266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3117 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  100 
 
 		 326 aa  622  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  45.6 
 
 		 660 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  46.32 
 
 		 310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  35.34 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  41.45 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  38.91 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  36.04 
 
 		 323 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  38.66 
 
 		 316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  36.63 
 
 		 310 aa  152  7e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  40.84 
 
 		 332 aa  149  6e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  33.58 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  40.91 
 
 		 325 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  30.54 
 
 		 336 aa  145  9e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  35.77 
 
 		 322 aa  144  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  39.59 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  31.52 
 
 		 327 aa  142  9e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  37.7 
 
 		 325 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  32.53 
 
 		 327 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  32.86 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  37.7 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4614  type II secretion system protein  31.5 
 
 		 329 aa  137  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  38.74 
 
 		 325 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  32.93 
 
 		 321 aa  135  7.000000000000001e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  37.24 
 
 		 325 aa  135  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  38.74 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  31.97 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  34.42 
 
 		 321 aa  134  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  38.74 
 
 		 325 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  33.09 
 
 		 322 aa  133  5e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  36.1 
 
 		 323 aa  132  9e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  37.95 
 
 		 330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  37.45 
 
 		 313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  37.82 
 
 		 321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  35.51 
 
 		 325 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  35.6 
 
 		 321 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  37.17 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  35.6 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  28.69 
 
 		 335 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  38.92 
 
 		 325 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  35.08 
 
 		 322 aa  126  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  34.08 
 
 		 282 aa  126  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  35.75 
 
 		 321 aa  126  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  37.97 
 
 		 325 aa  126  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  30.04 
 
 		 324 aa  125  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  29.1 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  37.56 
 
 		 320 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  37.04 
 
 		 320 aa  123  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  37.04 
 
 		 320 aa  123  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  36.04 
 
 		 325 aa  122  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  37.16 
 
 		 325 aa  122  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  36.13 
 
 		 325 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  36.13 
 
 		 325 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  36.13 
 
 		 325 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  37.76 
 
 		 320 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  37.5 
 
 		 325 aa  122  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  37.62 
 
 		 325 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  39.06 
 
 		 321 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  37.17 
 
 		 326 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  38.04 
 
 		 320 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  28.37 
 
 		 327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  33.33 
 
 		 334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  29.52 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  30.74 
 
 		 337 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  29.52 
 
 		 324 aa  116  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  28.06 
 
 		 324 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  39.39 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  29.5 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0881  type II secretion system protein  32.35 
 
 		 296 aa  113  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  33.89 
 
 		 325 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  33.89 
 
 		 325 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  26.53 
 
 		 336 aa  112  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  30.89 
 
 		 324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  35.89 
 
 		 279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  29.47 
 
 		 325 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  35.52 
 
 		 284 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1205  type II secretion system protein  29.5 
 
 		 535 aa  109  5e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.499257  hitchhiker  0.000000000038758 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  34.25 
 
 		 331 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  31.2 
 
 		 290 aa  109  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2045  hypothetical protein  36.47 
 
 		 331 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0674023  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1676  Flp pilus assembly protein TadB  36.47 
 
 		 331 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  36.47 
 
 		 331 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2365  Flp pilus assembly protein TadB  29.46 
 
 		 325 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal  0.0552567 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1877  type II secretion system protein  36.47 
 
 		 331 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.395121  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0829  type II secretion system protein  36.47 
 
 		 331 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226795  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  25.94 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  28.22 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  29.92 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  28.33 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5121  type II secretion system protein  25.83 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0725578 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  31.58 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  29.34 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  31.02 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  30.67 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2159  type II secretion system protein  35.36 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.01997 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  29.32 
 
 		 324 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2455  pilus assembly protein, putative  31.67 
 
 		 330 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2695  type II secretion system protein  33.99 
 
 		 289 aa  102  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0973564  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  26.91 
 
 		 337 aa  102  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  26.92 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>