197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3578 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3578  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  100 
 
 		 371 aa  757    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0540858  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6313  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  81.94 
 
 		 371 aa  624  1e-177  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2158  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  82.83 
 
 		 365 aa  615  1e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0832  extracellular solute-binding protein  82.83 
 
 		 365 aa  614  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4483  Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  27.54 
 
 		 341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0239147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2577  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5047  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2816  extracellular solute-binding protein  27.4 
 
 		 354 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.293576  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7064  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3232  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 343 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.587408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4043  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 348 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0937845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0857  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 		 355 aa  64.3  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5508  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0465771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7193  ABC transporter substrate-binding protein  25 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3734  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  28.03 
 
 		 357 aa  63.2  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4687  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  24.76 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1162  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.227001  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1184  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000549625  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1248  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3187  putative ABC transporter substrate-binding protein  24.82 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3636  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93135  normal  0.343272 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8157  ABC transporter substrate binding protein (putrescine)  30.18 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2705  ABC transporter substrate binding protein (spermidine/putrescine)  26.15 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0128801  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4873  putative spermidine/putrescine transport system substrate-binding protein  27.81 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.987187  normal  0.365367 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3951  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0469175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8489  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 		 346 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.504362  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2162  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 		 374 aa  55.8  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0132  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  24.38 
 
 		 343 aa  55.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1117  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 		 368 aa  55.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.661593  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1590  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 		 352 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0458056 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4681  extracellular solute-binding protein  23.47 
 
 		 343 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1837  ABC transporter substrate-binding protein  23.74 
 
 		 335 aa  53.9  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1032  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 		 341 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.284122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1036  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  24.19 
 
 		 366 aa  53.5  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000359474  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3297  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 		 348 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519451  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2406  extracellular solute-binding protein family 1  26.55 
 
 		 342 aa  52.8  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2003  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  23.05 
 
 		 348 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.59191 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3813  extracellular solute-binding protein  27.6 
 
 		 348 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.109737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8307  ABC transporter substrate-binding protein  23.2 
 
 		 344 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0387111  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0863  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 		 355 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1468  ABC polyamine transporter, periplasmic ligand binding protein  24.53 
 
 		 349 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.119305 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2913  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 		 363 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4605  extracellular solute-binding protein  22.38 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01121  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  23.05 
 
 		 348 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2524  extracellular solute-binding protein family 1  23.05 
 
 		 348 aa  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00059946  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1519  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 		 346 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2480  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  23.05 
 
 		 348 aa  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0199988  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0185  extracellular solute-binding protein family 1  23.35 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01129  hypothetical protein  23.05 
 
 		 348 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2404  extracellular solute-binding protein family 1  26.52 
 
 		 342 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2648  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 		 362 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2702  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.82 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2202  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  23.05 
 
 		 348 aa  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1243  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  23.05 
 
 		 348 aa  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0566185  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1501  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  23.05 
 
 		 348 aa  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00187951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4993  extracellular solute-binding protein family 1  25.49 
 
 		 346 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2854  putative spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  29.14 
 
 		 367 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0404932  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3124  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 345 aa  50.8  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0344  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 346 aa  51.2  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4322  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 350 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199771  normal  0.317385 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1108  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  21.2 
 
 		 357 aa  50.4  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1865  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 352 aa  50.8  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00327165  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3160  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 345 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00659585 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1501  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 		 348 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5469  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 361 aa  50.8  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3858  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 358 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2829  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.5 
 
 		 353 aa  50.1  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2471  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 390 aa  50.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1246  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  22.68 
 
 		 348 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1733  putative lipoprotein signal peptide  27.02 
 
 		 346 aa  50.1  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0848422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1776  extracellular solute-binding protein family 1  32.23 
 
 		 369 aa  50.1  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2484  extracellular solute-binding protein  29.76 
 
 		 339 aa  50.1  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3608  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 		 348 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4447  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 		 348 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415415  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3919  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 		 348 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3454  putative periplasmic solute-binding protein  26.35 
 
 		 337 aa  49.7  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357351  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0386  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.14 
 
 		 338 aa  48.9  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000551212  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4343  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  23.84 
 
 		 370 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1468  extracellular solute-binding protein family 1  25.7 
 
 		 346 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000302605 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2047  extracellular solute-binding protein  29.76 
 
 		 350 aa  49.3  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.454223  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6036  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 		 358 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.62779 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1117  extracellular solute-binding protein  23.84 
 
 		 361 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0446  extracellular solute-binding protein family 1  22.09 
 
 		 352 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2074  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 		 342 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1789  extracellular solute-binding protein family 1  23.51 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.463605  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3931  hypothetical protein  31.9 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132247 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3241  extracellular solute-binding protein  30.94 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.047914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3515  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic binding protein  22.87 
 
 		 345 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5429  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0960815 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3744  twin-arginine translocation pathway signal  22.71 
 
 		 345 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1913  extracellular solute-binding protein family 1  23.44 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0831866  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1583  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein precursor (SPBP)  22.93 
 
 		 362 aa  48.1  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0473653  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1116  extracellular solute-binding protein  23.18 
 
 		 361 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3798  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 		 342 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.727469  normal  0.354571 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1064  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000691325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0755  ABC transporter, binding protein  26.48 
 
 		 371 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491874  normal  0.244729 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1773  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  31.82 
 
 		 377 aa  47.8  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2135  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 368 aa  47.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.336157  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1459  extracellular solute-binding protein family 1  24.52 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0283759 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0753  extracellular solute-binding protein  23.18 
 
 		 365 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>