More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0497 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  58.98 
 
 		 876 aa  755    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  61.58 
 
 		 751 aa  750    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  100 
 
 		 732 aa  1393    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  55.93 
 
 		 715 aa  639    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  44.37 
 
 		 711 aa  475  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  46.09 
 
 		 723 aa  468  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  41.69 
 
 		 842 aa  457  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  42.96 
 
 		 731 aa  429  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  39.94 
 
 		 729 aa  429  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  41.68 
 
 		 755 aa  425  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  42.25 
 
 		 735 aa  425  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  39.45 
 
 		 743 aa  422  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  40.17 
 
 		 728 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  38.45 
 
 		 735 aa  417  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  39.81 
 
 		 737 aa  415  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  41.67 
 
 		 734 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  41.99 
 
 		 793 aa  413  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  38.97 
 
 		 735 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  41.92 
 
 		 735 aa  411  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  41.1 
 
 		 832 aa  411  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  38.92 
 
 		 758 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  40.08 
 
 		 752 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  40.62 
 
 		 723 aa  403  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  39.03 
 
 		 917 aa  400  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  39.04 
 
 		 732 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  36.56 
 
 		 734 aa  401  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  39.42 
 
 		 717 aa  402  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  39.47 
 
 		 740 aa  391  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  42.37 
 
 		 714 aa  387  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  36.8 
 
 		 909 aa  386  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  41.69 
 
 		 724 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  40.49 
 
 		 750 aa  383  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  37.99 
 
 		 760 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  37.06 
 
 		 796 aa  383  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  36.18 
 
 		 920 aa  374  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  36.91 
 
 		 742 aa  372  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  39.39 
 
 		 737 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  39.35 
 
 		 761 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  34.99 
 
 		 787 aa  362  1e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  39.49 
 
 		 743 aa  361  3e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  39.67 
 
 		 726 aa  358  9.999999999999999e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  35.19 
 
 		 772 aa  356  6.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  35.19 
 
 		 772 aa  356  7.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  35.19 
 
 		 772 aa  356  7.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  30.47 
 
 		 829 aa  354  4e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  30.47 
 
 		 829 aa  354  4e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  34.72 
 
 		 779 aa  352  1e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  35.03 
 
 		 781 aa  352  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  39.03 
 
 		 734 aa  350  4e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  37.97 
 
 		 718 aa  350  5e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  39.6 
 
 		 807 aa  348  2e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  37.67 
 
 		 1002 aa  345  2e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  40.03 
 
 		 732 aa  341  2.9999999999999998e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  36.39 
 
 		 779 aa  335  2e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  30.12 
 
 		 893 aa  330  4e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  38.4 
 
 		 854 aa  330  7e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  40.33 
 
 		 724 aa  328  3e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  34.08 
 
 		 1382 aa  323  8e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  37.82 
 
 		 1058 aa  321  3e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  32.19 
 
 		 704 aa  321  3.9999999999999996e-86  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.51 
 
 		 746 aa  318  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  37.96 
 
 		 1092 aa  317  3e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  35.68 
 
 		 729 aa  318  3e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  32.75 
 
 		 979 aa  316  8e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  36.16 
 
 		 983 aa  315  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  36.16 
 
 		 983 aa  315  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  34.24 
 
 		 784 aa  310  5e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  33.15 
 
 		 978 aa  310  5e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  36.9 
 
 		 903 aa  308  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  34.6 
 
 		 749 aa  306  1.0000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  35.5 
 
 		 843 aa  305  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5635  MMPL domain protein  40.09 
 
 		 734 aa  302  1e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.593241 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  37.86 
 
 		 726 aa  302  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  36.1 
 
 		 840 aa  300  4e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  37.77 
 
 		 737 aa  300  9e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  34.36 
 
 		 966 aa  299  1e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  36.61 
 
 		 968 aa  298  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  36.99 
 
 		 787 aa  298  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  33.81 
 
 		 791 aa  295  1e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  36.73 
 
 		 903 aa  292  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  34.58 
 
 		 958 aa  291  3e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  41.41 
 
 		 743 aa  291  4e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  37.93 
 
 		 738 aa  288  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  37.04 
 
 		 740 aa  283  7.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0755  MMPL domain protein  40.17 
 
 		 726 aa  274  5.000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383711  hitchhiker  0.00656683 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0204  MMPL domain protein  49.86 
 
 		 776 aa  265  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  32.65 
 
 		 743 aa  263  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  34.07 
 
 		 710 aa  261  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  31.15 
 
 		 741 aa  258  3e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  34.28 
 
 		 733 aa  258  4e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  33.79 
 
 		 846 aa  258  4e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  34.78 
 
 		 758 aa  257  5e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.47 
 
 		 738 aa  254  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  31.09 
 
 		 758 aa  254  5.000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0144  MMPL domain-containing protein  35.17 
 
 		 718 aa  250  8e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  33.59 
 
 		 761 aa  249  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  36.71 
 
 		 736 aa  244  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  36.49 
 
 		 737 aa  243  6e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0724  MMPL domain protein  32.12 
 
 		 718 aa  241  5e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  32.05 
 
 		 766 aa  240  5.999999999999999e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>