More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1519 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  100 
 
 		 481 aa  994    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  56.78 
 
 		 479 aa  553  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  57.56 
 
 		 499 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  57.56 
 
 		 499 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  54.75 
 
 		 510 aa  531  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  57.39 
 
 		 516 aa  513  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  55.97 
 
 		 520 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  55.97 
 
 		 520 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  55.97 
 
 		 520 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  56.46 
 
 		 516 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  55.97 
 
 		 520 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  55.97 
 
 		 520 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  55.97 
 
 		 520 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1796  nitrite reductase, copper-containing  53.25 
 
 		 348 aa  333  3e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00424702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  49.85 
 
 		 534 aa  319  7.999999999999999e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1326  nitrite reductase, copper-containing  52.52 
 
 		 466 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.852268  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1009  nitrite reductase, copper-containing  49.5 
 
 		 350 aa  306  4.0000000000000004e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1998  nitrite reductase (NO-forming)  47.84 
 
 		 451 aa  288  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1208  nitrite reductase, copper-containing  41.98 
 
 		 355 aa  280  4e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1108  nitrite reductase, copper-containing  50.7 
 
 		 358 aa  269  8.999999999999999e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1016  nitrite reductase, copper-containing  43.85 
 
 		 364 aa  265  1e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.552057 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0035  nitrite reductase, copper-containing  44.85 
 
 		 362 aa  260  3e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3087  nitrite reductase, copper-containing  40.52 
 
 		 352 aa  230  4e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  30.64 
 
 		 487 aa  183  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1295  nitrite reductase (NO-forming)  39.86 
 
 		 463 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  32.95 
 
 		 535 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.13 
 
 		 487 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3335  nitrite reductase, copper-containing  35.89 
 
 		 392 aa  172  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.77 
 
 		 487 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  32.09 
 
 		 535 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.77 
 
 		 535 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  29.77 
 
 		 535 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.77 
 
 		 535 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2681  nitrite reductase (NO-forming)  34.81 
 
 		 393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1019  nitrite reductase (NO-forming)  36.4 
 
 		 526 aa  163  6e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4623  nitrite reductase, copper-containing  35.54 
 
 		 370 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0503  multicopper oxidase, type 3  36.4 
 
 		 479 aa  160  7e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.16251 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0236  nitrite reductase, copper-containing  34.08 
 
 		 376 aa  158  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3482  nitrite reductase, copper containing  34.89 
 
 		 391 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2243  nitrite reductase, copper-containing  34.59 
 
 		 367 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1793  multicopper oxidase, type 3  32.76 
 
 		 307 aa  156  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6826  copper-containing nitrite reductase (NO-forming) nirK  33.94 
 
 		 364 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2101  multicopper oxidase, type 3  34.95 
 
 		 911 aa  155  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3489  multicopper oxidase, type 3  38.66 
 
 		 857 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2351  nitrite reductase  36.8 
 
 		 912 aa  150  6e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.76545 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1768  Nitrite reductase (NO-forming)  36.09 
 
 		 876 aa  147  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0968219  decreased coverage  0.0045264 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4752  Nitrite reductase (NO-forming)  34.67 
 
 		 455 aa  146  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6278  nitrite reductase, copper-containing  34.56 
 
 		 376 aa  146  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  0.19336 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0260  copper-containing nitrite reductase  34.08 
 
 		 376 aa  146  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3727  nitrite reductase, copper-containing  32.98 
 
 		 369 aa  144  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.557608  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1595  nitrite reductase, copper-containing  35.28 
 
 		 374 aa  144  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4379  nitrite reductase, copper-containing  36.16 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0089  nitrite reductase (NO-forming)  34.56 
 
 		 372 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0150  Nitrite reductase (NO-forming)  38.11 
 
 		 952 aa  139  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.684511 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1417  multicopper oxidase type 3  31.12 
 
 		 314 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2794  hypothetical protein  34.18 
 
 		 471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4273  nitrite reductase, copper-containing  35.14 
 
 		 366 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2648  multicopper oxidase  30.55 
 
 		 323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09060  predicted multicopper oxidase  34.41 
 
 		 969 aa  125  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.65293  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3281  multicopper oxidase, type 3  30 
 
 		 316 aa  125  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.181317  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4252  Nitrite reductase (NO-forming)  35.06 
 
 		 878 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.622613  normal  0.180427 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  29.38 
 
 		 486 aa  124  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3626  multicopper oxidase, type 3  34.33 
 
 		 856 aa  120  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1641  multicopper oxidase type 3  34.19 
 
 		 526 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0083  twin-arginine translocation pathway signal  29.51 
 
 		 338 aa  110  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000323423  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4419  multicopper oxidase  30.08 
 
 		 376 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4806  cytochrome c class I  43.97 
 
 		 136 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167135  normal  0.0495406 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  26.89 
 
 		 444 aa  99.8  9e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  27.94 
 
 		 293 aa  98.2  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4324  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  42.59 
 
 		 202 aa  95.9  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2574  multicopper oxidase type 3  28.06 
 
 		 355 aa  95.1  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12333  probable major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  38.66 
 
 		 150 aa  94  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1369  cytochrome c class I  42.24 
 
 		 161 aa  89  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1447  multicopper oxidase type 3  22.92 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1473  multicopper oxidase type 3  22.92 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1784  multicopper oxidase type 3  23.83 
 
 		 341 aa  84.3  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1300  cytochrome c class I  46.88 
 
 		 139 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.793758 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  25.91 
 
 		 527 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4422  multicopper oxidase, type 3  28.24 
 
 		 375 aa  82.4  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0831  twin-arginine translocation pathway signal  24.38 
 
 		 331 aa  82.4  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288801  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02321  hypothetical protein  40.4 
 
 		 203 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0244328  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2127  cytochrome c class I  40.4 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1663  multicopper oxidase type 3  25.1 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2442  NHL repeat containing protein  41.58 
 
 		 577 aa  80.1  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0106112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1432  cytochrome c, class I  38.53 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0403  membrane-bound dehydrogenase domain protein  37.84 
 
 		 773 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3593  multicopper oxidase type 3  27.49 
 
 		 368 aa  79.3  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6519  putative multicopper oxidase  27.36 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2294  multicopper oxidase  26.67 
 
 		 431 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198018  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1927  multicopper oxidase type 3  25.81 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3471  multicopper oxidase type 3  25 
 
 		 336 aa  77.8  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593576  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0450  cytochrome c class I  34.95 
 
 		 149 aa  77.4  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1131  multicopper oxidase type 3  22.76 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.207497 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1380  cytochrome c class I  37.86 
 
 		 133 aa  77  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.705063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3926  cytochrome c family protein  33.56 
 
 		 222 aa  76.3  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3971  multicopper oxidase type 3  33.91 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4125  cytochrome c, class I  34.65 
 
 		 202 aa  75.1  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3966  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.1 
 
 		 601 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4896  cytochrome c class I  39.6 
 
 		 142 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4625  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 197 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.887243  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>