More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1429 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1429  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 
464 aa  935    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0031  cell division cycle protein 48-related protein  49.45 
 
 
448 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2076  AAA ATPase central domain protein  49.29 
 
 
473 aa  339  7e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.698999  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4641  ATPase central domain-containing protein  41.15 
 
 
446 aa  332  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3546  ATPase central domain-containing protein  56.54 
 
 
443 aa  315  9e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1752  AAA ATPase central domain protein  50.89 
 
 
424 aa  302  6.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2330  AAA ATPase central domain protein  50.36 
 
 
458 aa  301  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1592  AAA ATPase central domain protein  48.57 
 
 
459 aa  299  6e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0450  Microtubule-severing ATPase  47.55 
 
 
430 aa  293  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.330417 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  42.31 
 
 
607 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.06 
 
 
718 aa  216  5e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0001  AAA ATPase central domain protein  41.31 
 
 
866 aa  209  1e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.41279 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.4 
 
 
727 aa  208  2e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  41.42 
 
 
804 aa  208  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.4 
 
 
759 aa  207  3e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  41.84 
 
 
810 aa  207  3e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37691  predicted protein  41.11 
 
 
691 aa  205  2e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556949  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40 
 
 
731 aa  204  2e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.85 
 
 
736 aa  203  5e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.64 
 
 
731 aa  203  7e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  38.31 
 
 
703 aa  202  9.999999999999999e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0634  ATPase central domain-containing protein  40.32 
 
 
599 aa  202  9.999999999999999e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.527117  normal  0.730431 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.79 
 
 
731 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.16 
 
 
760 aa  201  1.9999999999999998e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  41.1 
 
 
806 aa  201  3e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.68 
 
 
737 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.08 
 
 
731 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.9 
 
 
639 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.43 
 
 
732 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  40.76 
 
 
814 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.3 
 
 
738 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.54 
 
 
737 aa  196  5.000000000000001e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  38.58 
 
 
829 aa  196  6e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.35 
 
 
768 aa  196  8.000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.88 
 
 
735 aa  195  1e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.3 
 
 
754 aa  193  6e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.72 
 
 
769 aa  192  1e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0436  Adenosinetriphosphatase  38.87 
 
 
749 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.544283 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.38 
 
 
757 aa  192  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3711  Adenosinetriphosphatase  40.48 
 
 
733 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.02 
 
 
615 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0293  microtubule-severing ATPase  41.63 
 
 
748 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.48554 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  41.89 
 
 
550 aa  191  2.9999999999999997e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.88 
 
 
723 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0091  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.98 
 
 
625 aa  190  4e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00172576  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.68 
 
 
808 aa  190  5.999999999999999e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.26 
 
 
684 aa  190  5.999999999999999e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.11 
 
 
754 aa  189  5.999999999999999e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.19 
 
 
800 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0518  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.2 
 
 
636 aa  189  7e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000475149  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.93 
 
 
781 aa  189  8e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06980  helicase, putative  40.09 
 
 
756 aa  189  8e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0189232  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.26 
 
 
784 aa  189  8e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.25 
 
 
640 aa  189  8e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  40.59 
 
 
930 aa  189  9e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.25 
 
 
642 aa  189  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.25 
 
 
642 aa  189  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  40.51 
 
 
775 aa  187  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.22 
 
 
743 aa  188  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.44 
 
 
738 aa  188  2e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.95 
 
 
754 aa  188  2e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00460  ATPase, putative  37.6 
 
 
439 aa  187  3e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_41850  predicted protein  37.6 
 
 
685 aa  187  3e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.8 
 
 
642 aa  187  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03061  vacuolar sorting ATPase Vps4, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09360)  39 
 
 
434 aa  186  6e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.548011  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  43.69 
 
 
394 aa  186  6e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.77 
 
 
704 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.25 
 
 
666 aa  186  6e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302131  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  34.17 
 
 
613 aa  186  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01366  AAA family ATPase/60S ribosome export protein Rix7, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09210)  39.91 
 
 
729 aa  186  8e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690514  normal  0.790284 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2412  membrane protease FtsH catalytic subunit  43.83 
 
 
628 aa  186  8e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.278023  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1606  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.04 
 
 
660 aa  186  8e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.4 
 
 
781 aa  186  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00418248 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.39 
 
 
653 aa  186  9e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  37.64 
 
 
754 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26031  predicted protein  41.92 
 
 
442 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.392811  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.57 
 
 
643 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0254  microtubule-severing ATPase  41 
 
 
750 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37796  predicted protein  45.87 
 
 
636 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.09 
 
 
781 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13642  cell division protein ftsH (membrane-bound protease)  44 
 
 
760 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052338 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.7 
 
 
630 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1416  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44 
 
 
794 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0495193  normal  0.256654 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.36 
 
 
620 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  40.15 
 
 
393 aa  184  3e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2104  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.12 
 
 
677 aa  184  3e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.99 
 
 
730 aa  184  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.5 
 
 
736 aa  184  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.49 
 
 
640 aa  184  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.25 
 
 
602 aa  184  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.56 
 
 
626 aa  183  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.765362 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.13 
 
 
719 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.02 
 
 
669 aa  183  6e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  35.36 
 
 
713 aa  183  6e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.29 
 
 
621 aa  183  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01240  membrane protease FtsH catalytic subunit  43.62 
 
 
696 aa  183  7e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.43 
 
 
671 aa  183  7e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.066161 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.98 
 
 
793 aa  182  8.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.54 
 
 
679 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.99 
 
 
645 aa  182  8.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>