More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_09701 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 286 aa  584  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  65.73 
 
 		 286 aa  398  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  64.69 
 
 		 286 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  65.38 
 
 		 286 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  46.95 
 
 		 282 aa  251  7e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  42.6 
 
 		 355 aa  248  7e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  43.68 
 
 		 368 aa  248  1e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  45.32 
 
 		 323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  44.84 
 
 		 279 aa  244  1.9999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  44.72 
 
 		 281 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  44.72 
 
 		 281 aa  242  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  42.96 
 
 		 280 aa  239  2.9999999999999997e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  42.81 
 
 		 407 aa  238  6.999999999999999e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  43.42 
 
 		 281 aa  237  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  47.84 
 
 		 284 aa  236  4e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  45.32 
 
 		 278 aa  235  6e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  43.82 
 
 		 284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  46.57 
 
 		 284 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  42.66 
 
 		 334 aa  229  4e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  43.77 
 
 		 280 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  43.66 
 
 		 284 aa  219  5e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  43.46 
 
 		 284 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  40.55 
 
 		 280 aa  212  4.9999999999999996e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  41.96 
 
 		 277 aa  210  2e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  41.38 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  41.26 
 
 		 277 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  40.91 
 
 		 277 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  41.67 
 
 		 278 aa  206  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  39.1 
 
 		 287 aa  206  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  38.11 
 
 		 280 aa  201  9e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  40.62 
 
 		 276 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  39.16 
 
 		 277 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  43.11 
 
 		 283 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2928  diaminopimelate epimerase  39.79 
 
 		 274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.276892 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2730  diaminopimelate epimerase  38.63 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0948067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  38.11 
 
 		 275 aa  194  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  37.76 
 
 		 275 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  37.76 
 
 		 275 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  37.76 
 
 		 275 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  37.76 
 
 		 275 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  37.76 
 
 		 275 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  37.76 
 
 		 275 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  38.68 
 
 		 304 aa  192  4e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  37.76 
 
 		 275 aa  192  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0182  diaminopimelate epimerase  36.43 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.998768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  39.72 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  39.02 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  39.02 
 
 		 278 aa  191  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  37.06 
 
 		 275 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  38.16 
 
 		 278 aa  189  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  40 
 
 		 299 aa  189  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  38.65 
 
 		 282 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  40.28 
 
 		 274 aa  189  5.999999999999999e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  35.84 
 
 		 290 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  35.27 
 
 		 279 aa  189  5.999999999999999e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  36.62 
 
 		 278 aa  188  7e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  37.1 
 
 		 278 aa  188  7e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  36.4 
 
 		 281 aa  187  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00205  diaminopimelate epimerase  38.85 
 
 		 269 aa  186  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03685  diaminopimelate epimerase  35.71 
 
 		 274 aa  185  7e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.163573  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4170  Diaminopimelate epimerase  35.71 
 
 		 274 aa  185  7e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.837067  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4175  diaminopimelate epimerase  35.71 
 
 		 274 aa  185  7e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4198  diaminopimelate epimerase  35.71 
 
 		 274 aa  185  7e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.180433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4328  diaminopimelate epimerase  35.71 
 
 		 274 aa  185  7e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5248  diaminopimelate epimerase  35.71 
 
 		 274 aa  185  7e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4034  diaminopimelate epimerase  35.71 
 
 		 274 aa  185  7e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03634  hypothetical protein  35.71 
 
 		 274 aa  185  7e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.191697  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  39.45 
 
 		 282 aa  185  9e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  38.25 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  38.33 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  35.11 
 
 		 277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1610  diaminopimelate epimerase  37.86 
 
 		 274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4269  diaminopimelate epimerase  35.71 
 
 		 274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3983  diaminopimelate epimerase  35.71 
 
 		 274 aa  183  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.983346  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  37.63 
 
 		 278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  34.34 
 
 		 292 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4175  diaminopimelate epimerase  35 
 
 		 274 aa  182  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132697  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4275  diaminopimelate epimerase  35 
 
 		 274 aa  182  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4227  diaminopimelate epimerase  35 
 
 		 274 aa  182  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.642483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4157  diaminopimelate epimerase  35 
 
 		 274 aa  182  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4334  diaminopimelate epimerase  35 
 
 		 274 aa  182  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  36.14 
 
 		 308 aa  181  9.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  35.59 
 
 		 276 aa  181  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  38.03 
 
 		 279 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  37.04 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  36.27 
 
 		 279 aa  181  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  34.29 
 
 		 274 aa  181  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 299 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  38.23 
 
 		 288 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00309  diaminopimelate epimerase  36.3 
 
 		 276 aa  180  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  37.88 
 
 		 288 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3228  diaminopimelate epimerase  36.79 
 
 		 282 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0035809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  34.97 
 
 		 288 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  36.2 
 
 		 277 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4011  diaminopimelate epimerase  36.43 
 
 		 274 aa  179  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0205  diaminopimelate epimerase  36.43 
 
 		 274 aa  179  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.834964  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  34.01 
 
 		 292 aa  179  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1200  diaminopimelate epimerase  37.46 
 
 		 287 aa  179  4e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0570214  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0541  diaminopimelate epimerase  36.43 
 
 		 274 aa  179  4e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  36.55 
 
 		 288 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>