63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1149 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1114  type III restriction-modification system, restriction endonuclease subunit  47.14 
 
 		 1019 aa  888    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.189519  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1149  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 1024 aa  2095    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.511254  normal  0.0779427 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1522  type III restriction protein res subunit  44.64 
 
 		 1008 aa  796    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000221168  hitchhiker  0.00161886 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0155  type III restriction protein res subunit  38.56 
 
 		 1009 aa  639    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.156015  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2246  type III restriction enzyme, res subunit  43.73 
 
 		 1033 aa  813    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.428313  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5226  type III restriction protein res subunit  43.7 
 
 		 1018 aa  830    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.310365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3485  type III restriction enzyme, res subunit  45.59 
 
 		 1019 aa  853    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340393  normal  0.439729 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2486  type III restriction enzyme, res subunit  44.97 
 
 		 1010 aa  841    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.252383  decreased coverage  0.0052761 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0544  type III restriction enzyme, res subunit  46.01 
 
 		 1012 aa  876    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0929  type III restriction protein res subunit  39.44 
 
 		 1060 aa  714    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2729  restriction endonuclease  45.37 
 
 		 909 aa  757    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2180  Type III site-specific deoxyribonuclease  39.74 
 
 		 984 aa  630  1e-179  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0518  type III restriction enzyme, res subunit  38.48 
 
 		 991 aa  610  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0365  type III restriction protein res subunit  37.81 
 
 		 978 aa  599  1e-170  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000898416 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4592  Type III site-specific deoxyribonuclease  37.05 
 
 		 997 aa  583  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0162  type III restriction enzyme, res subunit  36.99 
 
 		 998 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000922186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4204  type III restriction protein res subunit  35.95 
 
 		 1001 aa  580  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416822  normal  0.0251436 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1393  type III restriction protein res subunit  37.51 
 
 		 993 aa  581  1e-164  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0790  type III restriction enzyme, res subunit  36.25 
 
 		 992 aa  575  1.0000000000000001e-162  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186387 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1742  type III restriction system endonuclease  35.89 
 
 		 990 aa  553  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109484  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0236  type III restriction enzyme, res subunit  35.7 
 
 		 991 aa  551  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1547  type III restriction system endonuclease  36.73 
 
 		 989 aa  549  1e-155  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2927  Type III restriction enzyme, res subunit  35.04 
 
 		 1010 aa  535  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00341327  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3281  type III restriction-modification system, res subunit  34.41 
 
 		 1009 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2673  type III restriction-modification system, res subunit  34.41 
 
 		 1009 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1846  type III restriction-modification system, res subunit  34.41 
 
 		 1009 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0047  Type III restriction enzyme, res subunit  33.56 
 
 		 1009 aa  525  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0047  Type III restriction enzyme, res subunit  33.56 
 
 		 1009 aa  525  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2706  Type III restriction enzyme, res subunit  34.41 
 
 		 1009 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1130  type III restriction system endonuclease  36.05 
 
 		 991 aa  525  1e-147  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0260  type III restriction system endonuclease  33.56 
 
 		 1009 aa  525  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0028  type III restriction protein res subunit  33.82 
 
 		 1008 aa  520  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1948  type III restriction protein res subunit  35.84 
 
 		 982 aa  523  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0042  type III restriction-modification system, res subunit  33.11 
 
 		 1009 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0027  type III restriction enzyme, res subunit  33.3 
 
 		 1008 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0028  type III restriction protein res subunit  33.56 
 
 		 1004 aa  512  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0019  type III restriction enzyme, res subunit  33.46 
 
 		 1011 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0043  type III restriction enzyme, res subunit  33.3 
 
 		 1008 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.855331  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0046  type III restriction protein res subunit  33.33 
 
 		 1008 aa  509  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3212  Type III restriction enzyme, res subunit  33.14 
 
 		 1008 aa  506  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.505736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05380  restriction endonuclease  32.41 
 
 		 1001 aa  462  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224122  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0849  Type III site-specific deoxyribonuclease  33.24 
 
 		 998 aa  434  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1827  type III restriction enzyme, res subunit  33.74 
 
 		 1032 aa  434  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3046  Type III site-specific deoxyribonuclease  32.32 
 
 		 994 aa  429  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0515  type III restriction enzyme, res subunit  41.96 
 
 		 877 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0226  type III restriction protein res subunit  42.54 
 
 		 887 aa  424  1e-117  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000256753 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0566  Type III site-specific deoxyribonuclease  41.17 
 
 		 891 aa  406  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0796023 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0579  Type III site-specific deoxyribonuclease  40.69 
 
 		 891 aa  405  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.193547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1200  hypothetical protein  31.85 
 
 		 1076 aa  395  1e-108  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.563874  normal  0.0639023 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0362  type III restriction-modification system, res subunit  30.94 
 
 		 1054 aa  350  9e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.262363  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1463  restriction endonuclease  29.58 
 
 		 991 aa  188  5e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1019  type III restriction-modification system enzyme, R subunit  30.49 
 
 		 987 aa  173  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0393  type III restriction-modification system StyLTI enzyme res  25.07 
 
 		 989 aa  171  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00360009  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0411  type III restriction-modification system StyLTI enzyme res  24.98 
 
 		 989 aa  169  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.63396  hitchhiker  0.00000141502 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0453  type III restriction-modification system StyLTI enzyme res  25.07 
 
 		 989 aa  168  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985709  hitchhiker  1.2237e-22 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0398  type III restriction-modification system StyLTI enzyme res  24.98 
 
 		 989 aa  167  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982266  hitchhiker  7.86285e-19 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0390  type III restriction-modification system StyLTI enzyme res  29.56 
 
 		 989 aa  166  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.264054  hitchhiker  1.42432e-23 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2728  putative transposase  51.22 
 
 		 441 aa  120  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3802  type III restriction protein res subunit  32.26 
 
 		 894 aa  52  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1979  type III restriction protein res subunit  39.47 
 
 		 896 aa  51.6  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3325  type III restriction enzyme, res subunit  34.21 
 
 		 930 aa  47  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.16803  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0344  type III restriction protein res subunit  31.96 
 
 		 893 aa  44.7  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3655  Type III restriction-modification enzyme helicase subunit  24.12 
 
 		 911 aa  44.7  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00000324142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>