73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1742 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0518  type III restriction enzyme, res subunit  51.69 
 
 		 991 aa  982    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0019  type III restriction enzyme, res subunit  56.13 
 
 		 1011 aa  1129    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4592  Type III site-specific deoxyribonuclease  61.92 
 
 		 997 aa  1253    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0027  type III restriction enzyme, res subunit  55.83 
 
 		 1008 aa  1122    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0790  type III restriction enzyme, res subunit  66.06 
 
 		 992 aa  1348    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186387 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1948  type III restriction protein res subunit  42.14 
 
 		 982 aa  727    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0162  type III restriction enzyme, res subunit  62.06 
 
 		 998 aa  1270    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000922186 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3281  type III restriction-modification system, res subunit  55.49 
 
 		 1009 aa  1142    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1846  type III restriction-modification system, res subunit  55.49 
 
 		 1009 aa  1142    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1130  type III restriction system endonuclease  64.39 
 
 		 991 aa  1283    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0236  type III restriction enzyme, res subunit  68.95 
 
 		 991 aa  1412    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0047  Type III restriction enzyme, res subunit  55.79 
 
 		 1009 aa  1145    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0047  Type III restriction enzyme, res subunit  55.79 
 
 		 1009 aa  1146    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2706  Type III restriction enzyme, res subunit  55.49 
 
 		 1009 aa  1142    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0365  type III restriction protein res subunit  50.95 
 
 		 978 aa  946    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000898416 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4204  type III restriction protein res subunit  65.93 
 
 		 1001 aa  1334    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416822  normal  0.0251436 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0028  type III restriction protein res subunit  56.53 
 
 		 1008 aa  1157    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0046  type III restriction protein res subunit  55.93 
 
 		 1008 aa  1123    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0028  type III restriction protein res subunit  56.23 
 
 		 1004 aa  1129    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1547  type III restriction system endonuclease  49.9 
 
 		 989 aa  898    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2673  type III restriction-modification system, res subunit  55.49 
 
 		 1009 aa  1142    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2180  Type III site-specific deoxyribonuclease  50.25 
 
 		 984 aa  936    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0043  type III restriction enzyme, res subunit  55.83 
 
 		 1008 aa  1122    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.855331  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0260  type III restriction system endonuclease  55.79 
 
 		 1009 aa  1146    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0042  type III restriction-modification system, res subunit  55.39 
 
 		 1009 aa  1139    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2927  Type III restriction enzyme, res subunit  68.95 
 
 		 1010 aa  1427    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00341327  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05380  restriction endonuclease  39.64 
 
 		 1001 aa  641    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224122  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1742  type III restriction system endonuclease  100 
 
 		 990 aa  2041    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109484  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3212  Type III restriction enzyme, res subunit  56.43 
 
 		 1008 aa  1132    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.505736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1393  type III restriction protein res subunit  65.13 
 
 		 993 aa  1308    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0849  Type III site-specific deoxyribonuclease  38.34 
 
 		 998 aa  613  9.999999999999999e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3046  Type III site-specific deoxyribonuclease  38.13 
 
 		 994 aa  607  9.999999999999999e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5226  type III restriction protein res subunit  36.63 
 
 		 1018 aa  557  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.310365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0544  type III restriction enzyme, res subunit  36.35 
 
 		 1012 aa  558  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1149  type III restriction protein res subunit  35.64 
 
 		 1024 aa  550  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.511254  normal  0.0779427 
 
 
-
 
NC_002936  DET1114  type III restriction-modification system, restriction endonuclease subunit  35.24 
 
 		 1019 aa  550  1e-155  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.189519  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2246  type III restriction enzyme, res subunit  35.49 
 
 		 1033 aa  545  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.428313  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2486  type III restriction enzyme, res subunit  36.57 
 
 		 1010 aa  543  1e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.252383  decreased coverage  0.0052761 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0155  type III restriction protein res subunit  35.36 
 
 		 1009 aa  542  9.999999999999999e-153  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.156015  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1522  type III restriction protein res subunit  35.35 
 
 		 1008 aa  534  1e-150  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000221168  hitchhiker  0.00161886 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0515  type III restriction enzyme, res subunit  45.86 
 
 		 877 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0226  type III restriction protein res subunit  45.54 
 
 		 887 aa  504  1e-141  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000256753 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3485  type III restriction enzyme, res subunit  34.5 
 
 		 1019 aa  494  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340393  normal  0.439729 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0929  type III restriction protein res subunit  35.02 
 
 		 1060 aa  494  9.999999999999999e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0579  Type III site-specific deoxyribonuclease  45.54 
 
 		 891 aa  491  1e-137  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.193547  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0566  Type III site-specific deoxyribonuclease  44.73 
 
 		 891 aa  479  1e-133  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0796023 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2729  restriction endonuclease  36.29 
 
 		 909 aa  479  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1827  type III restriction enzyme, res subunit  34.14 
 
 		 1032 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1200  hypothetical protein  32 
 
 		 1076 aa  432  1e-119  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.563874  normal  0.0639023 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0362  type III restriction-modification system, res subunit  31.07 
 
 		 1054 aa  393  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.262363  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1463  restriction endonuclease  25.55 
 
 		 991 aa  189  2e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1019  type III restriction-modification system enzyme, R subunit  27.58 
 
 		 987 aa  182  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0411  type III restriction-modification system StyLTI enzyme res  24.45 
 
 		 989 aa  172  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.63396  hitchhiker  0.00000141502 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0398  type III restriction-modification system StyLTI enzyme res  24.63 
 
 		 989 aa  171  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982266  hitchhiker  7.86285e-19 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0393  type III restriction-modification system StyLTI enzyme res  24.29 
 
 		 989 aa  170  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00360009  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0453  type III restriction-modification system StyLTI enzyme res  28.52 
 
 		 989 aa  170  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985709  hitchhiker  1.2237e-22 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0390  type III restriction-modification system StyLTI enzyme res  28.52 
 
 		 989 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.264054  hitchhiker  1.42432e-23 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2728  putative transposase  45.88 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3325  type III restriction enzyme, res subunit  29.1 
 
 		 930 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.16803  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1086  type III restriction enzyme, res subunit  30.7 
 
 		 840 aa  51.6  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.865892  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3802  type III restriction protein res subunit  32.89 
 
 		 894 aa  48.9  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1979  type III restriction protein res subunit  29.79 
 
 		 896 aa  48.1  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0344  type III restriction protein res subunit  34.18 
 
 		 893 aa  47  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3191  type III restriction-modification system, Res subunit  25.9 
 
 		 908 aa  46.2  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2778  type III restriction enzyme, res subunit  46 
 
 		 885 aa  46.2  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.223386 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2792  type III restriction protein res subunit  25.9 
 
 		 908 aa  46.2  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1492  type III restriction-modification enzyme helicase subunit  26.94 
 
 		 905 aa  45.8  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4389  type III restriction enzyme, res subunit  37.25 
 
 		 858 aa  45.1  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2178  Type III restriction enzyme, res subunit  31.5 
 
 		 873 aa  45.1  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0937  hypothetical protein  35.44 
 
 		 911 aa  45.1  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000206148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4167  type III restriction protein res subunit  36.71 
 
 		 912 aa  44.7  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3655  Type III restriction-modification enzyme helicase subunit  35.44 
 
 		 911 aa  44.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00000324142  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52330  Type III restriction enzyme, res subunit  26.04 
 
 		 923 aa  44.7  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>