More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3766 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2928  TonB-dependent receptor plug  37.64 
 
 		 1245 aa  694    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3766  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1146 aa  2343    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2317  TonB-dependent receptor plug  35.36 
 
 		 1202 aa  602  1e-170  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1991  TonB-dependent receptor plug  33.44 
 
 		 1243 aa  553  1e-156  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.302175  normal  0.112109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0596  TonB-dependent receptor plug  33.62 
 
 		 1245 aa  548  1e-154  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1013  TonB-dependent receptor plug  31.35 
 
 		 1273 aa  464  1e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0530732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1754  TonB-dependent receptor plug  32.34 
 
 		 1243 aa  462  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3234  TonB-dependent receptor plug  31.89 
 
 		 1221 aa  452  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763048  normal  0.0174911 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2901  TonB-dependent receptor plug  30.49 
 
 		 1134 aa  407  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.269795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1755  TonB-dependent receptor plug  31.25 
 
 		 1289 aa  352  3e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3377  TonB-dependent receptor plug  32.17 
 
 		 1314 aa  344  5e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.615766  normal  0.66786 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1794  TonB-dependent receptor plug  35.66 
 
 		 1302 aa  324  5e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4266  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 1091 aa  305  4.0000000000000003e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0600  TonB-dependent receptor plug  29.11 
 
 		 1294 aa  302  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4280  TonB-dependent receptor plug  25.15 
 
 		 1144 aa  256  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2495  TonB-dependent receptor plug  43.2 
 
 		 1247 aa  238  6e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4287  TonB-dependent receptor plug  24.64 
 
 		 1149 aa  236  3e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3199  TonB-dependent receptor plug  47.02 
 
 		 1297 aa  229  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4278  TonB-dependent receptor plug  24.46 
 
 		 1146 aa  222  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4279  TonB-dependent receptor plug  25.18 
 
 		 1153 aa  171  5e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1349  TonB-dependent receptor plug  25.78 
 
 		 1232 aa  171  6e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.1539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2048  TonB-dependent receptor  41.11 
 
 		 929 aa  170  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.221244  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1286  TonB-dependent receptor plug  33.21 
 
 		 978 aa  130  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1267  TonB-dependent receptor  31.93 
 
 		 980 aa  116  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0522  TonB-dependent receptor  31.12 
 
 		 817 aa  84.3  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1125  TonB-dependent receptor plug  32.35 
 
 		 967 aa  80.5  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304926 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  28.16 
 
 		 692 aa  72.4  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  26.62 
 
 		 723 aa  70.1  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  27.91 
 
 		 701 aa  69.7  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  26.94 
 
 		 755 aa  69.7  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  29.08 
 
 		 708 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  29.06 
 
 		 721 aa  68.9  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3182  TonB-dependent siderophore receptor  27.59 
 
 		 735 aa  68.2  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.75 
 
 		 703 aa  68.2  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  28.45 
 
 		 734 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  28.29 
 
 		 703 aa  67  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  25.21 
 
 		 727 aa  66.6  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3723  TonB-dependent receptor plug  24.38 
 
 		 767 aa  66.2  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  29.74 
 
 		 711 aa  65.5  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 696 aa  65.1  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  27.42 
 
 		 707 aa  64.3  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 		 703 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2131  TonB-dependent receptor plug  28.96 
 
 		 757 aa  64.3  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0772564  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3521  TonB-dependent siderophore receptor  30.36 
 
 		 699 aa  64.3  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  27.63 
 
 		 719 aa  64.3  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3505  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 830 aa  64.7  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  27.76 
 
 		 696 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  27.35 
 
 		 778 aa  63.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  26.95 
 
 		 748 aa  63.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  28.08 
 
 		 734 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2025  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  23.61 
 
 		 729 aa  63.5  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000237263  hitchhiker  0.0000045764 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  28.08 
 
 		 736 aa  63.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  30.05 
 
 		 708 aa  63.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  27.48 
 
 		 745 aa  62.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 707 aa  62.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  27.12 
 
 		 714 aa  62.4  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  26.74 
 
 		 703 aa  62  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2091  TonB-dependent siderophore receptor  32.04 
 
 		 735 aa  62  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.724468 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3722  TonB-dependent receptor plug  27.84 
 
 		 896 aa  62  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.275954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 840 aa  62  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1617  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  25.88 
 
 		 728 aa  62  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000544721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  23.47 
 
 		 864 aa  61.6  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01098  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  25.32 
 
 		 729 aa  61.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.523255  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2545  TonB-dependent siderophore receptor  25.32 
 
 		 729 aa  61.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00327648  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1224  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  25.32 
 
 		 729 aa  61.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000059752  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1481  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  25.32 
 
 		 729 aa  61.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00382185  hitchhiker  0.00000310394 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1223  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  25.32 
 
 		 729 aa  61.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000020204  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  26.11 
 
 		 709 aa  60.8  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  26.6 
 
 		 860 aa  61.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01106  hypothetical protein  25.32 
 
 		 729 aa  61.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.689576  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  25.44 
 
 		 701 aa  60.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2499  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  25.32 
 
 		 729 aa  61.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318087  unclonable  0.0000000283448 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  29.41 
 
 		 831 aa  60.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  26.48 
 
 		 708 aa  60.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  30.23 
 
 		 710 aa  59.7  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  26.9 
 
 		 743 aa  59.7  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1826  TonB-dependent siderophore receptor  27.18 
 
 		 784 aa  59.7  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  26.55 
 
 		 722 aa  59.3  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  29.11 
 
 		 709 aa  59.3  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  27.04 
 
 		 850 aa  59.3  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2222  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  24.47 
 
 		 729 aa  59.3  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115447  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  28.04 
 
 		 715 aa  59.3  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  28.43 
 
 		 694 aa  59.3  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1280  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  24.69 
 
 		 724 aa  58.9  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.76264 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  27.81 
 
 		 730 aa  58.9  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  28.84 
 
 		 741 aa  58.2  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1352  TonB-dependent receptor plug  23.15 
 
 		 832 aa  58.2  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2165  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  26.46 
 
 		 724 aa  58.2  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000331924 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1318  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  26.46 
 
 		 724 aa  58.2  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45545  hitchhiker  0.0000000229507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1981  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  26.46 
 
 		 724 aa  58.2  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0489607  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1303  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  26.46 
 
 		 724 aa  57.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11921  hitchhiker  0.00000000921463 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  26.46 
 
 		 726 aa  57.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3330  hypothetical protein  27.11 
 
 		 714 aa  57.4  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.641382  normal  0.572781 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  25.29 
 
 		 747 aa  57.8  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0917  TonB-dependent siderophore receptor  27.43 
 
 		 696 aa  57  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3560  TonB-dependent siderophore receptor  31.98 
 
 		 710 aa  57.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  27.02 
 
 		 726 aa  57  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  26.11 
 
 		 732 aa  57.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3276  TonB-dependent siderophore receptor  25.89 
 
 		 840 aa  57.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130164 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2785  TonB-dependent siderophore receptor  30.2 
 
 		 786 aa  56.2  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00424821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>