More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3723 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3722  TonB-dependent receptor plug  65.86 
 
 		 896 aa  1008    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.275954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3723  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 767 aa  1568    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2131  TonB-dependent receptor plug  30.18 
 
 		 757 aa  231  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0772564  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1352  TonB-dependent receptor plug  27.52 
 
 		 832 aa  206  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3505  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 830 aa  186  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  24.52 
 
 		 736 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  24.96 
 
 		 850 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 766 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  24.34 
 
 		 770 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  24.22 
 
 		 710 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  22.64 
 
 		 748 aa  107  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  22.48 
 
 		 737 aa  107  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  22.64 
 
 		 748 aa  107  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  22.63 
 
 		 749 aa  107  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  22.11 
 
 		 740 aa  107  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  22.38 
 
 		 738 aa  106  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  23.87 
 
 		 721 aa  105  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0607  TonB-dependent siderophore receptor  24.45 
 
 		 706 aa  105  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  23.76 
 
 		 726 aa  105  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  25.62 
 
 		 806 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  23.91 
 
 		 710 aa  103  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1286  TonB-dependent receptor plug  21.36 
 
 		 978 aa  101  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  24.93 
 
 		 729 aa  100  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  23.91 
 
 		 715 aa  100  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  23.78 
 
 		 696 aa  98.6  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  23.02 
 
 		 742 aa  97.8  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0794  TonB-dependent siderophore receptor  25.04 
 
 		 749 aa  97.4  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.038915  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  22.97 
 
 		 742 aa  97.4  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3062  TonB-dependent siderophore receptor  24.37 
 
 		 715 aa  97.4  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.173013 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  23.28 
 
 		 733 aa  96.7  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  24.79 
 
 		 817 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 820 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1961  TonB-dependent siderophore receptor  23.92 
 
 		 803 aa  96.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281016  normal  0.90568 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  24.89 
 
 		 736 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  23.69 
 
 		 797 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  24.26 
 
 		 755 aa  95.9  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  25.07 
 
 		 714 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  23.96 
 
 		 729 aa  95.9  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  32.03 
 
 		 722 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  24.18 
 
 		 694 aa  95.9  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3330  hypothetical protein  23.66 
 
 		 714 aa  95.5  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.641382  normal  0.572781 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  29.37 
 
 		 710 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6070  TonB-dependent siderophore receptor  25.3 
 
 		 729 aa  95.1  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  22.94 
 
 		 705 aa  94.7  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6367  TonB-dependent siderophore receptor  25.1 
 
 		 729 aa  94.7  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  23.92 
 
 		 747 aa  94.7  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  25.04 
 
 		 732 aa  94.4  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  23.07 
 
 		 696 aa  94  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  23.01 
 
 		 707 aa  93.6  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6108  TonB-dependent siderophore receptor  23.99 
 
 		 796 aa  94  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296471  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.08 
 
 		 711 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  23.13 
 
 		 719 aa  92.8  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0569  TonB-dependent siderophore receptor  23.25 
 
 		 724 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  23.27 
 
 		 717 aa  92  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  30.07 
 
 		 701 aa  92  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  22.05 
 
 		 712 aa  92  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  29.82 
 
 		 695 aa  91.7  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  23.73 
 
 		 719 aa  91.7  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  22.62 
 
 		 706 aa  91.3  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  22.62 
 
 		 706 aa  91.3  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4624  TonB-dependent siderophore receptor  23.14 
 
 		 797 aa  91.3  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185618  decreased coverage  0.0000000123032 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  23.71 
 
 		 717 aa  90.9  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.424895 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 794 aa  90.9  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  25.17 
 
 		 812 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4755  TonB-dependent siderophore receptor  23.14 
 
 		 797 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.251254  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2151  TonB-dependent siderophore receptor, putative  22.94 
 
 		 825 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0848793  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01528  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 720 aa  90.1  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  34.15 
 
 		 730 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  22.56 
 
 		 696 aa  89.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  23.7 
 
 		 708 aa  89.7  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  22.58 
 
 		 698 aa  89.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0580  TonB-dependent siderophore receptor  22.89 
 
 		 725 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  21.75 
 
 		 816 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  23.59 
 
 		 745 aa  89.4  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  28.29 
 
 		 708 aa  89  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  22.72 
 
 		 731 aa  89  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001284  putative iron(III) compound receptor  28.24 
 
 		 701 aa  89  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000165675  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  27.52 
 
 		 711 aa  89  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3225  TonB-dependent siderophore receptor  23.78 
 
 		 803 aa  89  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 		 757 aa  89  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1962  TonB-dependent siderophore receptor  23.07 
 
 		 746 aa  87.8  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  22.35 
 
 		 729 aa  87.8  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  23.1 
 
 		 724 aa  87.8  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  22.35 
 
 		 729 aa  87.4  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0535  TonB-dependent siderophore receptor  23.09 
 
 		 725 aa  87.4  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0288  TonB-dependent siderophore receptor  22.91 
 
 		 765 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal  0.515749 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  30.33 
 
 		 710 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  28.97 
 
 		 742 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  24.37 
 
 		 715 aa  87  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  22.66 
 
 		 733 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0946  TonB-dependent siderophore receptor  27.82 
 
 		 706 aa  87  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0945  TonB-dependent siderophore receptor  23.27 
 
 		 717 aa  86.3  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  24.15 
 
 		 747 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  24.15 
 
 		 747 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2064  TonB-dependent siderophore receptor  24.1 
 
 		 723 aa  86.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228617  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  24.15 
 
 		 747 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0272  TonB-dependent siderophore receptor  22.77 
 
 		 765 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199499 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  25.15 
 
 		 745 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  22.9 
 
 		 747 aa  85.5  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  29.43 
 
 		 708 aa  85.5  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>