More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3359 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3359  helicase  100 
 
 		 865 aa  1748    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0429272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1633  Helicase ATP-dependent domain protein  41.88 
 
 		 861 aa  613  9.999999999999999e-175  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2232  ATP-dependent helicase HrpB  36.01 
 
 		 842 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0479151  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0787  ATP-dependent helicase HrpB  40.32 
 
 		 860 aa  458  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.368486  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0835  ATP-dependent helicase HrpB  39.75 
 
 		 860 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0839  ATP-dependent helicase HrpB  39.75 
 
 		 860 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1349  ATP-dependent helicase HrpB  36.59 
 
 		 842 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.228837  hitchhiker  0.00000000348515 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1858  ATP-dependent helicase HrpB  37.4 
 
 		 891 aa  445  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0833  ATP-dependent helicase HrpB  38.22 
 
 		 921 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3110  ATP-dependent helicase  33.22 
 
 		 826 aa  430  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.924657  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1838  ATP-dependent helicase HrpB  34.17 
 
 		 846 aa  420  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458406  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2470  ATP-dependent helicase HrpB  35.47 
 
 		 844 aa  421  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.590615  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3081  ATP-dependent helicase HrpB  35.1 
 
 		 827 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.895104  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0098  ATP-dependent helicase HrpB  34.09 
 
 		 826 aa  404  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.310548 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1773  ATP-dependent helicase HrpB  33.83 
 
 		 798 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0295014  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1180  ATP-dependent helicase HrpB  34.86 
 
 		 828 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9477e-16 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3982  ATP-dependent RNA helicase HrpB  33.64 
 
 		 812 aa  395  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0579093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0130  ATP-dependent RNA helicase HrpB  33.72 
 
 		 820 aa  389  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4651  ATP-dependent helicase HrpB  33.11 
 
 		 833 aa  388  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262977  normal  0.748056 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03444  ATP-dependent RNA helicase HrpB  31.03 
 
 		 833 aa  387  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2844  ATP-dependent helicase HrpB  34.9 
 
 		 830 aa  383  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.454612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0976  ATP-dependent helicase HrpB  34.82 
 
 		 848 aa  384  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0156609  normal  0.918373 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2348  ATP-dependent helicase HrpB  33.75 
 
 		 842 aa  385  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002567  ATP-dependent helicase HrpB  31.81 
 
 		 822 aa  382  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4854  ATP-dependent helicase HrpB  33.33 
 
 		 877 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.951101 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2603  ATP-dependent RNA helicase HrpB  29.26 
 
 		 821 aa  380  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.587865  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0665  ATP-dependent helicase protein, putative  33.87 
 
 		 832 aa  382  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0192  ATP-dependent helicase HrpB  33.41 
 
 		 917 aa  379  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0135151 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0505  ATP-dependent helicase HrpB  32.84 
 
 		 870 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.967773 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0302  ATP-dependent helicase HrpB  33.33 
 
 		 825 aa  379  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.204863 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0359  ATP-dependent helicase HrpB  33.48 
 
 		 872 aa  373  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.508853 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1573  thiolase  31.61 
 
 		 864 aa  375  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0554  ATP-dependent helicase HrpB  31 
 
 		 848 aa  371  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164012  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1588  ATP-dependent helicase HrpB  34.34 
 
 		 847 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.41464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03270  ATP-dependent RNA helicase  34.42 
 
 		 823 aa  366  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3869  ATP-dependent helicase HrpB  31.31 
 
 		 849 aa  369  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4808  ATP-dependent helicase HrpB  32.77 
 
 		 844 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1083  ATP-dependent helicase HrpB  35.26 
 
 		 829 aa  369  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.220902 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0648  ATP-dependent helicase HrpB  34.12 
 
 		 842 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242487  normal  0.649022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3743  ATP-dependent helicase HrpB  31.79 
 
 		 856 aa  366  1e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0704  ATP-dependent helicase HrpB  32.14 
 
 		 869 aa  365  1e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0536  ATP-dependent helicase HrpB  33.3 
 
 		 825 aa  366  1e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2129  ATP-dependent helicase HrpB  35.31 
 
 		 837 aa  365  2e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0582  ATP-dependent helicase HrpB  31.97 
 
 		 854 aa  365  3e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3686  ATP-dependent helicase HrpB  31.33 
 
 		 856 aa  364  3e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0455  ATP-dependent helicase HrpB  33.72 
 
 		 829 aa  365  3e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3124  ATP-dependent helicase HrpB  33.45 
 
 		 843 aa  364  4e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000637258 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0585  ATP-dependent helicase HrpB  30.94 
 
 		 835 aa  364  4e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3895  ATP-dependent helicase HrpB  30.51 
 
 		 855 aa  363  7.0000000000000005e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1148  ATP-dependent helicase HrpB  34.9 
 
 		 838 aa  363  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.658712  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0688  ATP-dependent RNA helicase HrpB  31.7 
 
 		 809 aa  361  3e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0972793  normal  0.531464 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0655  ATP-dependent helicase HrpB  31.43 
 
 		 846 aa  361  3e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0559  ATP-dependent helicase HrpB  31.92 
 
 		 822 aa  361  4e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4320  ATP-dependent helicase HrpB  33.41 
 
 		 844 aa  360  5e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.043486  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0632  ATP-dependent helicase HrpB  31.26 
 
 		 835 aa  359  9e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1261  ATP-dependent helicase HrpB  32.03 
 
 		 825 aa  360  9e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0343419 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0073  ATP-dependent helicase HrpB  33.26 
 
 		 824 aa  357  5e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0623  ATP-dependent helicase HrpB  31.58 
 
 		 835 aa  356  8.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3407  ATP-dependent helicase HrpB  31.24 
 
 		 835 aa  356  8.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.982669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2061  ATP-dependent helicase HrpB  32.66 
 
 		 837 aa  355  2.9999999999999997e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0816695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0622  ATP-dependent helicase HrpB  31.74 
 
 		 835 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.53674 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4735  ATP-dependent helicase HrpB  32.49 
 
 		 840 aa  353  8e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.784057  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4935  ATP-dependent helicase HrpB  33.11 
 
 		 839 aa  351  3e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557516 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4194  ATP-dependent helicase HrpB  29.05 
 
 		 823 aa  351  3e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4772  ATP-dependent helicase HrpB  34.43 
 
 		 842 aa  350  5e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0178797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4648  ATP-dependent helicase HrpB  34.53 
 
 		 842 aa  350  6e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.052727  normal  0.20008 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00470  ATP-dependent helicase HrpB  31.17 
 
 		 894 aa  348  4e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1590  ATP-dependent helicase HrpB  33.87 
 
 		 825 aa  347  8e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3739  ATP-dependent helicase HrpB  34.27 
 
 		 844 aa  347  8e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4319  ATP-dependent helicase HrpB  31.75 
 
 		 821 aa  345  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41641  predicted protein  33.85 
 
 		 936 aa  344  4e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000692526 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0127  ATP-dependent helicase HrpB  31.57 
 
 		 832 aa  344  5e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00299316  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0669  ATP-dependent helicase HrpB  32.61 
 
 		 841 aa  343  5.999999999999999e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3271  ATP-dependent helicase HrpB  31.6 
 
 		 848 aa  343  1e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3793  ATP-dependent helicase HrpB  30.28 
 
 		 842 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000841118 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09990  DEAH-box ATP-dependent helicase HrpB  34.57 
 
 		 838 aa  340  7e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.371307  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12630  putative ATP-dependent helicase  34.15 
 
 		 830 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1172  ATP-dependent helicase HrpB  31.42 
 
 		 863 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0147  ATP-dependent helicase HrpB  31.16 
 
 		 818 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.210088  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3165  ATP-dependent helicase HrpB  30.47 
 
 		 850 aa  335  3e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0516  ATP-dependent helicase HrpB  31.31 
 
 		 822 aa  334  5e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.355693 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3991  ATP-dependent helicase HrpB  30.83 
 
 		 821 aa  333  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0067  DEAD box-like helicase  31.62 
 
 		 820 aa  332  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0419076  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0488  ATP-dependent helicase HrpB  29.7 
 
 		 823 aa  332  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.531683  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3275  ATP-dependent helicase HrpB  31.46 
 
 		 821 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2322  ATP-dependent helicase HrpB  30.37 
 
 		 834 aa  325  3e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.334263 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4302  ATP-dependent helicase HrpB  29.58 
 
 		 845 aa  323  6e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7107  ATP-dependent helicase HrpB  33.71 
 
 		 850 aa  320  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02411  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.16 
 
 		 853 aa  318  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2330  ATP-dependent helicase HrpA  34.95 
 
 		 1315 aa  318  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.740295 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01368  ATP-dependent helicase  31.26 
 
 		 1281 aa  318  3e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.957415  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0369  ATP-dependent helicase HrpB  29.83 
 
 		 834 aa  318  3e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1821  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.9 
 
 		 1306 aa  317  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1700  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.71 
 
 		 1298 aa  317  4e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1759  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.26 
 
 		 1300 aa  317  5e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2232  ATP-dependent helicase HrpA  31.26 
 
 		 1300 aa  317  6e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95685  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2245  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.26 
 
 		 1300 aa  317  6e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.448406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1633  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.26 
 
 		 1300 aa  317  6e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2016  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.26 
 
 		 1300 aa  317  6e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0120087 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1515  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.9 
 
 		 1306 aa  317  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>