More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00470 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00470  ATP-dependent helicase HrpB  100 
 
 		 894 aa  1838    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0488  ATP-dependent helicase HrpB  37.65 
 
 		 823 aa  520  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.531683  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002567  ATP-dependent helicase HrpB  36.39 
 
 		 822 aa  483  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03444  ATP-dependent RNA helicase HrpB  36.18 
 
 		 833 aa  480  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0632  ATP-dependent helicase HrpB  36.64 
 
 		 835 aa  479  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0655  ATP-dependent helicase HrpB  35.77 
 
 		 846 aa  476  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3407  ATP-dependent helicase HrpB  36.92 
 
 		 835 aa  477  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.982669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0622  ATP-dependent helicase HrpB  36.7 
 
 		 835 aa  476  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.53674 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0623  ATP-dependent helicase HrpB  36.81 
 
 		 835 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3124  ATP-dependent helicase HrpB  36.18 
 
 		 843 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000637258 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0704  ATP-dependent helicase HrpB  35.85 
 
 		 869 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3793  ATP-dependent helicase HrpB  35.38 
 
 		 842 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000841118 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3081  ATP-dependent helicase HrpB  36.06 
 
 		 827 aa  464  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.895104  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3111  ATP-dependent RNA helicase HrpB  37.5 
 
 		 820 aa  462  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0130  ATP-dependent RNA helicase HrpB  36.12 
 
 		 820 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2603  ATP-dependent RNA helicase HrpB  34.82 
 
 		 821 aa  459  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.587865  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3895  ATP-dependent helicase HrpB  34.49 
 
 		 855 aa  457  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2232  ATP-dependent helicase HrpB  36.91 
 
 		 842 aa  459  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0479151  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0648  ATP-dependent helicase HrpB  35.79 
 
 		 842 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242487  normal  0.649022 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3869  ATP-dependent helicase HrpB  33.85 
 
 		 849 aa  452  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0688  ATP-dependent RNA helicase HrpB  36.04 
 
 		 809 aa  448  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0972793  normal  0.531464 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1180  ATP-dependent helicase HrpB  35.6 
 
 		 828 aa  449  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9477e-16 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3686  ATP-dependent helicase HrpB  33.81 
 
 		 856 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3743  ATP-dependent helicase HrpB  33.81 
 
 		 856 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2972  ATP-dependent helicase HrpB  34.51 
 
 		 838 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1167  ATP-dependent RNA helicase HrpB  36.92 
 
 		 814 aa  445  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1838  ATP-dependent helicase HrpB  36.45 
 
 		 846 aa  446  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458406  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1773  ATP-dependent helicase HrpB  35.45 
 
 		 798 aa  445  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0295014  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0582  ATP-dependent helicase HrpB  34.06 
 
 		 854 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3110  ATP-dependent helicase  33.63 
 
 		 826 aa  438  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.924657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0073  ATP-dependent helicase HrpB  35.04 
 
 		 824 aa  437  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4772  ATP-dependent helicase HrpB  35.69 
 
 		 842 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0178797 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4320  ATP-dependent helicase HrpB  35.33 
 
 		 844 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.043486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0359  ATP-dependent helicase HrpB  35.15 
 
 		 872 aa  436  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.508853 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4648  ATP-dependent helicase HrpB  35.91 
 
 		 842 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.052727  normal  0.20008 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1349  ATP-dependent helicase HrpB  35.46 
 
 		 842 aa  430  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.228837  hitchhiker  0.00000000348515 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2816  ATP-dependent RNA helicase HrpB  37.5 
 
 		 812 aa  432  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1035  ATP-dependent RNA helicase HrpB  36.25 
 
 		 825 aa  432  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1148  ATP-dependent helicase HrpB  34.89 
 
 		 838 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.658712  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0554  ATP-dependent helicase HrpB  34.11 
 
 		 848 aa  427  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164012  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1573  thiolase  34.71 
 
 		 864 aa  426  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3739  ATP-dependent helicase HrpB  35.3 
 
 		 844 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7352  ATP-dependent helicase  35.15 
 
 		 824 aa  426  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3165  ATP-dependent helicase HrpB  36.26 
 
 		 850 aa  426  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0302  ATP-dependent helicase HrpB  34.97 
 
 		 825 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.204863 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0455  ATP-dependent helicase HrpB  35.25 
 
 		 829 aa  424  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1261  ATP-dependent helicase HrpB  34.36 
 
 		 825 aa  422  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0343419 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09990  DEAH-box ATP-dependent helicase HrpB  35.14 
 
 		 838 aa  421  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.371307  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4302  ATP-dependent helicase HrpB  33.92 
 
 		 845 aa  420  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4735  ATP-dependent helicase HrpB  35.05 
 
 		 840 aa  422  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.784057  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0147  ATP-dependent helicase HrpB  34.41 
 
 		 818 aa  422  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.210088  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4935  ATP-dependent helicase HrpB  35.12 
 
 		 839 aa  421  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557516 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03270  ATP-dependent RNA helicase  34.74 
 
 		 823 aa  418  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3271  ATP-dependent helicase HrpB  33.51 
 
 		 848 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4808  ATP-dependent helicase HrpB  34.23 
 
 		 844 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0098  ATP-dependent helicase HrpB  35.49 
 
 		 826 aa  413  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.310548 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2129  ATP-dependent helicase HrpB  34.52 
 
 		 837 aa  413  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0127  ATP-dependent helicase HrpB  35.11 
 
 		 832 aa  415  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00299316  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0501  ATP-dependent helicase HrpB  33.82 
 
 		 833 aa  410  1e-113  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0976  ATP-dependent helicase HrpB  35.43 
 
 		 848 aa  410  1e-113  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0156609  normal  0.918373 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0192  ATP-dependent helicase HrpB  34.54 
 
 		 917 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0135151 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3886  ATP-dependent helicase HrpB  34.07 
 
 		 834 aa  411  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.41571 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1588  ATP-dependent helicase HrpB  34.72 
 
 		 847 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.41464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4854  ATP-dependent helicase HrpB  34.21 
 
 		 877 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.951101 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2580  ATP-dependent RNA helicase  32.88 
 
 		 834 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.262395  hitchhiker  0.0000513711 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1590  ATP-dependent helicase HrpB  35.22 
 
 		 825 aa  406  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0516  ATP-dependent helicase HrpB  32.84 
 
 		 822 aa  404  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.355693 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0536  ATP-dependent helicase HrpB  34.32 
 
 		 825 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2844  ATP-dependent helicase HrpB  35.43 
 
 		 830 aa  400  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.454612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4651  ATP-dependent helicase HrpB  33.22 
 
 		 833 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262977  normal  0.748056 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3275  ATP-dependent helicase HrpB  32.96 
 
 		 821 aa  400  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0665  ATP-dependent helicase protein, putative  34.15 
 
 		 832 aa  401  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12630  putative ATP-dependent helicase  34.33 
 
 		 830 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0565  ATP-dependent helicase  33.59 
 
 		 833 aa  401  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7107  ATP-dependent helicase HrpB  35.49 
 
 		 850 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1083  ATP-dependent helicase HrpB  34.95 
 
 		 829 aa  397  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.220902 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0585  ATP-dependent helicase HrpB  34.48 
 
 		 835 aa  396  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2013  DEAD/DEAH box helicase  33.11 
 
 		 808 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3449  ATP-dependent helicase HrpB  34.47 
 
 		 814 aa  394  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.206852 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0723  ATP-dependent helicase HrpB  32.92 
 
 		 808 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336305  normal  0.341531 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1172  ATP-dependent helicase HrpB  34 
 
 		 863 aa  390  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1306  ATP-dependent helicase HrpB  33.69 
 
 		 900 aa  391  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.493804  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0067  DEAD box-like helicase  33.75 
 
 		 820 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0419076  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4319  ATP-dependent helicase HrpB  33.37 
 
 		 821 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3991  ATP-dependent helicase HrpB  32.99 
 
 		 821 aa  389  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4194  ATP-dependent helicase HrpB  32.11 
 
 		 823 aa  383  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3458  ATP-dependent helicase HrpB  32.55 
 
 		 798 aa  380  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2061  ATP-dependent helicase HrpB  32.25 
 
 		 837 aa  375  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0816695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2491  ATP-dependent helicase  36.08 
 
 		 718 aa  362  2e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.041451 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3359  helicase  31.28 
 
 		 865 aa  361  4e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0429272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41641  predicted protein  32.5 
 
 		 936 aa  344  4e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000692526 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1244  ATP-dependent helicase HrpB  31.72 
 
 		 836 aa  340  5.9999999999999996e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00036267  normal  0.131071 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3982  ATP-dependent RNA helicase HrpB  46.73 
 
 		 812 aa  336  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0579093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2348  ATP-dependent helicase HrpB  45.54 
 
 		 842 aa  335  3e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3111  ATP-dependent helicase HrpB  44.82 
 
 		 808 aa  328  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.577878  normal  0.0241826 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1727  ATP-dependent helicase HrpB  31.45 
 
 		 856 aa  327  5e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69515  normal  0.01898 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1990  ATP-dependent helicase HrpB  32.37 
 
 		 843 aa  325  2e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00135733  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1744  ATP-dependent helicase HrpB  30.68 
 
 		 855 aa  325  3e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564063  normal  0.839045 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2322  ATP-dependent helicase HrpB  30.98 
 
 		 834 aa  324  5e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.334263 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4786  ATP-dependent helicase HrpB  33.07 
 
 		 697 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>