64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0411 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1463  restriction endonuclease  55.24 
 
 
991 aa  1054    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1019  type III restriction-modification system enzyme, R subunit  63.8 
 
 
987 aa  1333    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0398  type III restriction-modification system StyLTI enzyme res  99.09 
 
 
989 aa  2023    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982266  hitchhiker  7.86285e-19 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0453  type III restriction-modification system StyLTI enzyme res  99.09 
 
 
989 aa  2023    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985709  hitchhiker  1.2237e-22 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0411  type III restriction-modification system StyLTI enzyme res  100 
 
 
989 aa  2043    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.63396  hitchhiker  0.00000141502 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0393  type III restriction-modification system StyLTI enzyme res  99.39 
 
 
989 aa  2031    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00360009  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0390  type III restriction-modification system StyLTI enzyme res  98.99 
 
 
989 aa  2020    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.264054  hitchhiker  1.42432e-23 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2180  Type III site-specific deoxyribonuclease  26.82 
 
 
984 aa  210  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0515  type III restriction enzyme, res subunit  31.36 
 
 
877 aa  208  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0566  Type III site-specific deoxyribonuclease  30.5 
 
 
891 aa  201  3.9999999999999996e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0796023 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0579  Type III site-specific deoxyribonuclease  30.17 
 
 
891 aa  201  3.9999999999999996e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.193547  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0518  type III restriction enzyme, res subunit  31.13 
 
 
991 aa  201  7e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1522  type III restriction protein res subunit  30.49 
 
 
1008 aa  191  7e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000221168  hitchhiker  0.00161886 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2927  Type III restriction enzyme, res subunit  29.73 
 
 
1010 aa  190  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00341327  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0236  type III restriction enzyme, res subunit  25.37 
 
 
991 aa  189  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2486  type III restriction enzyme, res subunit  30.8 
 
 
1010 aa  186  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.252383  decreased coverage  0.0052761 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1393  type III restriction protein res subunit  25.47 
 
 
993 aa  185  3e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1130  type III restriction system endonuclease  25.92 
 
 
991 aa  184  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0929  type III restriction protein res subunit  29.69 
 
 
1060 aa  183  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0155  type III restriction protein res subunit  24.48 
 
 
1009 aa  184  1e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.156015  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3485  type III restriction enzyme, res subunit  29.8 
 
 
1019 aa  182  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340393  normal  0.439729 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0162  type III restriction enzyme, res subunit  26.28 
 
 
998 aa  182  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000922186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5226  type III restriction protein res subunit  30.83 
 
 
1018 aa  180  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.310365  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4204  type III restriction protein res subunit  29.6 
 
 
1001 aa  179  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416822  normal  0.0251436 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2246  type III restriction enzyme, res subunit  30.05 
 
 
1033 aa  179  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.428313  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0226  type III restriction protein res subunit  29.03 
 
 
887 aa  177  7e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000256753 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0365  type III restriction protein res subunit  30.91 
 
 
978 aa  176  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000898416 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4592  Type III site-specific deoxyribonuclease  30.53 
 
 
997 aa  176  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2729  restriction endonuclease  30.27 
 
 
909 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1114  type III restriction-modification system, restriction endonuclease subunit  29.82 
 
 
1019 aa  173  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.189519  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1547  type III restriction system endonuclease  29.71 
 
 
989 aa  173  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2706  Type III restriction enzyme, res subunit  29.47 
 
 
1009 aa  172  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0047  Type III restriction enzyme, res subunit  29.47 
 
 
1009 aa  172  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0047  Type III restriction enzyme, res subunit  29.47 
 
 
1009 aa  172  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2673  type III restriction-modification system, res subunit  29.47 
 
 
1009 aa  172  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1846  type III restriction-modification system, res subunit  29.47 
 
 
1009 aa  172  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0260  type III restriction system endonuclease  29.47 
 
 
1009 aa  172  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3281  type III restriction-modification system, res subunit  29.47 
 
 
1009 aa  172  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1742  type III restriction system endonuclease  24.45 
 
 
990 aa  172  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109484  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0042  type III restriction-modification system, res subunit  29.06 
 
 
1009 aa  172  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05380  restriction endonuclease  28.89 
 
 
1001 aa  171  7e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224122  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0790  type III restriction enzyme, res subunit  29.97 
 
 
992 aa  171  7e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.186387 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1948  type III restriction protein res subunit  29.31 
 
 
982 aa  171  8e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1827  type III restriction enzyme, res subunit  30.2 
 
 
1032 aa  170  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1200  hypothetical protein  28.67 
 
 
1076 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.563874  normal  0.0639023 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0028  type III restriction protein res subunit  30.07 
 
 
1008 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511623  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1149  type III restriction protein res subunit  29.56 
 
 
1024 aa  167  9e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.511254  normal  0.0779427 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0027  type III restriction enzyme, res subunit  29.98 
 
 
1008 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0043  type III restriction enzyme, res subunit  29.98 
 
 
1008 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.855331  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0544  type III restriction enzyme, res subunit  31.49 
 
 
1012 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0019  type III restriction enzyme, res subunit  29.57 
 
 
1011 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0046  type III restriction protein res subunit  29.74 
 
 
1008 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0028  type III restriction protein res subunit  29.57 
 
 
1004 aa  165  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3212  Type III restriction enzyme, res subunit  29.98 
 
 
1008 aa  165  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.505736  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0362  type III restriction-modification system, res subunit  26.07 
 
 
1054 aa  155  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.262363  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3046  Type III site-specific deoxyribonuclease  29.24 
 
 
994 aa  154  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0849  Type III site-specific deoxyribonuclease  29.91 
 
 
998 aa  144  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1462  superfamily II DNA/RNA helicase  36 
 
 
736 aa  46.6  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1086  type III restriction enzyme, res subunit  37.25 
 
 
840 aa  46.6  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.865892  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3325  type III restriction enzyme, res subunit  55.56 
 
 
930 aa  46.2  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.16803  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3655  Type III restriction-modification enzyme helicase subunit  35.63 
 
 
911 aa  44.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00000324142  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0937  hypothetical protein  35.63 
 
 
911 aa  45.1  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000206148  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4389  type III restriction enzyme, res subunit  42.55 
 
 
858 aa  44.7  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0026  type III restriction-modification system, R subunit, putative  35.63 
 
 
882 aa  44.7  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.352538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>