More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3538 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3538  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
563 aa  1103    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.274644  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4548  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.45 
 
 
554 aa  228  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0861  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.69 
 
 
536 aa  202  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3133  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.82 
 
 
588 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3533  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.82 
 
 
320 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3405  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.39 
 
 
588 aa  126  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  24.94 
 
 
464 aa  117  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  30.63 
 
 
778 aa  108  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.16 
 
 
739 aa  107  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  26.54 
 
 
753 aa  104  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.94 
 
 
764 aa  102  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  28.67 
 
 
779 aa  101  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  28.57 
 
 
782 aa  101  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  29.24 
 
 
730 aa  101  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  30.82 
 
 
739 aa  100  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.69 
 
 
745 aa  100  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  31.33 
 
 
521 aa  98.2  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  31.56 
 
 
496 aa  97.1  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  30.16 
 
 
739 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  30.16 
 
 
739 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  32.41 
 
 
529 aa  95.5  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  29.84 
 
 
739 aa  95.1  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  25.97 
 
 
750 aa  94.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  27.55 
 
 
454 aa  94  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  31.8 
 
 
466 aa  94  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  31.56 
 
 
503 aa  93.2  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  29.43 
 
 
772 aa  92  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1457  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.52 
 
 
576 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.33 
 
 
741 aa  91.3  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.41 
 
 
575 aa  90.5  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  28.25 
 
 
758 aa  90.5  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  24.72 
 
 
492 aa  90.1  9e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  28.72 
 
 
736 aa  89.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  29.9 
 
 
741 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  27.87 
 
 
527 aa  88.6  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  29.61 
 
 
804 aa  88.6  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  31.31 
 
 
756 aa  88.6  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  28.99 
 
 
743 aa  88.6  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  25.83 
 
 
764 aa  88.2  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.79 
 
 
741 aa  88.2  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  30.79 
 
 
741 aa  88.2  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  30.79 
 
 
741 aa  88.2  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.62 
 
 
779 aa  87.8  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  29.02 
 
 
667 aa  87.8  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  30.72 
 
 
508 aa  87.8  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  26.32 
 
 
731 aa  87.4  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.75 
 
 
750 aa  87  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.57 
 
 
741 aa  87  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  26.01 
 
 
758 aa  87  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  27.59 
 
 
742 aa  86.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  28.43 
 
 
740 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  29.23 
 
 
738 aa  86.3  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  29.1 
 
 
790 aa  86.7  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  27.56 
 
 
789 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  33.5 
 
 
474 aa  85.9  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  27.61 
 
 
756 aa  85.1  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  28.19 
 
 
732 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  28.29 
 
 
217 aa  84.3  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  26.04 
 
 
726 aa  84  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  28.4 
 
 
741 aa  84  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  29.9 
 
 
741 aa  84  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  28.26 
 
 
776 aa  83.2  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  30.64 
 
 
747 aa  82.4  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0576306 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  30.71 
 
 
736 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  28.83 
 
 
524 aa  82.4  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.79 
 
 
235 aa  82  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  32.35 
 
 
803 aa  81.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4578  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.99 
 
 
491 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290602  normal  0.0783 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2473  polysaccharide biosynthesis protein, putative  30.59 
 
 
282 aa  81.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  30.77 
 
 
733 aa  81.3  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1122  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.95 
 
 
780 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  27.94 
 
 
217 aa  81.6  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  28.77 
 
 
747 aa  81.3  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.48 
 
 
748 aa  81.3  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  31.73 
 
 
225 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  30.13 
 
 
257 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  29.9 
 
 
790 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  27.36 
 
 
770 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  32 
 
 
484 aa  79.7  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  26.42 
 
 
755 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1155  tyrosine-protein kinase  29 
 
 
257 aa  80.1  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000120781  hitchhiker  3.55737e-18 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  28.81 
 
 
505 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.61 
 
 
720 aa  79  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1073  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.55 
 
 
728 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649181  normal  0.290523 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  26.94 
 
 
756 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  28.57 
 
 
788 aa  79.3  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  28.84 
 
 
225 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  31.4 
 
 
615 aa  78.6  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2715  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.53 
 
 
726 aa  78.6  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.088822  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  36.15 
 
 
240 aa  78.2  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  26.46 
 
 
734 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  34.21 
 
 
492 aa  77.8  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5360  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.21 
 
 
701 aa  77.8  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445526  normal  0.0162612 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  33.73 
 
 
463 aa  77.4  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  31.27 
 
 
766 aa  77  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6487  hypothetical protein  26.65 
 
 
781 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.907329 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.64 
 
 
234 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  29.41 
 
 
225 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  28.64 
 
 
233 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  35.67 
 
 
802 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.152743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>