More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4010 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_4010  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 168 aa  342  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 149 aa  124  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3239  transcriptional regulatory protein  38.67 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.616739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0747  MarR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0741  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  29.58 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  27.1 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 163 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0811  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.770437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1816  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.927572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2214  MarR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  29.46 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  31.78 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  29.46 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  25.69 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  29.46 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  30.6 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  29.46 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  29.46 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  29.46 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  29.46 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  29.46 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  29.46 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  30.23 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  30.23 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  30.23 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  28.68 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  28.68 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  28.68 
 
 		 146 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  28.68 
 
 		 146 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  28.68 
 
 		 146 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 178 aa  52  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2926  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  28.41 
 
 		 144 aa  52  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  31.96 
 
 		 144 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 149 aa  51.2  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 149 aa  51.2  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 149 aa  51.2  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3392  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 140 aa  51.2  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284351 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  19.73 
 
 		 159 aa  51.2  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 164 aa  50.8  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 149 aa  50.8  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5307  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 178 aa  50.8  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 144 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  21.43 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003893  transcriptional regulator  27.69 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3401  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  34.78 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  26.26 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  31.87 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  27.5 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  34.04 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  19.05 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 162 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 157 aa  48.5  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  25.9 
 
 		 150 aa  48.9  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 159 aa  48.9  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>