More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3377 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0600  TonB-dependent receptor plug  36.32 
 
 		 1294 aa  686    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0596  TonB-dependent receptor plug  36.26 
 
 		 1245 aa  698    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3199  TonB-dependent receptor plug  35.76 
 
 		 1297 aa  644    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2495  TonB-dependent receptor plug  50.88 
 
 		 1247 aa  1181    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3377  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1314 aa  2673    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.615766  normal  0.66786 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1013  TonB-dependent receptor plug  36.64 
 
 		 1273 aa  683    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0530732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1991  TonB-dependent receptor plug  36.65 
 
 		 1243 aa  686    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.302175  normal  0.112109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1754  TonB-dependent receptor plug  36.31 
 
 		 1243 aa  583  1.0000000000000001e-165  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1755  TonB-dependent receptor plug  34.42 
 
 		 1289 aa  563  1.0000000000000001e-159  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2317  TonB-dependent receptor plug  34.93 
 
 		 1202 aa  561  1e-158  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1794  TonB-dependent receptor plug  32.64 
 
 		 1302 aa  536  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3766  TonB-dependent receptor plug  32.17 
 
 		 1146 aa  347  1e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3234  TonB-dependent receptor plug  29.19 
 
 		 1221 aa  289  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763048  normal  0.0174911 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2928  TonB-dependent receptor plug  34.04 
 
 		 1245 aa  285  5.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2901  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1134 aa  263  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.269795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4279  TonB-dependent receptor plug  38.57 
 
 		 1153 aa  170  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1349  TonB-dependent receptor plug  34.42 
 
 		 1232 aa  170  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.1539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4280  TonB-dependent receptor plug  35.76 
 
 		 1144 aa  157  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4278  TonB-dependent receptor plug  34.94 
 
 		 1146 aa  150  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4266  TonB-dependent receptor plug  27.47 
 
 		 1091 aa  147  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4287  TonB-dependent receptor plug  35.64 
 
 		 1149 aa  144  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2048  TonB-dependent receptor  33.13 
 
 		 929 aa  140  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.221244  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1267  TonB-dependent receptor  32.56 
 
 		 980 aa  113  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1286  TonB-dependent receptor plug  30.17 
 
 		 978 aa  104  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1125  TonB-dependent receptor plug  31.43 
 
 		 967 aa  83.2  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304926 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2131  TonB-dependent receptor plug  31.55 
 
 		 757 aa  80.5  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0772564  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1281  TonB-dependent siderophore receptor  30.56 
 
 		 699 aa  80.9  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0522  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 817 aa  76.6  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  28.89 
 
 		 747 aa  76.3  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  31.25 
 
 		 727 aa  76.6  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  29.32 
 
 		 703 aa  75.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1352  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 832 aa  74.3  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  27.91 
 
 		 708 aa  74.3  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  34.2 
 
 		 833 aa  72.4  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  26.7 
 
 		 755 aa  71.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  28.73 
 
 		 829 aa  70.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  25.48 
 
 		 732 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  28.24 
 
 		 752 aa  69.3  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  27.9 
 
 		 701 aa  69.3  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  28.43 
 
 		 701 aa  68.2  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  28.24 
 
 		 747 aa  68.2  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  25.86 
 
 		 708 aa  68.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0946  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 		 706 aa  68.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  28.24 
 
 		 745 aa  68.2  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  28.24 
 
 		 747 aa  67.4  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  28.24 
 
 		 747 aa  67.4  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  27.83 
 
 		 692 aa  67.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3722  TonB-dependent receptor plug  28.02 
 
 		 896 aa  66.6  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.275954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  29.5 
 
 		 723 aa  65.9  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  25.35 
 
 		 742 aa  65.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  26.77 
 
 		 747 aa  65.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3560  TonB-dependent siderophore receptor  30.43 
 
 		 710 aa  65.5  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  26.77 
 
 		 747 aa  65.1  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  24.81 
 
 		 689 aa  64.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0917  TonB-dependent siderophore receptor  28.32 
 
 		 696 aa  64.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0837  TonB-dependent siderophore receptor  24.7 
 
 		 759 aa  64.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.213171  normal  0.109269 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 742 aa  64.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  27.71 
 
 		 711 aa  64.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  27.71 
 
 		 708 aa  64.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  27.09 
 
 		 797 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  26.48 
 
 		 714 aa  64.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2091  TonB-dependent siderophore receptor  28.78 
 
 		 735 aa  63.9  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.724468 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2977  TonB-dependent receptor, plug  25.76 
 
 		 518 aa  63.5  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826241  normal  0.256941 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5955  TonB-dependent siderophore receptor  26.64 
 
 		 877 aa  63.2  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0124539 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3723  TonB-dependent receptor plug  28.64 
 
 		 767 aa  63.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  24.71 
 
 		 732 aa  63.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  24.52 
 
 		 738 aa  63.2  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  29.61 
 
 		 745 aa  63.2  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3505  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 830 aa  63.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  26.98 
 
 		 722 aa  63.2  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 744 aa  62.8  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 719 aa  62.8  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 744 aa  63.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  28.88 
 
 		 694 aa  63.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  24.44 
 
 		 703 aa  62.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  23.87 
 
 		 740 aa  62.8  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0945  TonB-dependent siderophore receptor  27.05 
 
 		 717 aa  62.4  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  23.37 
 
 		 778 aa  62.4  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  26.57 
 
 		 717 aa  62  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.424895 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  27.71 
 
 		 709 aa  62  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  24.03 
 
 		 748 aa  61.6  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  24.03 
 
 		 748 aa  61.6  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0089  TonB-dependent siderophore receptor  25.19 
 
 		 699 aa  61.6  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.26085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  26.36 
 
 		 831 aa  61.6  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  26.9 
 
 		 771 aa  61.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  26.67 
 
 		 829 aa  61.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  26.41 
 
 		 828 aa  61.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  27.45 
 
 		 828 aa  61.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  26.38 
 
 		 701 aa  60.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  27.86 
 
 		 695 aa  60.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  26.69 
 
 		 703 aa  60.1  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  22.97 
 
 		 737 aa  60.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  24.47 
 
 		 719 aa  60.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  32.06 
 
 		 720 aa  60.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2813  molybdate ABC transporter permease  24.37 
 
 		 743 aa  60.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000103561  decreased coverage  0.000000463153 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03559  putative outer membrane receptor for iron transport  28.77 
 
 		 761 aa  60.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143456  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  25.69 
 
 		 712 aa  60.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  26.94 
 
 		 743 aa  60.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  28.83 
 
 		 715 aa  60.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0947  TonB-dependent siderophore receptor  29.73 
 
 		 683 aa  60.1  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0779656  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>