More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_10111 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_10111  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 305 aa  592  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0871  preprotein translocase subunit SecF  77.48 
 
 		 304 aa  482  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0139488  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09301  preprotein translocase subunit SecF  78.81 
 
 		 304 aa  471  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.359776  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09321  preprotein translocase subunit SecF  77.48 
 
 		 304 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09531  preprotein translocase subunit SecF  43.55 
 
 		 318 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.14982 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0283  preprotein translocase subunit SecF  43.87 
 
 		 321 aa  261  8.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.164559  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1278  preprotein translocase subunit SecF  39.94 
 
 		 328 aa  243  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.630686  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16231  preprotein translocase subunit SecF  42.16 
 
 		 359 aa  239  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.205013 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1192  preprotein translocase subunit SecF  44.36 
 
 		 329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07171  preprotein translocase subunit SecF  43.42 
 
 		 322 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.434985  normal  0.295105 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  38.28 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5129  preprotein translocase subunit SecF  38.67 
 
 		 336 aa  201  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.642857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3211  preprotein translocase subunit SecF  39.63 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  35.02 
 
 		 328 aa  195  9e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  38.36 
 
 		 325 aa  188  8e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4538  protein-export membrane protein SecF  38.33 
 
 		 320 aa  182  6e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0141  preprotein translocase subunit SecF  37.33 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1027  preprotein translocase subunit SecF  37.58 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0198826 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  32.24 
 
 		 735 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  36.58 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  36.67 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0855  preprotein translocase subunit SecF  34.25 
 
 		 302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0014  preprotein translocase subunit SecF  32.46 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246116  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1085  preprotein translocase subunit SecF  31.8 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  35.32 
 
 		 291 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  33.71 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  33.71 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  32.65 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1713  SecF protein  33.21 
 
 		 327 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  31.49 
 
 		 302 aa  139  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1719  preprotein translocase subunit SecF  33.97 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0008  preprotein translocase subunit SecF  30.16 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748405  normal  0.104556 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  30.48 
 
 		 989 aa  135  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.01 
 
 		 991 aa  135  8e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  31.83 
 
 		 315 aa  135  9e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  30.67 
 
 		 323 aa  135  9e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  31.83 
 
 		 315 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2185  protein-export membrane protein SecF  32.12 
 
 		 312 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1454  protein-export membrane protein SecF  33.82 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0298464  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  31.7 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  29.87 
 
 		 761 aa  133  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  28.9 
 
 		 307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  31.09 
 
 		 311 aa  132  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  33.59 
 
 		 305 aa  132  9e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  33.59 
 
 		 305 aa  132  9e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  34.34 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1785  preprotein translocase subunit SecF  31.03 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817769 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0034  preprotein translocase subunit SecF  32.35 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1278  preprotein translocase subunit SecF  32.59 
 
 		 414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000278006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1799  preprotein translocase subunit SecF  30.32 
 
 		 324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  32.34 
 
 		 314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0445  preprotein translocase subunit SecF  30.32 
 
 		 324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0027  preprotein translocase subunit SecF  32.71 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  29.47 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  28.76 
 
 		 977 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  29.32 
 
 		 307 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  33.57 
 
 		 316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0013  preprotein translocase subunit SecF  31.58 
 
 		 309 aa  129  6e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245212 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1107  preprotein translocase subunit SecF  32.22 
 
 		 414 aa  129  6e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0908186  normal  0.232496 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3070  protein-export membrane protein SecF  35.54 
 
 		 302 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0587358  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0012  preprotein translocase subunit SecF  31.72 
 
 		 308 aa  129  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000296376  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  29 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  28.85 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  28.85 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0013  preprotein translocase subunit SecF  32.35 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000001158  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2080  preprotein translocase subunit SecF  31.85 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.348624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4618  preprotein translocase subunit SecF  30.67 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0457  preprotein translocase subunit SecF  30.91 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0172615  normal  0.0827508 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  29.55 
 
 		 357 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0980  preprotein translocase subunit SecF  32.86 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00161117  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  30.74 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  32.35 
 
 		 322 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  30.82 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  31.06 
 
 		 301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  30.26 
 
 		 293 aa  126  5e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  28.98 
 
 		 315 aa  126  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  30.67 
 
 		 323 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  30.67 
 
 		 323 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.08 
 
 		 755 aa  126  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  30.67 
 
 		 323 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  30.67 
 
 		 323 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1115  protein-export membrane protein SecF  32.2 
 
 		 302 aa  125  6e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  30.67 
 
 		 323 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.27 
 
 		 762 aa  125  7e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  32.78 
 
 		 323 aa  125  8.000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  30.49 
 
 		 759 aa  125  8.000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1620  protein-export membrane protein SecF  30.97 
 
 		 323 aa  124  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1792  preprotein translocase subunit SecF  30.74 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105598  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1118  preprotein translocase subunit SecF  34.66 
 
 		 300 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.377111  hitchhiker  0.000000000101209 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3571  protein-export membrane protein SecF  34.23 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00137282  hitchhiker  0.0015659 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3291  preprotein translocase subunit SecF  34.66 
 
 		 300 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  32.08 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.59 
 
 		 750 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3249  preprotein translocase subunit SecF  34.66 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.015855  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2804  preprotein translocase subunit SecF  31.14 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00594045  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0600  protein-export membrane protein SecF  31.62 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0147  protein translocase subunit secF  35.89 
 
 		 404 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000009249  hitchhiker  0.00252765 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2550  preprotein translocase subunit SecF  29.78 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.341971  normal  0.338499 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  29.41 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1898  protein translocase subunit secF  29.71 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.970453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>