94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2068 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4267  hypothetical protein  67.84 
 
 		 793 aa  1007    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2068  hypothetical protein  100 
 
 		 790 aa  1543    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.847092 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1941  hypothetical protein  55.25 
 
 		 787 aa  803    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382798  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2303  hypothetical protein  63.67 
 
 		 788 aa  929    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.951648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1917  hypothetical protein  44.84 
 
 		 787 aa  579  1e-164  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1478  hypothetical protein  43.14 
 
 		 787 aa  555  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5376  hypothetical protein  42.86 
 
 		 788 aa  533  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.687555  normal  0.158933 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1701  hypothetical protein  41.24 
 
 		 787 aa  535  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0217  hypothetical protein  38.58 
 
 		 788 aa  529  1e-149  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1582  hypothetical protein  41.93 
 
 		 793 aa  528  1e-148  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.143489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0325  protein of unknown function DUF214  42.77 
 
 		 790 aa  526  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3437  hypothetical protein  41.39 
 
 		 800 aa  525  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.248867 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  42.75 
 
 		 789 aa  523  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1280  protein of unknown function DUF214  37.7 
 
 		 787 aa  512  1e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.134975  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2063  protein of unknown function DUF214  40.1 
 
 		 786 aa  503  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.059319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6251  hypothetical protein  38.84 
 
 		 789 aa  500  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424729  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2205  hypothetical protein  39.77 
 
 		 787 aa  495  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578732  normal  0.0125099 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1478  protein of unknown function DUF214  38.41 
 
 		 787 aa  486  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1508  hypothetical protein  37.7 
 
 		 787 aa  484  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0077  hypothetical protein  39.22 
 
 		 787 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1420  protein of unknown function DUF214  37.58 
 
 		 788 aa  474  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2282  hypothetical protein  38.39 
 
 		 787 aa  473  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312022  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1211  protein of unknown function DUF214  38.66 
 
 		 787 aa  476  1e-132  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.818892  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4368  protein of unknown function DUF214  38.05 
 
 		 789 aa  472  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4500  protein of unknown function DUF214  38.05 
 
 		 789 aa  472  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.140926 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0301  hypothetical protein  40.08 
 
 		 787 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0063  permease domain-containing protein  37.83 
 
 		 789 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1012  hypothetical protein  38.31 
 
 		 791 aa  457  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2657  ABC transporter, inner membrane subunit  41.99 
 
 		 786 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186828  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2842  protein of unknown function DUF214  41.66 
 
 		 786 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2748  protein of unknown function DUF214  41.66 
 
 		 786 aa  446  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.076782  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5172  hypothetical protein  38.17 
 
 		 788 aa  444  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841676  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1124  hypothetical protein  37.8 
 
 		 793 aa  437  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.527688 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2960  hypothetical protein  41.42 
 
 		 786 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1055  protein of unknown function DUF214  37.07 
 
 		 787 aa  432  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295189  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3584  hypothetical protein  37.74 
 
 		 787 aa  405  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4212  hypothetical protein  37.99 
 
 		 789 aa  404  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2873  protein of unknown function DUF214  29.98 
 
 		 792 aa  320  7.999999999999999e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  30.1 
 
 		 791 aa  315  2.9999999999999996e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4677  protein of unknown function DUF214  29.48 
 
 		 792 aa  299  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2083  protein of unknown function DUF214  28.15 
 
 		 797 aa  298  2e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  26.9 
 
 		 792 aa  258  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1146  hypothetical protein  28.32 
 
 		 787 aa  237  5.0000000000000005e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1665  protein of unknown function DUF214  21.41 
 
 		 773 aa  165  4.0000000000000004e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  26.34 
 
 		 947 aa  160  7e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2239  protein of unknown function DUF214  24.94 
 
 		 774 aa  157  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  24.3 
 
 		 1090 aa  132  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2177  protein of unknown function DUF214  28.06 
 
 		 1177 aa  129  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  22.22 
 
 		 1132 aa  128  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  23.22 
 
 		 868 aa  125  3e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  22.89 
 
 		 1132 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0110  protein of unknown function DUF214  22.35 
 
 		 759 aa  114  5e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0590348  normal  0.0712299 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1113  protein of unknown function DUF214  26.01 
 
 		 1110 aa  112  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  21.53 
 
 		 1016 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  24.82 
 
 		 1232 aa  105  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1080  peptide ABC transporter permease  21.71 
 
 		 859 aa  105  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0653596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0391  protein of unknown function DUF214  21.41 
 
 		 737 aa  100  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  24.23 
 
 		 1143 aa  99.8  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  20.18 
 
 		 876 aa  98.6  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0133  efflux ABC transporter, permease protein  23.1 
 
 		 917 aa  92.8  2e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0748  protein of unknown function DUF214  18.01 
 
 		 1068 aa  83.6  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4337  hypothetical protein  26.41 
 
 		 876 aa  82.4  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1582  protein of unknown function DUF214  20.32 
 
 		 743 aa  75.1  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0969  hypothetical protein  29.06 
 
 		 806 aa  74.3  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208929  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  24.54 
 
 		 1211 aa  72.8  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1694  protein of unknown function DUF214  21.61 
 
 		 749 aa  68.9  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  25 
 
 		 851 aa  67.8  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  27.64 
 
 		 850 aa  60.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  30.8 
 
 		 839 aa  55.1  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  28.78 
 
 		 838 aa  53.9  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  24.38 
 
 		 417 aa  53.9  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  24.27 
 
 		 849 aa  53.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  25.06 
 
 		 836 aa  52.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3419  hypothetical protein  27.6 
 
 		 821 aa  51.6  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319511  normal  0.0789128 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  23.68 
 
 		 849 aa  51.2  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  29.78 
 
 		 806 aa  50.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  43.66 
 
 		 842 aa  49.3  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  28.57 
 
 		 855 aa  48.5  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2901  hypothetical protein  29.09 
 
 		 411 aa  48.1  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0934048 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  28.29 
 
 		 844 aa  48.1  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  31.91 
 
 		 842 aa  47.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  42.25 
 
 		 842 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0906  hypothetical protein  24.51 
 
 		 362 aa  47.4  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.831415  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  27.85 
 
 		 848 aa  47  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4040  putative lipoprotein-releasing system transmembrane protein (lolC)  33.08 
 
 		 411 aa  46.2  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  28.3 
 
 		 807 aa  47  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  23.14 
 
 		 833 aa  46.6  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  23.7 
 
 		 855 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1078  protein of unknown function DUF214  26.47 
 
 		 703 aa  45.8  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  31.31 
 
 		 855 aa  45.8  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01820  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  24.64 
 
 		 811 aa  45.8  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1629  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  28.86 
 
 		 759 aa  45.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.258013 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  25.44 
 
 		 859 aa  45.1  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  30.17 
 
 		 847 aa  44.3  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>