More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_33080 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_33080  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  675    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000208318  hitchhiker  0.00231515 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2814  hypothetical protein  96.47 
 
 		 339 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5669  Band 7 protein  83.11 
 
 		 348 aa  509  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324788 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5083  Band 7 protein  80.98 
 
 		 345 aa  477  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5534  SPFH domain / Band 7 family protein  81.88 
 
 		 345 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7190  membrane protease  69.86 
 
 		 367 aa  408  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.996167  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  33.22 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  32.99 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  31.96 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  30 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4126  HflC protein  30.18 
 
 		 320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0703  HflC protein  29.12 
 
 		 281 aa  121  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  30.3 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  30.11 
 
 		 311 aa  119  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2727  HflC protein  30.17 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772067  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2348  hypothetical protein  30.56 
 
 		 298 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  30.27 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  30.34 
 
 		 282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3523  HflC protein  31.05 
 
 		 313 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  29.02 
 
 		 283 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  28.74 
 
 		 283 aa  107  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0867  HflC protein  29 
 
 		 282 aa  105  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00264104  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  30.14 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  25.75 
 
 		 293 aa  103  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  24.75 
 
 		 288 aa  102  9e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  25.25 
 
 		 294 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  26.33 
 
 		 295 aa  102  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3022  hflC protein  27.81 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000029647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3679  HflC protein  29.12 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  27.68 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3614  HflC protein  28.33 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002262  HflC protein  27.74 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00114995  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  28.52 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  29.07 
 
 		 290 aa  100  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0666  HflC protein  26.13 
 
 		 289 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0002  HflC protein  27.97 
 
 		 281 aa  99.8  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2299  HflC protein  27.15 
 
 		 299 aa  99  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783703  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2797  HflC protein  28.88 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3345  HflC protein  27.34 
 
 		 281 aa  97.4  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3821  band 7 protein  25.26 
 
 		 301 aa  97.1  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.153561  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  28.96 
 
 		 302 aa  97.1  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  24.19 
 
 		 297 aa  97.8  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  26.72 
 
 		 284 aa  95.9  8e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  25.6 
 
 		 292 aa  95.9  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  24.59 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1178  HflC protein  25.94 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1731  HflC protein  30.15 
 
 		 295 aa  94.7  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000316611 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  25.51 
 
 		 292 aa  94.7  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2761  hflC protein  26.1 
 
 		 326 aa  93.6  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0386111  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  25.99 
 
 		 292 aa  93.6  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  25.91 
 
 		 292 aa  93.2  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0314  hflC protein, putative  27.74 
 
 		 320 aa  91.7  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  24.19 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  24.19 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00091  serine protease  26.19 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0165  HflC protein  27.66 
 
 		 286 aa  91.3  2e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225021  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2774  HflC protein  24.91 
 
 		 294 aa  90.9  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3015  HflC protein  27.12 
 
 		 287 aa  90.9  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.698845  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  24.58 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  29.51 
 
 		 293 aa  90.5  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1098  HflC protein  26.97 
 
 		 301 aa  89.7  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  24.68 
 
 		 300 aa  89.7  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  24.64 
 
 		 283 aa  89.4  9e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  24.64 
 
 		 283 aa  89.4  9e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  25.16 
 
 		 297 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  26.96 
 
 		 289 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  25.16 
 
 		 297 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2263  HflC protein  25.08 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00649366  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1955  HflC protein  29.39 
 
 		 294 aa  89  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.905613  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1988  putative serine protease transmembrane protein  24.91 
 
 		 296 aa  89  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0922969  normal  0.083656 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  25.16 
 
 		 297 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  25.16 
 
 		 297 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0072  HflC protein  25.54 
 
 		 302 aa  89  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.055112  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0832  hflC protein  28.22 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.379816  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1721  HflC protein  26.83 
 
 		 287 aa  88.2  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1786  integral membrane proteinase  26.83 
 
 		 287 aa  88.2  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0538  FtsH protease regulator HflC  23.88 
 
 		 331 aa  87.8  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.255691  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1880  HflC protein  27.46 
 
 		 299 aa  87.8  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.476846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  23.95 
 
 		 283 aa  87.4  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2010  HflC protein  29.01 
 
 		 293 aa  87.4  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0721507  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3916  FtsH protease regulator HflC  25.23 
 
 		 331 aa  87.4  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  25.59 
 
 		 295 aa  87  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  27.27 
 
 		 328 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  24.52 
 
 		 297 aa  87  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3385  HflC protein  30.71 
 
 		 306 aa  86.3  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  24.91 
 
 		 290 aa  86.3  6e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  26.34 
 
 		 294 aa  86.7  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  27.65 
 
 		 325 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1432  HflC protein  26.19 
 
 		 299 aa  86.3  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200171  normal  0.890554 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3308  HflC protein  25.89 
 
 		 292 aa  86.3  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2195  HflC protein  28.62 
 
 		 301 aa  85.9  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1887  hflC protein  27.93 
 
 		 290 aa  85.5  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578137  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3718  FtsH protease regulator HflC  25.23 
 
 		 331 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0820553  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  25.17 
 
 		 304 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0356  HflC protein  27.27 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.534146  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0578  FtsH protease regulator HflC  22.19 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2000  HflC protein  27.27 
 
 		 340 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.491743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1562  HflC protein  27.93 
 
 		 290 aa  85.5  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000166482 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0605  HflC protein  25.8 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0249897 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3671  HflC protein  28.83 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150506  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>