		 456 aa  273  6e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  37.02 
 
 		 475 aa  273  7e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0526  tRNA modification GTPase TrmE  36.69 
 
 		 446 aa  273  7e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  35.94 
 
 		 460 aa  273  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  35.7 
 
 		 458 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2889  tRNA modification GTPase TrmE  37.79 
 
 		 464 aa  272  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  38.05 
 
 		 456 aa  271  2e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  35.31 
 
 		 452 aa  271  2e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5443  tRNA modification GTPase TrmE  36.32 
 
 		 456 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  37.26 
 
 		 455 aa  270  4e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4013  tRNA modification GTPase TrmE  36.67 
 
 		 456 aa  270  5e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.205295  normal  0.289015 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  35.5 
 
 		 462 aa  268  1e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6368  tRNA modification GTPase TrmE  37.61 
 
 		 455 aa  269  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  35.12 
 
 		 467 aa  268  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1734  tRNA modification GTPase TrmE  36.54 
 
 		 437 aa  267  2.9999999999999995e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4260  tRNA modification GTPase TrmE  37.5 
 
 		 454 aa  266  5e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3073  tRNA modification GTPase TrmE  36.25 
 
 		 446 aa  266  5e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4288  tRNA modification GTPase TrmE  37.5 
 
 		 454 aa  266  5e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52440  tRNA modification GTPase TrmE  36.9 
 
 		 455 aa  266  5e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>