72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0365 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4204  type III restriction protein res subunit  49.85 
 
 		 1001 aa  988    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416822  normal  0.0251436 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0027  type III restriction enzyme, res subunit  46.87 
 
 		 1008 aa  912    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0790  type III restriction enzyme, res subunit  51.59 
 
 		 992 aa  989    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186387 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0236  type III restriction enzyme, res subunit  50.2 
 
 		 991 aa  981    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4592  Type III site-specific deoxyribonuclease  50.05 
 
 		 997 aa  964    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0028  type III restriction protein res subunit  46.36 
 
 		 1008 aa  911    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0162  type III restriction enzyme, res subunit  49.34 
 
 		 998 aa  948    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000922186 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1948  type III restriction protein res subunit  48.48 
 
 		 982 aa  875    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3281  type III restriction-modification system, res subunit  46.25 
 
 		 1009 aa  920    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0028  type III restriction protein res subunit  46.97 
 
 		 1004 aa  912    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1846  type III restriction-modification system, res subunit  46.25 
 
 		 1009 aa  920    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1130  type III restriction system endonuclease  50.51 
 
 		 991 aa  940    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0518  type III restriction enzyme, res subunit  61.7 
 
 		 991 aa  1259    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0047  Type III restriction enzyme, res subunit  46.44 
 
 		 1009 aa  923    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0047  Type III restriction enzyme, res subunit  46.44 
 
 		 1009 aa  922    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2706  Type III restriction enzyme, res subunit  46.25 
 
 		 1009 aa  920    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1114  type III restriction-modification system, restriction endonuclease subunit  38.44 
 
 		 1019 aa  657    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.189519  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0019  type III restriction enzyme, res subunit  46.97 
 
 		 1011 aa  911    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1547  type III restriction system endonuclease  52.37 
 
 		 989 aa  1003    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2673  type III restriction-modification system, res subunit  46.25 
 
 		 1009 aa  920    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0046  type III restriction protein res subunit  46.97 
 
 		 1008 aa  913    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0365  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 978 aa  1993    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000898416 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0043  type III restriction enzyme, res subunit  46.87 
 
 		 1008 aa  912    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.855331  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0042  type III restriction-modification system, res subunit  46.54 
 
 		 1009 aa  916    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1393  type III restriction protein res subunit  51.89 
 
 		 993 aa  1005    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1742  type III restriction system endonuclease  50.95 
 
 		 990 aa  956    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109484  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3212  Type III restriction enzyme, res subunit  47.07 
 
 		 1008 aa  914    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.505736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05380  restriction endonuclease  38.78 
 
 		 1001 aa  654    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224122  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2180  Type III site-specific deoxyribonuclease  53.7 
 
 		 984 aa  1032    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2927  Type III restriction enzyme, res subunit  50.05 
 
 		 1010 aa  932    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00341327  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0260  type III restriction system endonuclease  46.44 
 
 		 1009 aa  922    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3046  Type III site-specific deoxyribonuclease  38.29 
 
 		 994 aa  624  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0849  Type III site-specific deoxyribonuclease  37.84 
 
 		 998 aa  619  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5226  type III restriction protein res subunit  38.84 
 
 		 1018 aa  616  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.310365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0515  type III restriction enzyme, res subunit  53.33 
 
 		 877 aa  600  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1149  type III restriction protein res subunit  37.72 
 
 		 1024 aa  598  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.511254  normal  0.0779427 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0226  type III restriction protein res subunit  49.45 
 
 		 887 aa  578  1.0000000000000001e-163  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000256753 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2486  type III restriction enzyme, res subunit  35.31 
 
 		 1010 aa  578  1.0000000000000001e-163  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.252383  decreased coverage  0.0052761 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0544  type III restriction enzyme, res subunit  35.61 
 
 		 1012 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0566  Type III site-specific deoxyribonuclease  50.74 
 
 		 891 aa  572  1e-161  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0796023 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0579  Type III site-specific deoxyribonuclease  51.24 
 
 		 891 aa  568  1e-160  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.193547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2246  type III restriction enzyme, res subunit  35.8 
 
 		 1033 aa  550  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.428313  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3485  type III restriction enzyme, res subunit  34.43 
 
 		 1019 aa  551  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340393  normal  0.439729 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0155  type III restriction protein res subunit  36.77 
 
 		 1009 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.156015  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1522  type III restriction protein res subunit  34.31 
 
 		 1008 aa  538  1e-151  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000221168  hitchhiker  0.00161886 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0929  type III restriction protein res subunit  32.93 
 
 		 1060 aa  515  1e-144  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2729  restriction endonuclease  35.32 
 
 		 909 aa  503  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1827  type III restriction enzyme, res subunit  36.38 
 
 		 1032 aa  499  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1200  hypothetical protein  33.15 
 
 		 1076 aa  442  9.999999999999999e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.563874  normal  0.0639023 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0362  type III restriction-modification system, res subunit  33.58 
 
 		 1054 aa  415  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.262363  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1019  type III restriction-modification system enzyme, R subunit  30.14 
 
 		 987 aa  182  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0398  type III restriction-modification system StyLTI enzyme res  26.19 
 
 		 989 aa  182  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982266  hitchhiker  7.86285e-19 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0390  type III restriction-modification system StyLTI enzyme res  26.19 
 
 		 989 aa  181  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.264054  hitchhiker  1.42432e-23 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0453  type III restriction-modification system StyLTI enzyme res  31.47 
 
 		 989 aa  181  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985709  hitchhiker  1.2237e-22 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1463  restriction endonuclease  25.71 
 
 		 991 aa  180  1e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0393  type III restriction-modification system StyLTI enzyme res  25.98 
 
 		 989 aa  177  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00360009  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0411  type III restriction-modification system StyLTI enzyme res  25.77 
 
 		 989 aa  177  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.63396  hitchhiker  0.00000141502 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2728  putative transposase  39.84 
 
 		 441 aa  95.1  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3802  type III restriction protein res subunit  33.05 
 
 		 894 aa  61.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3325  type III restriction enzyme, res subunit  29.91 
 
 		 930 aa  54.3  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.16803  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1086  type III restriction enzyme, res subunit  31.52 
 
 		 840 aa  51.2  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.865892  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2275  hypothetical protein  24 
 
 		 902 aa  50.8  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1979  type III restriction protein res subunit  44.26 
 
 		 896 aa  49.7  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2792  type III restriction protein res subunit  31.71 
 
 		 908 aa  47.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0909  type III restriction protein res subunit  27.39 
 
 		 1042 aa  47.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252212  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3191  type III restriction-modification system, Res subunit  31.71 
 
 		 908 aa  47.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2178  Type III restriction enzyme, res subunit  36.94 
 
 		 873 aa  46.6  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0850  type III restriction protein res subunit  24.53 
 
 		 877 aa  46.2  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0973  type III restriction enzyme, res subunit family  21.62 
 
 		 892 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0241934  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0344  type III restriction protein res subunit  30 
 
 		 893 aa  45.8  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4095  type III restriction enzyme, res subunit  28.3 
 
 		 899 aa  44.7  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.18343  normal  0.460419 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  27.78 
 
 		 773 aa  44.7  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>