57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2686 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  58.11 
 
 
652 aa  738    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2686  type II secretion system protein  100 
 
 
644 aa  1299    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.473115 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1173  type II secretion system protein  51.65 
 
 
641 aa  656    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0525708  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2401  type II secretion system protein  35.54 
 
 
647 aa  409  1e-113  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  32.58 
 
 
716 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1031  type II secretion system protein  34.33 
 
 
715 aa  310  4e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1458  hypothetical protein  31.37 
 
 
625 aa  303  8.000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.441143 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  30.9 
 
 
807 aa  298  2e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1065  Type II secretion system F domain protein  33.09 
 
 
536 aa  293  6e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  33.94 
 
 
802 aa  280  6e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0732  transporter  28.27 
 
 
660 aa  279  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3138  Type II secretion system F domain protein  29.22 
 
 
684 aa  241  2.9999999999999997e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160866  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0947  Type II secretion system F domain protein  28.3 
 
 
697 aa  239  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2385  type II secretion system protein  29.49 
 
 
610 aa  227  6e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0700595  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1538  hypothetical protein  28.53 
 
 
601 aa  220  6e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000607294  hitchhiker  0.000766837 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2860  type II secretion system protein  27.76 
 
 
678 aa  216  7e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0313  type II secretion system protein  31.45 
 
 
625 aa  212  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.549227  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2147  type II secretion system protein  28.05 
 
 
679 aa  211  3e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0236165 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0977  type II secretion system protein  27.67 
 
 
680 aa  206  1e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1903  type II secretion system protein  37.25 
 
 
349 aa  193  7e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.697256 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3168  type II secretion system protein  33.53 
 
 
329 aa  179  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.577481  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2001  type II secretion system protein  34.81 
 
 
349 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0252  type II secretion system protein  31.53 
 
 
328 aa  169  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.163074  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3169  type II secretion system protein  33.33 
 
 
296 aa  145  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1904  type II secretion system protein  40.7 
 
 
224 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.374216 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0253  type II secretion system protein  38.3 
 
 
306 aa  139  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0793731  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2002  type II secretion system protein  38.54 
 
 
307 aa  140  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0008  Type II secretion system F domain protein  29.03 
 
 
290 aa  116  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0007  Type II secretion system F domain protein  27.9 
 
 
332 aa  106  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2405  type II secretion system protein  27.08 
 
 
450 aa  97.4  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0445  type II secretion system protein  19.9 
 
 
604 aa  79.3  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179017  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0777  type II secretion system protein  28.14 
 
 
284 aa  73.6  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0805  type II secretion system protein  25.51 
 
 
295 aa  70.5  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2404  type II secretion system protein  26.37 
 
 
300 aa  63.9  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0423  hypothetical protein  23.58 
 
 
307 aa  62.4  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0961  flagellar assembly protein J  23.4 
 
 
581 aa  57.4  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2276  putative integral membrane protein  25.78 
 
 
273 aa  56.2  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.846433  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1648  type II secretion system protein  23.08 
 
 
590 aa  52.4  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505042  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2869  Type II secretion system F domain protein  21.05 
 
 
574 aa  50.8  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43773  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  24.44 
 
 
317 aa  50.4  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0229  type II secretion system protein  24.76 
 
 
582 aa  50.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1343  type II secretion system protein  22.33 
 
 
256 aa  47.4  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.753846 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  30.43 
 
 
406 aa  47.4  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2307  Type II secretion system F domain protein  23.5 
 
 
298 aa  46.6  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  24.06 
 
 
282 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  30 
 
 
408 aa  45.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7218  type II secretion system protein  27.68 
 
 
300 aa  45.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.329226 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  24 
 
 
291 aa  45.8  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5619  type II secretion system protein  27.68 
 
 
300 aa  45.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1871  type II secretion system protein  23.21 
 
 
248 aa  45.4  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0937784  normal  0.742106 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0651  type II secretion system protein  23.05 
 
 
615 aa  45.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.219631 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  26.4 
 
 
322 aa  45.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4157  type II secretion system protein  28.08 
 
 
309 aa  44.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1198  type II secretion system protein  23.15 
 
 
620 aa  44.7  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.665055  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  21.79 
 
 
307 aa  44.7  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  25.74 
 
 
336 aa  44.3  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0494  Type II secretion system F domain protein  31.11 
 
 
658 aa  43.9  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>