More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_48964 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_04038  mitochondrial translation initiation factor IF-2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03970)  52.59 
 
 		 1072 aa  636    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01090  GTPase, putative  53.41 
 
 		 1228 aa  654    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.560658  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48964  predicted protein  100 
 
 		 623 aa  1286    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.241447  normal  0.306586 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16603  predicted protein  53.18 
 
 		 599 aa  646    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.212191  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82202  predicted protein  52.94 
 
 		 997 aa  624  1e-177  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.236958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0499  translation initiation factor IF-2  38.18 
 
 		 601 aa  388  1e-106  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.116589  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2294  translation initiation factor IF-2  36.56 
 
 		 591 aa  377  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1302  translation initiation factor IF-2  37.56 
 
 		 602 aa  379  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3384  translation initiation factor IF-2  36.73 
 
 		 591 aa  375  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000114381  normal  0.0283403 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0223  translation initiation factor IF-2  37.2 
 
 		 591 aa  374  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0201203  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2489  translation initiation factor IF-2  35.99 
 
 		 604 aa  371  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0461  translation initiation factor IF-2  38.11 
 
 		 593 aa  369  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0535363  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0755  translation initiation factor aIF-2  35.99 
 
 		 599 aa  372  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0638  translation initiation factor IF-2  36.93 
 
 		 592 aa  361  2e-98  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1520  translation initiation factor IF-2  36.77 
 
 		 589 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.537265  normal  0.628449 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0339  translation initiation factor IF-2  35.88 
 
 		 593 aa  355  2e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.618473 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2060  translation initiation factor IF-2  34.45 
 
 		 597 aa  352  1e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280189  normal  0.136093 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0030  translation initiation factor IF-2  36.46 
 
 		 597 aa  350  5e-95  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0331491 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0901  translation initiation factor IF-2  35.91 
 
 		 598 aa  347  3e-94  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1600  translation initiation factor IF-2  35.47 
 
 		 588 aa  347  5e-94  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0457  translation initiation factor IF-2  36.78 
 
 		 594 aa  346  8e-94  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.202965 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0628  translation initiation factor IF-2  35.69 
 
 		 592 aa  346  8.999999999999999e-94  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1389  translation initiation factor IF-2  35.54 
 
 		 598 aa  344  2e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0631  translation initiation factor IF-2  35.25 
 
 		 589 aa  343  4e-93  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.39875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1287  translation initiation factor IF-2  35.37 
 
 		 598 aa  342  1e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.492003 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2715  translation initiation factor aIF-2  34.51 
 
 		 607 aa  342  1e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0669  translation initiation factor IF-2  35.03 
 
 		 598 aa  339  7e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0942  translation initiation factor aIF-2  38.49 
 
 		 578 aa  338  1.9999999999999998e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1312  translation initiation factor IF-2  34.07 
 
 		 604 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.662538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1296  translation initiation factor IF-2  34.38 
 
 		 598 aa  335  1e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1206  translation initiation factor aIF-2  35.06 
 
 		 600 aa  331  2e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142011  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2679  translation initiation factor IF-2  33.62 
 
 		 602 aa  330  5.0000000000000004e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0229  translation initiation factor IF-2  37.52 
 
 		 593 aa  330  6e-89  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  30.72 
 
 		 689 aa  160  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0355  translation initiation factor IF-2  31 
 
 		 903 aa  159  1e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000123126  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1495  translation initiation factor IF-2  30.66 
 
 		 885 aa  159  2e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0130747  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0222  translation initiation factor IF-2  29.45 
 
 		 877 aa  159  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0273572  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1679  translation initiation factor IF-2  27.96 
 
 		 914 aa  158  3e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.010886  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0157  translation initiation factor IF-2  29.29 
 
 		 905 aa  155  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0433  translation initiation factor IF-2  28.42 
 
 		 829 aa  154  5e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1493  translation initiation factor IF-2  28.22 
 
 		 838 aa  153  7e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00496659  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1865  translation initiation factor IF-2  27.17 
 
 		 692 aa  153  8e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00943635  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  29.72 
 
 		 997 aa  153  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  28.49 
 
 		 887 aa  152  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0171  translation initiation factor IF-2  27.34 
 
 		 871 aa  152  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00654664  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0074  translation initiation factor IF-2  29.26 
 
 		 908 aa  151  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0422922  normal  0.247669 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0149  translation initiation factor IF-2  27.34 
 
 		 854 aa  151  4e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00379745  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0131  translation initiation factor IF-2  27.34 
 
 		 871 aa  150  5e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  31.39 
 
 		 882 aa  150  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0676  translation initiation factor IF-2  27.72 
 
 		 874 aa  150  7e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.391242  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  28.76 
 
 		 692 aa  150  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0910  translation initiation factor IF-2  29.21 
 
 		 656 aa  150  8e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  29.64 
 
 		 880 aa  150  9e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0069  translation initiation factor IF-2  29.08 
 
 		 908 aa  150  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00377162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  29.76 
 
 		 854 aa  149  1.0000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1441  translation initiation factor IF-2  26 
 
 		 685 aa  149  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.155659  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  26.73 
 
 		 924 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  29.54 
 
 		 1079 aa  148  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  27.3 
 
 		 876 aa  146  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16161  translation initiation factor IF-2  28.81 
 
 		 1113 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.446889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0151  translation initiation factor IF-2  26.96 
 
 		 690 aa  145  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000351563  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1025  translation initiation factor IF-2  27.97 
 
 		 1183 aa  144  4e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  26.13 
 
 		 965 aa  144  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3393  translation initiation factor IF-2  29.05 
 
 		 992 aa  144  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.718402 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2710  translation initiation factor IF-2  29.05 
 
 		 992 aa  144  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18951  translation initiation factor IF-2  27.75 
 
 		 1183 aa  143  8e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  28.43 
 
 		 975 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2819  translation initiation factor IF-2  28.21 
 
 		 990 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  28.43 
 
 		 969 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0248  translation initiation factor IF-2  29.55 
 
 		 888 aa  143  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.346086  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  28.43 
 
 		 975 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  28.43 
 
 		 975 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  28.43 
 
 		 975 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  28.43 
 
 		 975 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  28.34 
 
 		 972 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  27.9 
 
 		 984 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  28.43 
 
 		 975 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  28.43 
 
 		 975 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  30.13 
 
 		 679 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  30.13 
 
 		 679 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_118781  chloroplast translation initiation factor 2  26.25 
 
 		 1053 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.106372 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0153  translation initiation factor IF-2  26.75 
 
 		 693 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000770227  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  29.61 
 
 		 985 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  28.14 
 
 		 971 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  28.14 
 
 		 971 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  28.14 
 
 		 971 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  28.69 
 
 		 966 aa  141  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  28.02 
 
 		 972 aa  141  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0993  translation initiation factor IF-2  28.27 
 
 		 668 aa  141  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000676499  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1327  translation initiation factor IF-2  27.1 
 
 		 995 aa  141  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335521 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3043  translation initiation factor IF-2  27.96 
 
 		 861 aa  141  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  28.02 
 
 		 971 aa  141  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  27.71 
 
 		 882 aa  141  3e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  28.69 
 
 		 979 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0770  translation initiation factor IF-2  27.65 
 
 		 894 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  28.78 
 
 		 903 aa  140  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0057  translation initiation factor IF-2  28.47 
 
 		 921 aa  140  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  28.57 
 
 		 1079 aa  140  7e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1370  translation initiation factor IF-2  27.31 
 
 		 999 aa  140  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.515442  normal  0.133918 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0038  translation initiation factor IF-2  27.42 
 
 		 824 aa  140  7.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963114  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>