More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2270 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  75.45 
 
 		 796 aa  1227    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  100 
 
 		 799 aa  1627    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  34.01 
 
 		 797 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  33.12 
 
 		 791 aa  437  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  33.46 
 
 		 792 aa  419  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  31.47 
 
 		 808 aa  405  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  32.46 
 
 		 790 aa  405  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1155  RND efflux transporter  31.52 
 
 		 830 aa  383  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0595  RND efflux transporter  29 
 
 		 806 aa  359  9.999999999999999e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.115384  hitchhiker  0.0000495016 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0582  RND efflux transporter  28.78 
 
 		 805 aa  358  2.9999999999999997e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135299 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0397  RND efflux transporter  30.56 
 
 		 805 aa  355  2e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0885  RND efflux transporter  30.56 
 
 		 805 aa  355  2e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  28.57 
 
 		 784 aa  323  6e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  29.99 
 
 		 771 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2222  hypothetical protein  28.5 
 
 		 768 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1679  hypothetical protein  29.29 
 
 		 771 aa  304  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.980542  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1754  hypothetical protein  29.29 
 
 		 771 aa  304  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0558079  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  28.48 
 
 		 772 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1591  hypothetical protein  28.85 
 
 		 768 aa  302  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2434  hypothetical protein  29.29 
 
 		 771 aa  300  8e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.338411  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1910  hypothetical protein  29.29 
 
 		 771 aa  300  8e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0338156  normal  0.0625477 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2554  hypothetical protein  29.29 
 
 		 771 aa  299  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0631379  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1728  hypothetical protein  28.22 
 
 		 769 aa  298  2e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1784  hypothetical protein  28.9 
 
 		 771 aa  297  6e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.455314  normal  0.263872 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2441  hypothetical protein  29.16 
 
 		 771 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2196  hypothetical protein  29.16 
 
 		 771 aa  293  9e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233357  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1447  RND efflux transporter  28.81 
 
 		 820 aa  290  6e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.751862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1808  hypothetical protein  28.9 
 
 		 767 aa  287  5e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  26.19 
 
 		 787 aa  284  4.0000000000000003e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2001  hypothetical protein  28.35 
 
 		 771 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2139  hypothetical protein  27.82 
 
 		 770 aa  278  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.124395 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2803  hypothetical protein  27.14 
 
 		 772 aa  278  4e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.929153  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1941  Patched family protein  27.68 
 
 		 767 aa  278  4e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314196  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6840  RND efflux transporter  28.28 
 
 		 786 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172281  normal  0.135262 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0645  RND family transporter  28.4 
 
 		 834 aa  271  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0103634  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  26.42 
 
 		 794 aa  269  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4359  RND efflux transporter  28.41 
 
 		 786 aa  269  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4346  RND efflux transporter  28.15 
 
 		 786 aa  268  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4865  RND efflux transporter  28.15 
 
 		 786 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.743305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2971  RND efflux transporter  28.95 
 
 		 797 aa  268  4e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5040  RND efflux transporter  28.28 
 
 		 786 aa  266  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981854  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5820  RND efflux transporter  28.28 
 
 		 786 aa  266  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  25.71 
 
 		 796 aa  263  8e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4325  transporter, putative  28.04 
 
 		 786 aa  263  8e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0993317 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4435  transporter, putative  28.04 
 
 		 786 aa  263  8e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.565976 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2060  hypothetical protein  26.93 
 
 		 790 aa  263  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24330  hypothetical protein  26.33 
 
 		 793 aa  263  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0027  RND superfamily exporter  28.86 
 
 		 783 aa  260  6e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6781  RND efflux transporter  28.46 
 
 		 799 aa  260  9e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2127  hypothetical protein  27.84 
 
 		 816 aa  257  5e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00224294  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  26.24 
 
 		 796 aa  257  6e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2749  transporter, putative  27.66 
 
 		 804 aa  257  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00176897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2244  putative transporter  27.26 
 
 		 831 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.166877  hitchhiker  0.0000000000000152774 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6390  transporter, putative  27.59 
 
 		 786 aa  256  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191266  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  27.68 
 
 		 795 aa  254  6e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1579  hypothetical protein  25.63 
 
 		 799 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69775  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0967  putative transporter  26.49 
 
 		 813 aa  251  4e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.108319  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2812  transporter, putative  28.39 
 
 		 804 aa  251  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1551  hypothetical protein  25.42 
 
 		 799 aa  250  6e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2019  hypothetical protein  25.16 
 
 		 799 aa  250  9e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.62058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3142  transporter, putative  26.19 
 
 		 799 aa  249  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3723  RND efflux transporter  24.87 
 
 		 799 aa  248  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  25.49 
 
 		 784 aa  248  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1574  hypothetical protein  28.5 
 
 		 810 aa  247  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.390542  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2809  transporter, putative  28.68 
 
 		 821 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0254275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2165  transporter, putative  27.62 
 
 		 808 aa  244  6e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119631 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2666  RND efflux transporter  28.66 
 
 		 821 aa  238  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0970775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2006  RND superfamily exporter  26.6 
 
 		 794 aa  237  6e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.882933  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3202  transporter, putative  26.39 
 
 		 826 aa  233  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.320198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6867  putative transporter  26.98 
 
 		 827 aa  223  8e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0544338  normal  0.0493157 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3429  hypothetical protein  23.21 
 
 		 787 aa  219  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0133  transporter, putative  26.97 
 
 		 808 aa  216  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134014  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  25.45 
 
 		 764 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4062  RND superfamily transporter, putative  26.01 
 
 		 813 aa  209  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4029  RND superfamily transporter, putative  26.46 
 
 		 813 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.622803  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  23.26 
 
 		 1051 aa  202  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3922  RND superfamily transporter  26.65 
 
 		 809 aa  196  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  23.65 
 
 		 1083 aa  135  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  22.77 
 
 		 778 aa  125  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  22.24 
 
 		 788 aa  122  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  21.04 
 
 		 811 aa  122  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  23.55 
 
 		 905 aa  115  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  18.87 
 
 		 779 aa  114  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  27.36 
 
 		 898 aa  114  7.000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  20.57 
 
 		 792 aa  111  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  23.67 
 
 		 779 aa  110  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  22.32 
 
 		 806 aa  109  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  20.9 
 
 		 803 aa  107  9e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  20.73 
 
 		 815 aa  107  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  19.67 
 
 		 808 aa  107  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  21.58 
 
 		 764 aa  107  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  21.79 
 
 		 755 aa  105  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  21.62 
 
 		 831 aa  105  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  21.63 
 
 		 869 aa  105  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  21.79 
 
 		 869 aa  104  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  23.21 
 
 		 727 aa  96.3  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  21.86 
 
 		 864 aa  94.7  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  19.75 
 
 		 800 aa  94.4  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.25 
 
 		 837 aa  92.8  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  20.79 
 
 		 804 aa  92.8  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>