More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2388 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2388  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 267 aa  525  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000136805  decreased coverage  0.000110172 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4088  transcriptional regulator, IclR family  67.77 
 
 		 275 aa  355  2.9999999999999997e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.855439  hitchhiker  0.000570848 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  35.86 
 
 		 270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2456  transcriptional regulator, IclR family  37.85 
 
 		 266 aa  118  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248538  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3545  transcriptional regulator, IclR family  34.55 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0480157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  33.73 
 
 		 248 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0559  regulatory proteins, IclR  33.6 
 
 		 249 aa  102  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  35.77 
 
 		 253 aa  102  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1725  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200124  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 260 aa  97.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2824  transcriptional regulator, IclR family  35.75 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00611258  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2185  transcriptional regulator, IclR family  35.41 
 
 		 259 aa  97.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2285  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 261 aa  95.9  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  32.83 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  32.04 
 
 		 255 aa  90.5  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 267 aa  89.7  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  30.69 
 
 		 275 aa  89.7  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  31.85 
 
 		 253 aa  89.4  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4896  transcriptional regulator, IclR family  33.61 
 
 		 256 aa  89  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 258 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  32.18 
 
 		 259 aa  87.8  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4083  transcriptional regulator, IclR family  32.24 
 
 		 264 aa  87  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  31.09 
 
 		 252 aa  85.5  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1675  regulatory proteins, IclR  32.34 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  32.86 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1725  regulatory proteins, IclR  32.34 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.581067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1741  regulatory proteins, IclR  32.34 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  31.53 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  31.97 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  32.67 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  26.45 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2875  IclR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  26.94 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4954  transcriptional regulator, IclR family  30.18 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  26.86 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3485  IclR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0531  regulatory protein, IclR  32.41 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  32.21 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  32.06 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  27.46 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  29.06 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2147  transcriptional regulator, IclR family  26.53 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  31.61 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1652  IclR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  27.27 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3996  IclR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285911 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  28.84 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2811  IclR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.667309  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  29.74 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  33.01 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3360  IclR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233757  normal  0.0607813 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3913  transcriptional regulator, IclR family  26.7 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0434  transcriptional regulator, IclR family  31.11 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  27.71 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1955  IclR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 268 aa  72  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 238 aa  72  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  27.56 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  26.02 
 
 		 257 aa  72  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 269 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 269 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 269 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  27.69 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 269 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  28.64 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1022  Transcriptional regulator IclR  33.04 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157086  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  28.64 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4105  transcriptional regulator, IclR family  26.07 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  29.46 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0202  regulatory proteins, IclR  31.71 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1491  IclR family transcriptional regulator  29 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2063  transcriptional regulator IclR  28.28 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0428372  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1811  IclR family transcriptional regulator  29 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0797  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  29 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2114  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  29 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.247685  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  29.61 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3106  IclR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184655 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2886  IclR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187395 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  30.37 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3524  transcriptional regulator, IclR family  32.08 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0262  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0480  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  28.57 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0382  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  28.57 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>