More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_10330 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0945  secretion protein  94.53 
 
 		 472 aa  805    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10330  putative outer membrane protein precursor  100 
 
 		 471 aa  927    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.339948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3056  outer membrane efflux protein  50.43 
 
 		 485 aa  426  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111107 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3644  TolC family type I secretion outer membrane protein  43.4 
 
 		 471 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  43.19 
 
 		 482 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  42.55 
 
 		 479 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  42.98 
 
 		 471 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  43.81 
 
 		 479 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  43.81 
 
 		 482 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  43.81 
 
 		 482 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  43.81 
 
 		 479 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6770  outer membrane efflux protein  41.56 
 
 		 488 aa  299  8e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  37.74 
 
 		 452 aa  281  1e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  41.98 
 
 		 462 aa  261  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1955  outer membrane efflux protein  41.18 
 
 		 476 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223795  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  35.63 
 
 		 495 aa  226  9e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03674  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  36.87 
 
 		 488 aa  225  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1021  outer membrane efflux protein  35.01 
 
 		 528 aa  181  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  28.06 
 
 		 738 aa  155  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5005  outer membrane efflux protein  35.92 
 
 		 485 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.844775 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5155  outer membrane efflux protein  34.78 
 
 		 481 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.239334  normal  0.865316 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3265  outer membrane efflux protein  30.07 
 
 		 476 aa  138  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2864  outer membrane efflux protein  30.07 
 
 		 476 aa  138  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1789  outer membrane efflux protein  34.31 
 
 		 493 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1827  outer membrane efflux protein  28.61 
 
 		 496 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.115006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2169  outer membrane toxin secretion efflux protein, putative  28.61 
 
 		 496 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3973  outer membrane efflux protein  28.93 
 
 		 513 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0704049 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5578  outer membrane efflux protein  27.06 
 
 		 514 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0232692  hitchhiker  0.00628536 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1054  outer membrane efflux protein  27.75 
 
 		 514 aa  110  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000452487  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3645  outer membrane efflux protein  27.06 
 
 		 514 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4722  outer membrane efflux protein  27.06 
 
 		 514 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0674524  decreased coverage  0.00195148 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1943  outer membrane efflux protein  33.5 
 
 		 490 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.261377  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1858  outer membrane efflux protein  33.5 
 
 		 490 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.514737  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2191  outer membrane efflux protein  26.26 
 
 		 508 aa  107  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2121  Outer membrane efflux protein  25 
 
 		 509 aa  106  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0193  outer membrane efflux protein  26.62 
 
 		 527 aa  103  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.339929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4579  outer membrane efflux protein  26.82 
 
 		 515 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0188996  decreased coverage  0.000000771093 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0594  outer membrane efflux protein  26.09 
 
 		 508 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4114  outer membrane efflux protein  26.82 
 
 		 519 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865486  normal  0.0282956 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  26.89 
 
 		 424 aa  100  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1063  hypothetical protein  25.98 
 
 		 453 aa  100  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.45317 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0533  outer membrane efflux protein  25.98 
 
 		 453 aa  99.8  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  26.76 
 
 		 419 aa  98.6  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0239  outer membrane efflux protein  26.62 
 
 		 521 aa  99  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.368646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  26.34 
 
 		 419 aa  95.9  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4512  outer membrane efflux protein  24.68 
 
 		 520 aa  95.5  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0572559 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  23.53 
 
 		 427 aa  93.2  8e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  23.75 
 
 		 423 aa  93.2  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  25.89 
 
 		 420 aa  92.8  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2020  outer membrane efflux protein  32.6 
 
 		 492 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  27.97 
 
 		 470 aa  92.4  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  25.91 
 
 		 419 aa  92  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 419 aa  89.7  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  23.29 
 
 		 471 aa  87.8  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0903  outer membrane efflux protein  24.62 
 
 		 436 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.331424  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  23.96 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2321  putative secretion protein  33.24 
 
 		 461 aa  84.7  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  28.71 
 
 		 424 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  29.15 
 
 		 1496 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4354  Outer membrane efflux protein  25.25 
 
 		 517 aa  83.2  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2069  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.58 
 
 		 452 aa  82  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2156  outer membrane export factor  24.82 
 
 		 452 aa  82  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  24.36 
 
 		 441 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.57 
 
 		 452 aa  81.6  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.93 
 
 		 436 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  22.2 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  23.56 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  28.5 
 
 		 445 aa  80.1  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2883  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.15 
 
 		 442 aa  80.1  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  24.45 
 
 		 500 aa  79.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  23.56 
 
 		 494 aa  78.6  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.73 
 
 		 449 aa  79  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3841  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.71 
 
 		 490 aa  79  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626052  normal  0.467321 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.23 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  28.5 
 
 		 440 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  26.47 
 
 		 462 aa  77.8  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2941  outer membrane efflux protein  22.63 
 
 		 436 aa  77.8  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0140963  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3356  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.17 
 
 		 442 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431157  normal  0.886803 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5330  outer membrane efflux protein  24.43 
 
 		 429 aa  77.4  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.757466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3723  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.45 
 
 		 512 aa  77  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 		 523 aa  76.3  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1698  outer membrane efflux protein  23.51 
 
 		 433 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.572085  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  27.25 
 
 		 426 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  26.3 
 
 		 460 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  24.34 
 
 		 435 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  24.34 
 
 		 435 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  27.18 
 
 		 1470 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  24.5 
 
 		 442 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  24.34 
 
 		 435 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4144  alkaline protease secretion protein AprF  26.76 
 
 		 477 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0485622  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2209  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.02 
 
 		 472 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  21.59 
 
 		 497 aa  74.3  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  24.29 
 
 		 489 aa  74.3  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  24.03 
 
 		 467 aa  73.9  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  24.29 
 
 		 489 aa  73.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0527  outer membrane protein OprM precursor  26.42 
 
 		 485 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71666  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  24.29 
 
 		 489 aa  74.3  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3444  outer membrane channel protein  24.29 
 
 		 489 aa  74.3  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  24.29 
 
 		 489 aa  74.3  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  23.16 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>