More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0360 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  100 
 
 		 652 aa  1316    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  69.62 
 
 		 559 aa  575  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  56.32 
 
 		 430 aa  465  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  50.09 
 
 		 762 aa  463  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  48.41 
 
 		 854 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  45.66 
 
 		 703 aa  431  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  50.12 
 
 		 425 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0580  glycosyl hydrolase family chitinase  48.76 
 
 		 400 aa  377  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  49.76 
 
 		 521 aa  364  3e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0868  glycosyl hydrolase family chitinase  45.26 
 
 		 451 aa  346  7e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  44.02 
 
 		 455 aa  309  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0191903 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  45.05 
 
 		 414 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  41.72 
 
 		 763 aa  306  1.0000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0763  Chitinase  41.32 
 
 		 439 aa  302  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.713777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  43.72 
 
 		 472 aa  300  8e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  40.14 
 
 		 675 aa  290  6e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  37.97 
 
 		 662 aa  282  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  39.43 
 
 		 586 aa  272  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  40.1 
 
 		 536 aa  259  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  40.15 
 
 		 542 aa  250  5e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  39.86 
 
 		 539 aa  250  5e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  39.19 
 
 		 532 aa  250  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  38.44 
 
 		 540 aa  246  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  39.3 
 
 		 651 aa  245  1.9999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  36.56 
 
 		 674 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  38.93 
 
 		 792 aa  242  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  38.13 
 
 		 540 aa  241  4e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  37.62 
 
 		 484 aa  239  8e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  35.96 
 
 		 674 aa  239  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  35.96 
 
 		 674 aa  239  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  36.63 
 
 		 674 aa  237  6e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  35.92 
 
 		 482 aa  236  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  36.28 
 
 		 674 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  36.28 
 
 		 674 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  36.28 
 
 		 674 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  36.28 
 
 		 674 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  36.28 
 
 		 674 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  36.05 
 
 		 674 aa  234  5e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  35.57 
 
 		 674 aa  230  8e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  29.21 
 
 		 639 aa  223  6e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  33.49 
 
 		 1271 aa  213  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  32.64 
 
 		 1080 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  34.44 
 
 		 868 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  31.55 
 
 		 848 aa  202  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  32.95 
 
 		 652 aa  201  3.9999999999999996e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  33.18 
 
 		 868 aa  201  5e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  31.67 
 
 		 869 aa  198  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  33.65 
 
 		 868 aa  197  6e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  33.18 
 
 		 868 aa  196  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  32.7 
 
 		 867 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  33.18 
 
 		 868 aa  193  9e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  33.26 
 
 		 863 aa  193  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  30.67 
 
 		 848 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  32.84 
 
 		 372 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  30.39 
 
 		 855 aa  191  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  30.62 
 
 		 563 aa  191  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  34.26 
 
 		 396 aa  190  8e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  32.38 
 
 		 868 aa  186  9e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  32.86 
 
 		 388 aa  184  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  34.78 
 
 		 377 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  31.21 
 
 		 972 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  33.77 
 
 		 401 aa  179  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21404 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  31.31 
 
 		 398 aa  174  3.9999999999999995e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  30.39 
 
 		 657 aa  172  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  33.33 
 
 		 373 aa  171  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  30.6 
 
 		 505 aa  169  2e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  32.96 
 
 		 355 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  28.87 
 
 		 463 aa  152  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  31.05 
 
 		 382 aa  148  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  29.3 
 
 		 431 aa  146  9e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  28.57 
 
 		 499 aa  144  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  41.78 
 
 		 613 aa  144  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  41.74 
 
 		 552 aa  140  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  31.41 
 
 		 563 aa  136  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  44.22 
 
 		 562 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  26.48 
 
 		 1578 aa  128  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  27.27 
 
 		 997 aa  127  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  29.68 
 
 		 1362 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  26.85 
 
 		 634 aa  123  9e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  40.68 
 
 		 514 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  27.09 
 
 		 407 aa  122  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  27.58 
 
 		 861 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08481  conserved hypothetical protein  27.46 
 
 		 1443 aa  120  7e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293821  normal  0.840372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  27.67 
 
 		 855 aa  117  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  25.77 
 
 		 1127 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  26.13 
 
 		 1127 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  26.13 
 
 		 1127 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  26.13 
 
 		 1127 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  25.81 
 
 		 1129 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  27.74 
 
 		 1782 aa  115  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09390  Chitinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ9]  27.13 
 
 		 1132 aa  113  9e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.099502 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  25.46 
 
 		 1146 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2070  glycoside hydrolase family protein  27.68 
 
 		 465 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  27.05 
 
 		 772 aa  112  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4757  glycoside hydrolase family protein  28.91 
 
 		 364 aa  112  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385862  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0592  putative chitinase  26.79 
 
 		 760 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00549  conserved hypothetical protein  26.57 
 
 		 1246 aa  108  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.500879 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  27.44 
 
 		 904 aa  107  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  25.92 
 
 		 1051 aa  104  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  26.33 
 
 		 1053 aa  100  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>