More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0368 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0368  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
695 aa  1382    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0590374 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0181  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.08 
 
 
837 aa  289  1e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.415169  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.27 
 
 
1350 aa  268  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.26 
 
 
696 aa  265  3e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125145  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 
1287 aa  261  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.85 
 
 
803 aa  261  4e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.01 
 
 
1040 aa  255  2.0000000000000002e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3600  histidine kinase  38.77 
 
 
548 aa  252  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.94225  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.87 
 
 
870 aa  250  6e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  41.41 
 
 
982 aa  249  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.22 
 
 
827 aa  248  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  32.47 
 
 
823 aa  248  4e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.24 
 
 
1075 aa  247  6e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1418  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.39 
 
 
853 aa  246  6.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237881  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.18 
 
 
1350 aa  246  8e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 
1116 aa  246  8e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.33 
 
 
1193 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.33 
 
 
1193 aa  246  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.01 
 
 
1977 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 
969 aa  245  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.01 
 
 
765 aa  244  3.9999999999999997e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.82 
 
 
1853 aa  244  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.78 
 
 
1090 aa  243  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4276  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.33 
 
 
1847 aa  243  6e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 
1313 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 
1222 aa  243  7.999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  31.07 
 
 
1046 aa  243  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.78 
 
 
1090 aa  243  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.92 
 
 
1059 aa  242  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  34.14 
 
 
1135 aa  241  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 
833 aa  242  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4253  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.82 
 
 
1843 aa  240  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.22 
 
 
1274 aa  240  6.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2504  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.87 
 
 
1132 aa  240  6.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.86 
 
 
1177 aa  240  6.999999999999999e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.24 
 
 
1121 aa  239  9e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.05 
 
 
1267 aa  238  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.69 
 
 
922 aa  238  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 
791 aa  238  3e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.29 
 
 
1068 aa  237  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  32.72 
 
 
1763 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  37.69 
 
 
882 aa  237  6e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  34.67 
 
 
1179 aa  236  9e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  36.36 
 
 
589 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 
995 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33 
 
 
916 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0099  signal transduction histidine kinase-like protein  35.16 
 
 
938 aa  235  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.878773 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2206  histidine kinase  36.11 
 
 
556 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 
882 aa  234  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.23 
 
 
969 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.23 
 
 
984 aa  234  6e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.18 
 
 
1064 aa  233  8.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.1 
 
 
902 aa  233  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.02 
 
 
989 aa  232  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 
1202 aa  232  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.31 
 
 
1009 aa  231  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.37 
 
 
1331 aa  230  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.18 
 
 
973 aa  231  5e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.18 
 
 
939 aa  231  5e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  34.03 
 
 
2109 aa  229  9e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.36 
 
 
738 aa  229  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.81 
 
 
1118 aa  229  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.15 
 
 
1352 aa  229  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5761  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.93 
 
 
1204 aa  229  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.122146 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.81 
 
 
780 aa  229  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0232  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  38.5 
 
 
738 aa  229  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0277  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.46 
 
 
957 aa  228  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105373  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 
1596 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
816 aa  229  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.81 
 
 
1199 aa  229  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3403  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.01 
 
 
957 aa  228  3e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1622  PAS  33.95 
 
 
802 aa  228  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.2135  normal  0.458803 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  33.75 
 
 
1193 aa  228  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.25 
 
 
647 aa  228  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.21 
 
 
1226 aa  228  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.02 
 
 
1767 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.02 
 
 
1767 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.5 
 
 
982 aa  226  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.72 
 
 
1442 aa  226  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.84 
 
 
940 aa  225  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.53 
 
 
1029 aa  225  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3466  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.12 
 
 
1362 aa  225  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185791  normal  0.474676 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  33.59 
 
 
1028 aa  225  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.59 
 
 
860 aa  226  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 
1771 aa  225  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.08 
 
 
896 aa  224  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.16 
 
 
881 aa  224  4e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  37.5 
 
 
910 aa  224  4e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3548  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.76 
 
 
1007 aa  224  4e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.508984  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.32 
 
 
763 aa  224  4e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0852  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.82 
 
 
859 aa  224  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.13 
 
 
1582 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  38.83 
 
 
853 aa  224  4.9999999999999996e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1409  Signal transduction histidine kinase-like  29.19 
 
 
685 aa  224  4.9999999999999996e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0907  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 
896 aa  224  4.9999999999999996e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.13 
 
 
877 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.97 
 
 
1125 aa  224  6e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 
939 aa  223  7e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  33.76 
 
 
1322 aa  223  8e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 
647 aa  223  9e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00025473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>