More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1030 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1030  protein of unknown function UPF0126  100 
 
 		 226 aa  427  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1950  protein of unknown function UPF0126  54.55 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.791374  hitchhiker  0.00643781 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15050  predicted membrane protein  44.78 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0337653  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  41.21 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1926  protein of unknown function UPF0126  39.6 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3086  protein of unknown function UPF0126  38.16 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4671  protein of unknown function UPF0126  36.65 
 
 		 245 aa  99.8  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0543686  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3187  protein of unknown function UPF0126  39.64 
 
 		 222 aa  99.8  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.120724  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0012  hypothetical protein  40.85 
 
 		 216 aa  97.8  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  32.84 
 
 		 205 aa  97.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  32.02 
 
 		 205 aa  96.3  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  37.57 
 
 		 219 aa  95.5  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1144  hypothetical protein  33.66 
 
 		 217 aa  95.1  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.422721  normal  0.397537 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  37.19 
 
 		 209 aa  94.7  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1699  protein of unknown function UPF0126  38.81 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0237886  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2822  protein of unknown function UPF0126  38.56 
 
 		 218 aa  92.4  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443209 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  33.16 
 
 		 213 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  33.16 
 
 		 213 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  33.16 
 
 		 213 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  33.16 
 
 		 213 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1854  protein of unknown function UPF0126  41.62 
 
 		 210 aa  92  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  28.43 
 
 		 203 aa  92  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  34.5 
 
 		 215 aa  92  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  30.35 
 
 		 209 aa  92  7e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2988  hypothetical protein  36.09 
 
 		 222 aa  92  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00741318  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20410  predicted membrane protein  34.57 
 
 		 303 aa  91.3  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0830  protein of unknown function UPF0126  38.42 
 
 		 251 aa  90.9  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1683  hypothetical protein  35.1 
 
 		 220 aa  91.3  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000472975 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  32.64 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5955  hypothetical protein  36.71 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0408387  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  37.88 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1575  protein of unknown function UPF0126  34.66 
 
 		 211 aa  90.1  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  35.5 
 
 		 221 aa  90.1  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0761  hypothetical protein  41.83 
 
 		 212 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0767  hypothetical protein  41.83 
 
 		 212 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0781  hypothetical protein  41.83 
 
 		 212 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0683  protein of unknown function UPF0126  42.93 
 
 		 208 aa  88.6  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00397825 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2715  protein of unknown function UPF0126  31.98 
 
 		 317 aa  88.6  8e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  31.77 
 
 		 213 aa  88.2  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3482  hypothetical protein  33.33 
 
 		 202 aa  88.2  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2951  hypothetical protein  37.95 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.184845 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  32.29 
 
 		 213 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  32.29 
 
 		 213 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  33.83 
 
 		 208 aa  88.2  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2399  protein of unknown function UPF0126  39.74 
 
 		 264 aa  87.4  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.53799 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  38.99 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  36.68 
 
 		 206 aa  87.4  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  32.29 
 
 		 213 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12810  predicted membrane protein  41.86 
 
 		 211 aa  86.7  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.17096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  34.17 
 
 		 201 aa  86.7  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  35.17 
 
 		 205 aa  86.3  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0991  hypothetical protein  40.54 
 
 		 212 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  41.83 
 
 		 207 aa  85.5  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  32.84 
 
 		 209 aa  85.1  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0571  protein of unknown function UPF0126  37.18 
 
 		 211 aa  85.1  8e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0584  hypothetical protein  32.1 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.810175  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  34 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  32.66 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  41.83 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3716  hypothetical protein  38.74 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  36.6 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0628  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.0000000261982  hitchhiker  0.0000034229 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  36.26 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3402  protein of unknown function UPF0126  42.55 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.525112  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  37.97 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0584  hypothetical protein  38.89 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  32.65 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  37.34 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2576  hypothetical protein  33.16 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  37.34 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0857  hypothetical protein  34.53 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0874  protein of unknown function UPF0126  32.51 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0778284  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2812  hypothetical protein  32.48 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1580  hypothetical protein  30 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  27.41 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0456  protein of unknown function UPF0126  34.83 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3127  hypothetical protein  31.78 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  32.84 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  38.82 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0632  hypothetical protein  30.5 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  33.99 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  33.85 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3728  hypothetical protein  36.04 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0596  hypothetical protein  34.57 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0375  hypothetical protein  33.99 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  38.56 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1493  hypothetical protein  32.34 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1098  putative transmembrane protein  34.67 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1122  hypothetical protein  34.8 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218904  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1831  hypothetical protein  34.8 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110728  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1774  hypothetical protein  34.8 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0340  hypothetical protein  34.8 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.631596  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1723  protein of unknown function UPF0126  35.53 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000275275  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0831  hypothetical protein  34.8 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144812  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  37.5 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1115  membrane protein  38.46 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  35.71 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  35.71 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  35.71 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  35.71 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>