296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0032 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0032  NusA family protein  100 
 
 		 143 aa  286  5.0000000000000004e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3689  transcription elongation factor NusA-like protein  58.04 
 
 		 141 aa  177  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.167967 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1200  NusA family KH domain protein  47.18 
 
 		 143 aa  153  6e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1174  transcription elongation factor NusA-like protein  51.05 
 
 		 141 aa  152  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000440347  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1929  NusA family protein  49.3 
 
 		 154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0303  NusA family protein  50.35 
 
 		 149 aa  147  4e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.212919  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0317  NusA family protein  50.35 
 
 		 149 aa  147  4e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0703108  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2164  NusA family KH domain protein  47.55 
 
 		 148 aa  144  6e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0209393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0373  aminotransferase, class I and II  45.07 
 
 		 157 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0699  transcription elongation factor NusA-like protein  45.45 
 
 		 144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00857549  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1967  transcription elongation factor NusA-like protein  44.06 
 
 		 144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000104424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0037  transcription elongation factor NusA-like protein  43.66 
 
 		 143 aa  123  9e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000224532  normal  0.180707 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0103  transcription elongation factor NusA-like protein  42.65 
 
 		 139 aa  122  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0055  NusA family protein  46.38 
 
 		 142 aa  121  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0755132 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2325  transcription elongation factor NusA-like protein  41.26 
 
 		 144 aa  121  4e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000411828  decreased coverage  0.00000148869 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2095  transcription elongation factor NusA-like protein  41.26 
 
 		 144 aa  120  9e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0511  transcription elongation factor NusA-like protein  41.18 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0321  transcription elongation factor NusA-like protein  44.29 
 
 		 148 aa  115  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.140806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0791  NusA family protein  46.46 
 
 		 147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.013566  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0353  NusA family protein  39.57 
 
 		 154 aa  114  6e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1778  NusA family protein  47.97 
 
 		 146 aa  113  8.999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0355  NusA family KH domain protein  39.55 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2154  NusA family KH domain protein  38.96 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.392185  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0780  transcription elongation factor NusA-like protein  37.21 
 
 		 142 aa  103  6e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0698378  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1385  hypothetical protein  41.04 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0611  transcription elongation factor NusA-like protein  38.97 
 
 		 173 aa  101  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2073  NusA family protein  40.88 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.115145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1307  transcription elongation factor NusA-like protein  38.97 
 
 		 173 aa  100  5e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0676  transcription elongation factor NusA-like protein  39.71 
 
 		 173 aa  100  5e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.618289  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0212  transcription elongation factor NusA-like protein  38.24 
 
 		 173 aa  99.4  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0437  NusA family KH domain protein  40.16 
 
 		 147 aa  98.6  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0231371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0282  NusA family protein  34.53 
 
 		 149 aa  98.6  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.956097  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0786  transcription elongation factor NusA-like protein  40.83 
 
 		 184 aa  96.7  9e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1087  NusA family KH domain protein  38.03 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.513028  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1059  NusA antitermination factor  37.08 
 
 		 333 aa  57.4  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00843571  normal  0.0553593 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  37.5 
 
 		 392 aa  57  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0776  transcription elongation factor NusA  37.08 
 
 		 329 aa  55.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387304  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3391  transcription elongation factor NusA  34.48 
 
 		 412 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485206  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  34.88 
 
 		 572 aa  55.1  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2712  transcription elongation factor NusA  34.48 
 
 		 412 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  38.37 
 
 		 493 aa  54.3  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0530  transcription elongation factor NusA  35 
 
 		 341 aa  54.3  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0610  transcription elongation factor NusA  34.88 
 
 		 548 aa  53.5  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131908  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  34.88 
 
 		 537 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1475  transcription termination factor NusA  34.48 
 
 		 393 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000477736  unclonable  0.00000325116 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  34.88 
 
 		 537 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2318  NusA antitermination factor  35.29 
 
 		 358 aa  53.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00819018  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3332  NusA antitermination factor  35.96 
 
 		 351 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166447  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1209  NusA antitermination factor  35.96 
 
 		 344 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489852  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1586  transcription elongation factor NusA  34.44 
 
 		 385 aa  52  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00876176  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf784  transcription elongation factor NusA  36.67 
 
 		 524 aa  52.8  0.000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2492  transcription elongation factor NusA  34.88 
 
 		 544 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0183695  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0521  N utilization substance protein A  37.5 
 
 		 537 aa  52.4  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0488  transcription elongation factor NusA  32.98 
 
 		 502 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.573333  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1419  NusA antitermination factor  34.83 
 
 		 347 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  34.88 
 
 		 535 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1049  NusA antitermination factor  40 
 
 		 357 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1517  transcription elongation factor NusA  35.96 
 
 		 348 aa  52  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  34.44 
 
 		 381 aa  51.6  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1627  transcription elongation factor NusA  36.52 
 
 		 322 aa  51.6  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0884036  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0607  NusA antitermination factor  34.78 
 
 		 433 aa  51.6  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2359  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 405 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  27.74 
 
 		 383 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3594  NusA antitermination factor  34.83 
 
 		 337 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4218  NusA antitermination factor  31.11 
 
 		 534 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000184689  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1139  NusA antitermination factor  28.68 
 
 		 556 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  33.72 
 
 		 552 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  28.36 
 
 		 475 aa  50.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  33.72 
 
 		 532 aa  50.8  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0830  transcription elongation factor NusA  31.4 
 
 		 482 aa  50.8  0.000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0231544  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  34.07 
 
 		 344 aa  50.8  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2089  transcription elongation factor NusA  30.21 
 
 		 413 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.69598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  33.72 
 
 		 538 aa  50.8  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0961  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 401 aa  50.4  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462921  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  32.18 
 
 		 537 aa  50.8  0.000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2115  transcription elongation factor NusA  34.12 
 
 		 331 aa  50.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  33.72 
 
 		 535 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0166  transcription elongation factor NusA  33.72 
 
 		 538 aa  50.4  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  34.07 
 
 		 344 aa  50.4  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  33.72 
 
 		 533 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1107  transcription elongation factor NusA  32.56 
 
 		 495 aa  49.7  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  30.77 
 
 		 442 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11460  transcription termination factor NusA  33.71 
 
 		 357 aa  50.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00403363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0040  transcription elongation factor NusA  32.18 
 
 		 590 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1441  NusA antitermination factor  37.08 
 
 		 339 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  31.11 
 
 		 442 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0442  transcription elongation factor NusA  32.18 
 
 		 537 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2202  transcription termination factor NusA  36.05 
 
 		 497 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14550  transcription elongation factor NusA  34.83 
 
 		 348 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0106294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0022  transcription elongation factor NusA  32.18 
 
 		 538 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1691  transcription elongation factor NusA  36.05 
 
 		 491 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.349056  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0584  transcription elongation factor NusA  31.91 
 
 		 509 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0598  transcription elongation factor NusA  32.18 
 
 		 539 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0478  transcription elongation factor NusA  32.18 
 
 		 541 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.779193  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0233  transcription elongation factor NusA  32.18 
 
 		 540 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2592  transcription elongation factor NusA  36.05 
 
 		 559 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.808645  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1018  NusA antitermination factor  32.94 
 
 		 354 aa  49.7  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0597  NusA antitermination factor  29.52 
 
 		 425 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0029  transcription elongation factor NusA  32.18 
 
 		 536 aa  48.9  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0073  transcription elongation factor NusA  31.03 
 
 		 494 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.837556  normal  0.355658 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>