265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0931 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0931  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 168 aa  327  6e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 142 aa  53.9  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 139 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 		 139 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  36.36 
 
 		 146 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 		 139 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3239  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0448278  normal  0.196721 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 150 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 150 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 150 aa  52.4  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 181 aa  51.6  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 177 aa  51.6  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  25.64 
 
 		 141 aa  50.8  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  40.22 
 
 		 151 aa  50.8  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 139 aa  50.8  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 172 aa  50.8  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  33.61 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3952  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 116 aa  49.3  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  32.76 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 164 aa  48.1  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  32.18 
 
 		 161 aa  47.8  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 153 aa  47.8  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 144 aa  47.8  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 153 aa  47.4  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  34.78 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  43.28 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0706  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.928225  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  31.97 
 
 		 175 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0625  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.427597  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1832  MarR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 141 aa  46.6  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  56.41 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1579  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.359907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6171  Transcriptional regulators-like protein  37.14 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2180  transcriptional regulator, putative  41.94 
 
 		 116 aa  45.8  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.846727  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1290  transcriptional regulator, MarR family  19.23 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000103671  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  40.24 
 
 		 154 aa  45.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  46.67 
 
 		 171 aa  45.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  35.87 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  33.93 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  33.04 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  32.77 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3566  MarR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 146 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 143 aa  45.8  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  31.08 
 
 		 154 aa  45.4  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  34.69 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0118  transcriptional regulator, MarR family  33.88 
 
 		 164 aa  45.1  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466512  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  30.84 
 
 		 139 aa  45.1  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  29.75 
 
 		 172 aa  45.1  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8732  hypothetical protein  35.96 
 
 		 139 aa  45.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  25.85 
 
 		 175 aa  44.7  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 170 aa  44.7  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 169 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 155 aa  44.7  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  27.7 
 
 		 167 aa  44.7  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  28.57 
 
 		 170 aa  44.7  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  39.19 
 
 		 173 aa  44.7  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2092  putative transcriptional regulator  40.32 
 
 		 116 aa  44.7  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.696757  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  40.3 
 
 		 166 aa  44.3  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2045  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 190 aa  44.3  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  34.21 
 
 		 162 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  28.57 
 
 		 173 aa  44.3  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18960  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 181 aa  44.3  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0870752  normal  0.777873 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  32 
 
 		 150 aa  44.3  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 150 aa  44.3  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 158 aa  44.3  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>