70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0236 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009080  BMA10247_2706  Type III restriction enzyme, res subunit  62.3 
 
 		 1009 aa  1268    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0027  type III restriction enzyme, res subunit  61.69 
 
 		 1008 aa  1231    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0790  type III restriction enzyme, res subunit  72.54 
 
 		 992 aa  1499    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186387 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0236  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 991 aa  2049    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3281  type III restriction-modification system, res subunit  62.3 
 
 		 1009 aa  1268    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1846  type III restriction-modification system, res subunit  62.3 
 
 		 1009 aa  1268    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0518  type III restriction enzyme, res subunit  52.19 
 
 		 991 aa  992    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0047  Type III restriction enzyme, res subunit  62.4 
 
 		 1009 aa  1269    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0047  Type III restriction enzyme, res subunit  62.5 
 
 		 1009 aa  1273    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0162  type III restriction enzyme, res subunit  71.49 
 
 		 998 aa  1456    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000922186 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4592  Type III site-specific deoxyribonuclease  70.85 
 
 		 997 aa  1436    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4204  type III restriction protein res subunit  73.12 
 
 		 1001 aa  1498    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416822  normal  0.0251436 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0028  type III restriction protein res subunit  62.39 
 
 		 1008 aa  1266    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0046  type III restriction protein res subunit  61.79 
 
 		 1008 aa  1234    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1948  type III restriction protein res subunit  42.38 
 
 		 982 aa  739    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0028  type III restriction protein res subunit  61.71 
 
 		 1004 aa  1233    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0365  type III restriction protein res subunit  50.2 
 
 		 978 aa  973    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000898416 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1130  type III restriction system endonuclease  71.52 
 
 		 991 aa  1446    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0019  type III restriction enzyme, res subunit  61.69 
 
 		 1011 aa  1236    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1547  type III restriction system endonuclease  49.85 
 
 		 989 aa  917    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1393  type III restriction protein res subunit  71.77 
 
 		 993 aa  1457    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2673  type III restriction-modification system, res subunit  62.3 
 
 		 1009 aa  1268    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2180  Type III site-specific deoxyribonuclease  50.61 
 
 		 984 aa  944    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0260  type III restriction system endonuclease  62.5 
 
 		 1009 aa  1273    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2927  Type III restriction enzyme, res subunit  69.25 
 
 		 1010 aa  1423    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00341327  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0043  type III restriction enzyme, res subunit  61.69 
 
 		 1008 aa  1231    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.855331  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0042  type III restriction-modification system, res subunit  61.2 
 
 		 1009 aa  1236    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1742  type III restriction system endonuclease  68.95 
 
 		 990 aa  1412    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109484  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3212  Type III restriction enzyme, res subunit  61.99 
 
 		 1008 aa  1236    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.505736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05380  restriction endonuclease  39.64 
 
 		 1001 aa  649    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224122  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0849  Type III site-specific deoxyribonuclease  38.21 
 
 		 998 aa  619  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3046  Type III site-specific deoxyribonuclease  37.56 
 
 		 994 aa  612  1e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1114  type III restriction-modification system, restriction endonuclease subunit  36.39 
 
 		 1019 aa  571  1e-161  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.189519  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2486  type III restriction enzyme, res subunit  35.53 
 
 		 1010 aa  563  1.0000000000000001e-159  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.252383  decreased coverage  0.0052761 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0544  type III restriction enzyme, res subunit  36.81 
 
 		 1012 aa  562  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5226  type III restriction protein res subunit  35.16 
 
 		 1018 aa  558  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.310365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0155  type III restriction protein res subunit  34.84 
 
 		 1009 aa  548  1e-154  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.156015  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1149  type III restriction protein res subunit  35.7 
 
 		 1024 aa  545  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.511254  normal  0.0779427 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2246  type III restriction enzyme, res subunit  34 
 
 		 1033 aa  537  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.428313  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3485  type III restriction enzyme, res subunit  35.88 
 
 		 1019 aa  530  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340393  normal  0.439729 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1522  type III restriction protein res subunit  35.98 
 
 		 1008 aa  530  1e-149  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000221168  hitchhiker  0.00161886 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0929  type III restriction protein res subunit  34.55 
 
 		 1060 aa  507  9.999999999999999e-143  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2729  restriction endonuclease  38.36 
 
 		 909 aa  503  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0226  type III restriction protein res subunit  45.36 
 
 		 887 aa  500  1e-140  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000256753 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0515  type III restriction enzyme, res subunit  44.84 
 
 		 877 aa  490  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0579  Type III site-specific deoxyribonuclease  45 
 
 		 891 aa  466  9.999999999999999e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.193547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1827  type III restriction enzyme, res subunit  33.98 
 
 		 1032 aa  459  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0566  Type III site-specific deoxyribonuclease  44.19 
 
 		 891 aa  456  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0796023 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1200  hypothetical protein  33.15 
 
 		 1076 aa  452  1e-125  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.563874  normal  0.0639023 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0362  type III restriction-modification system, res subunit  31.27 
 
 		 1054 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.262363  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0453  type III restriction-modification system StyLTI enzyme res  25.37 
 
 		 989 aa  191  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985709  hitchhiker  1.2237e-22 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0398  type III restriction-modification system StyLTI enzyme res  25.45 
 
 		 989 aa  190  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982266  hitchhiker  7.86285e-19 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0390  type III restriction-modification system StyLTI enzyme res  25.45 
 
 		 989 aa  190  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.264054  hitchhiker  1.42432e-23 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0411  type III restriction-modification system StyLTI enzyme res  25.37 
 
 		 989 aa  189  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.63396  hitchhiker  0.00000141502 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1463  restriction endonuclease  26.76 
 
 		 991 aa  188  4e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0393  type III restriction-modification system StyLTI enzyme res  25.34 
 
 		 989 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00360009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1019  type III restriction-modification system enzyme, R subunit  26.79 
 
 		 987 aa  175  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2728  putative transposase  45.88 
 
 		 441 aa  82  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3325  type III restriction enzyme, res subunit  29.75 
 
 		 930 aa  48.5  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.16803  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0765  hypothetical protein  59.46 
 
 		 37 aa  48.1  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1979  type III restriction protein res subunit  30.85 
 
 		 896 aa  47.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0937  hypothetical protein  26.79 
 
 		 911 aa  47  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000206148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2275  hypothetical protein  31.82 
 
 		 902 aa  46.2  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1086  type III restriction enzyme, res subunit  29.17 
 
 		 840 aa  46.2  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.865892  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3802  type III restriction protein res subunit  32 
 
 		 894 aa  45.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0344  type III restriction protein res subunit  34.18 
 
 		 893 aa  45.4  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4167  type III restriction protein res subunit  34.18 
 
 		 912 aa  45.1  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3191  type III restriction-modification system, Res subunit  30.21 
 
 		 908 aa  44.7  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3655  Type III restriction-modification enzyme helicase subunit  31.53 
 
 		 911 aa  44.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00000324142  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2792  type III restriction protein res subunit  30.21 
 
 		 908 aa  44.7  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>