More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2934 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2934  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 		 406 aa  807    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2171  protein serine/threonine phosphatase  43.91 
 
 		 389 aa  289  6e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.529271  hitchhiker  0.000569605 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1626  protein serine/threonine phosphatase  40.37 
 
 		 412 aa  271  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4365  protein serine/threonine phosphatase  42.43 
 
 		 405 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3121  protein serine/threonine phosphatase  40.46 
 
 		 415 aa  249  8e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1306  protein serine/threonine phosphatase  38.66 
 
 		 406 aa  239  5e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3204  protein serine/threonine phosphatase  39.75 
 
 		 425 aa  227  3e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000275755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5396  protein serine/threonine phosphatase  37.02 
 
 		 412 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0122  Stage II sporulation E family protein  37.07 
 
 		 428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.671125  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4712  protein serine/threonine phosphatase  35.53 
 
 		 431 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2194  Stage II sporulation E family protein  38.85 
 
 		 423 aa  212  7.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3042  protein serine/threonine phosphatase  36.83 
 
 		 492 aa  201  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0802508  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0436  Stage II sporulation E family protein  34.48 
 
 		 414 aa  107  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185971  normal  0.30296 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3860  protein serine/threonine phosphatase  30.68 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0848  protein serine/threonine phosphatase  34.05 
 
 		 369 aa  92.8  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509752  normal  0.225073 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  30.88 
 
 		 754 aa  91.3  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4114  protein serine/threonine phosphatase  26.65 
 
 		 426 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5452  protein serine/threonine phosphatase  32.71 
 
 		 400 aa  90.1  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180738  normal  0.458665 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.84 
 
 		 388 aa  89.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  28.41 
 
 		 705 aa  87.4  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  30.14 
 
 		 376 aa  87  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  27.42 
 
 		 486 aa  86.7  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  28.02 
 
 		 683 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2409  Stage II sporulation E family protein  31.98 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  25.48 
 
 		 705 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  31.27 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2794  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  30.96 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  25.9 
 
 		 684 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2796  protein phosphatase 2C-like  26.62 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2013  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.49 
 
 		 411 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.155477  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  31.34 
 
 		 361 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  32.42 
 
 		 708 aa  77.8  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  27.82 
 
 		 649 aa  78.2  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1833  putative PAS/PAC sensor protein  25.95 
 
 		 560 aa  77.4  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  26.91 
 
 		 649 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  26.09 
 
 		 445 aa  76.3  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3720  protein serine/threonine phosphatase  29.8 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1432  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.9 
 
 		 407 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.81 
 
 		 957 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3094  putative PAS/PAC sensor protein  28.26 
 
 		 519 aa  74.7  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  28.51 
 
 		 445 aa  74.3  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0864  putative PAS/PAC sensor protein  27.64 
 
 		 633 aa  73.9  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  29.17 
 
 		 644 aa  73.9  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1516  putative PAS/PAC sensor protein  28.45 
 
 		 545 aa  73.9  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00955123  decreased coverage  0.00000000236227 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  31.07 
 
 		 581 aa  73.6  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.96 
 
 		 563 aa  73.2  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  27.81 
 
 		 642 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.71 
 
 		 606 aa  73.2  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2410  protein serine/threonine phosphatase  28.35 
 
 		 660 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0032  stage II sporulation E family protein  30.41 
 
 		 365 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  30.84 
 
 		 451 aa  72.8  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  29.76 
 
 		 413 aa  72.8  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4609  protein serine/threonine phosphatase  30.52 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.919573  decreased coverage  0.0000074817 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0115  Stage II sporulation E family protein  25.78 
 
 		 429 aa  72.4  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1860  protein serine/threonine phosphatase  27.04 
 
 		 396 aa  72  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3648  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.68 
 
 		 380 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0699  protein serine/threonine phosphatase  29.96 
 
 		 379 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  28.57 
 
 		 846 aa  71.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  25.57 
 
 		 1100 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0249  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  30.14 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1424  response regulator receiver modulated serine phosphatase  20.06 
 
 		 496 aa  70.9  0.00000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.51 
 
 		 486 aa  70.5  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.646626  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2647  response regulator receiver protein  28.97 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0228439  normal  0.825958 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3218  Stage II sporulation E family protein  25.43 
 
 		 630 aa  69.7  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717708  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3071  protein serine/threonine phosphatase  35.11 
 
 		 260 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5014  serine phosphatase  24.38 
 
 		 459 aa  68.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6901  protein serine/threonine phosphatase  29.25 
 
 		 400 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.473487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.91 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25.48 
 
 		 1332 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  27.56 
 
 		 642 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2796  cyclic nucleotide-binding protein  29.41 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180681  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1524  putative PAS/PAC sensor protein  26.36 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  26.24 
 
 		 687 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  29.26 
 
 		 648 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.21 
 
 		 961 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0877  regulatory protein, putative  26.03 
 
 		 650 aa  67  0.0000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.410467  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25.33 
 
 		 1480 aa  67  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0174  serine phosphatase  26.49 
 
 		 390 aa  67  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.872629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0825  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.72 
 
 		 526 aa  66.6  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.126425  normal  0.339318 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2166  putative PAS/PAC sensor protein  24.5 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3781  protein serine/threonine phosphatase  26.03 
 
 		 682 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.597612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2155  protein serine/threonine phosphatase  22.96 
 
 		 362 aa  65.9  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0441189  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0999  response regulator receiver protein  24.23 
 
 		 452 aa  65.9  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.766542  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  28.9 
 
 		 366 aa  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  25.93 
 
 		 1079 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1522  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.51 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1210  response regulator receiver protein  27.4 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0544929  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1472  serine phosphatase  25.5 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0392  serine phosphatase  31.43 
 
 		 233 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0288764  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  24.83 
 
 		 706 aa  65.1  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2035  serine phosphatase  27.95 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2179  sigma factor regulation protein  25.64 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.116997  normal  0.843172 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1513  stage II sporulation E family protein  27.57 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2870  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  30.85 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  24.24 
 
 		 566 aa  64.7  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5915  protein serine/threonine phosphatase  30.77 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1832  putative PAS/PAC sensor protein  25.86 
 
 		 543 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2801  protein serine/threonine phosphatase  27.2 
 
 		 705 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.079945 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0085  protein serine/threonine phosphatase  33.18 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.611394  normal  0.0411446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>