185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3520 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  100 
 
 		 390 aa  765    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  43.11 
 
 		 375 aa  241  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  37.88 
 
 		 381 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  37.88 
 
 		 381 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  37.37 
 
 		 381 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  39.39 
 
 		 381 aa  226  6e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  37.11 
 
 		 381 aa  226  7e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  37.5 
 
 		 378 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  38.32 
 
 		 379 aa  220  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  37.69 
 
 		 376 aa  219  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  40.37 
 
 		 376 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  35.41 
 
 		 391 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  36.99 
 
 		 391 aa  213  5.999999999999999e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  34.42 
 
 		 385 aa  210  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  34.97 
 
 		 389 aa  209  5e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  33.84 
 
 		 386 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  34.5 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  34.96 
 
 		 379 aa  204  3e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0115  N-methyltryptophan oxidase  38.52 
 
 		 377 aa  199  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  33.75 
 
 		 391 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  35.86 
 
 		 443 aa  193  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  35.86 
 
 		 428 aa  193  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  36.99 
 
 		 390 aa  192  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  36.32 
 
 		 389 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  36.36 
 
 		 391 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  32.65 
 
 		 371 aa  176  8e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  29.31 
 
 		 371 aa  169  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  29.31 
 
 		 371 aa  169  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  29.31 
 
 		 371 aa  169  9e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  30.89 
 
 		 372 aa  166  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  31.17 
 
 		 372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  31.17 
 
 		 372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  31.17 
 
 		 372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  30.26 
 
 		 372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  30.26 
 
 		 372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  30 
 
 		 372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  30.26 
 
 		 372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  31.17 
 
 		 372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  29.85 
 
 		 373 aa  164  3e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  29.74 
 
 		 372 aa  164  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  30 
 
 		 372 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  30 
 
 		 372 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  29.74 
 
 		 372 aa  162  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  30 
 
 		 372 aa  162  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1558  sarcosine oxidase  33.24 
 
 		 394 aa  157  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467304  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5312  FAD dependent oxidoreductase  28.69 
 
 		 379 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  34.11 
 
 		 384 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  29.92 
 
 		 372 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  30.15 
 
 		 395 aa  145  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4345  Sarcosine oxidase  34.34 
 
 		 380 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  33.16 
 
 		 383 aa  139  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3775  sarcosine oxidase, putative  32.55 
 
 		 382 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000086866 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3678  Sarcosine oxidase  36.5 
 
 		 376 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8831  FAD dependent oxidoreductase  31.71 
 
 		 402 aa  126  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276493  hitchhiker  0.00295943 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 		 363 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6193  Sarcosine oxidase  34.46 
 
 		 352 aa  119  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522956  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0077  sarcosine oxidase  32.51 
 
 		 366 aa  119  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3521  Sarcosine oxidase  31.54 
 
 		 389 aa  119  9e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  24.26 
 
 		 394 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34590  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  33.95 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0115291  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2363  Sarcosine oxidase  31.52 
 
 		 392 aa  113  6e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182058  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47550  predicted protein  28.61 
 
 		 452 aa  112  9e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  29.41 
 
 		 397 aa  106  6e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4128  FAD dependent oxidoreductase  34.2 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0224  putative sarcosine oxidase  30.69 
 
 		 396 aa  104  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2073  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 372 aa  93.2  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.568265  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3930  FAD dependent oxidoreductase  31.72 
 
 		 355 aa  92.8  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1845  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 		 422 aa  88.6  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0194  putative sarcosine oxidase  26.01 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7077  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 		 394 aa  74.7  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08446  conserved hypothetical protein  26.57 
 
 		 478 aa  73.2  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  24.32 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  24.29 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6672  FAD dependent oxidoreductase  23.34 
 
 		 398 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2901  sarcosine oxidase  27.27 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  25.87 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5086  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00135818  normal  0.404785 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  25.12 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  27.36 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  27.36 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  25.5 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  22.88 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1492  FAD dependent oxidoreductase  21.32 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  26.33 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  23.48 
 
 		 394 aa  59.3  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02786  conserved hypothetical protein  25.06 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3340  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0285888  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  34.26 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2865  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.181077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08657  fructosyl amino acid oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06440)  23.39 
 
 		 615 aa  57.4  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.683305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  22.87 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  26.62 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>