76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2178 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2178  Type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 873 aa  1816    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52330  Type III restriction enzyme, res subunit  26.97 
 
 		 923 aa  87.8  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232434  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0344  type III restriction protein res subunit  27.52 
 
 		 893 aa  87.8  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4167  type III restriction protein res subunit  24.71 
 
 		 912 aa  83.2  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1086  type III restriction enzyme, res subunit  27.04 
 
 		 840 aa  82.8  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.865892  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3655  Type III restriction-modification enzyme helicase subunit  27.56 
 
 		 911 aa  82.4  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00000324142  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0026  type III restriction-modification system, R subunit, putative  27.59 
 
 		 882 aa  80.1  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.352538  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0937  hypothetical protein  27.52 
 
 		 911 aa  79.7  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000206148  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0198  hypothetical protein  29.36 
 
 		 832 aa  76.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4016  type III restriction protein res subunit  25 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3802  type III restriction protein res subunit  24.87 
 
 		 894 aa  71.2  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3325  type III restriction enzyme, res subunit  28.15 
 
 		 930 aa  67  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.16803  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1492  type III restriction-modification enzyme helicase subunit  26.74 
 
 		 905 aa  65.1  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1979  type III restriction protein res subunit  22.25 
 
 		 896 aa  63.9  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0962  putative type III restriction enzyme  25 
 
 		 466 aa  63.2  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0549  type III restriction protein res subunit  28.01 
 
 		 890 aa  62.4  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1893  type III restriction protein res subunit  25.07 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3459  type III restriction protein res subunit  25.07 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3191  type III restriction-modification system, Res subunit  25.09 
 
 		 908 aa  60.1  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2792  type III restriction protein res subunit  25.09 
 
 		 908 aa  60.1  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3839  type III restriction enzyme, res subunit  24.17 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5437  type III restriction protein res subunit  26.32 
 
 		 893 aa  57.8  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.463119 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4273  type III restriction protein res subunit  23.82 
 
 		 471 aa  57.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4412  type III restriction protein res subunit  23.82 
 
 		 471 aa  57.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3418  type III restriction enzyme, res subunit  25 
 
 		 469 aa  57  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.280626  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0551  hypothetical protein  40.51 
 
 		 889 aa  55.5  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.830331  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0145  type III restriction enzyme, res subunit  23.94 
 
 		 465 aa  55.1  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1925  GGDEF family protein  23.1 
 
 		 477 aa  54.7  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4078  hypothetical protein  54 
 
 		 938 aa  53.5  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.862006 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2555  hypothetical protein  23.22 
 
 		 465 aa  53.5  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.813616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2946  type III restriction enzyme, res subunit  50 
 
 		 1018 aa  52.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0732  type III restriction-modification enzyme  17.79 
 
 		 853 aa  52.4  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0934  type III restriction enzyme, res subunit  54 
 
 		 1039 aa  52  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0435  type III restriction protein res subunit  28.09 
 
 		 977 aa  52  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137797  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2283  type III restriction enzyme, res subunit  22.65 
 
 		 465 aa  51.6  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6679  hypothetical protein  26.03 
 
 		 881 aa  51.2  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000129559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1044  type III restriction enzyme, res subunit  49.06 
 
 		 893 aa  50.4  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4690  type III restriction protein res subunit  48 
 
 		 999 aa  50.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553282  normal  0.43699 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0242  Type III restriction enzyme, res subunit  48 
 
 		 1014 aa  50.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0199  type III restriction enzyme, res subunit  33.33 
 
 		 1021 aa  50.1  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4168  type III restriction enzyme, res subunit  46 
 
 		 1020 aa  49.3  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0263776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0832  EcoEI R domain protein  23.03 
 
 		 784 aa  48.9  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.916446  normal  0.633032 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3891  helicase domain-containing protein  23.55 
 
 		 458 aa  48.9  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1468  type III restriction protein res subunit  46 
 
 		 1025 aa  48.9  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.780281  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0683  type I restriction-modification system, R subunit  23.03 
 
 		 784 aa  48.9  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0515  type III restriction enzyme, res subunit  45.45 
 
 		 877 aa  48.5  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  24.37 
 
 		 586 aa  48.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2855  type III restriction enzyme, res subunit  46 
 
 		 1018 aa  48.1  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2421  type III restriction protein res subunit  39.19 
 
 		 1039 aa  47.8  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  24.37 
 
 		 586 aa  47.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  24.37 
 
 		 586 aa  47.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  24.37 
 
 		 586 aa  47.8  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  24.37 
 
 		 586 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  23.96 
 
 		 586 aa  46.6  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  24.44 
 
 		 586 aa  46.2  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  23.96 
 
 		 586 aa  46.6  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0365  type III restriction protein res subunit  42.31 
 
 		 978 aa  46.2  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000898416 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1862  type III restriction enzyme, res subunit  23.21 
 
 		 580 aa  46.6  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.547726  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  23.96 
 
 		 586 aa  46.6  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  24.17 
 
 		 586 aa  45.8  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  24.17 
 
 		 586 aa  45.8  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0824  EcoEI R domain-containing protein  23.6 
 
 		 783 aa  46.2  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  24.3 
 
 		 586 aa  45.8  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0080  helicase domain-containing protein  23.55 
 
 		 466 aa  46.2  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  24.17 
 
 		 586 aa  45.8  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03609  Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicase  27.35 
 
 		 1141 aa  45.4  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  30.97 
 
 		 949 aa  45.8  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4198  helicase domain protein  21.18 
 
 		 470 aa  45.4  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  23.45 
 
 		 1149 aa  45.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  21.91 
 
 		 583 aa  45.1  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1742  type III restriction system endonuclease  31.5 
 
 		 990 aa  45.1  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109484  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2927  Type III restriction enzyme, res subunit  46.55 
 
 		 1010 aa  45.1  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00341327  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2573  hypothetical protein  21.32 
 
 		 906 aa  44.7  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3046  Type III site-specific deoxyribonuclease  40.79 
 
 		 994 aa  45.1  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0579  Type III site-specific deoxyribonuclease  38.2 
 
 		 891 aa  44.7  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.193547  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0566  Type III site-specific deoxyribonuclease  38.2 
 
 		 891 aa  44.3  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0796023 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>