124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8657 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  100 
 
 		 313 aa  642    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  68.46 
 
 		 319 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  68.46 
 
 		 319 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2438  putative amidohydrolase 2  52.23 
 
 		 292 aa  298  8e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  40.67 
 
 		 314 aa  219  7e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  41 
 
 		 318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  38.1 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  37.95 
 
 		 318 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  38.13 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  40 
 
 		 299 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  39.13 
 
 		 297 aa  186  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  38.51 
 
 		 322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  39.26 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  37.92 
 
 		 320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  37.71 
 
 		 313 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  37.92 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  37.25 
 
 		 319 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  37.25 
 
 		 319 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2505  amidohydrolase 2  36.91 
 
 		 303 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0331548  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  37.92 
 
 		 313 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  34.69 
 
 		 295 aa  152  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  32.77 
 
 		 290 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  34.34 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  34.34 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 298 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  32.26 
 
 		 302 aa  129  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  31.99 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8310  amidohydrolase 2  32.05 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  30.13 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2268  amidohydrolase 2  30.56 
 
 		 348 aa  111  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2077  amidohydrolase 2  32.62 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  30.06 
 
 		 335 aa  109  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4807  amidohydrolase 2  30.45 
 
 		 371 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5399  amidohydrolase 2  30.45 
 
 		 371 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5462  amidohydrolase 2  30.45 
 
 		 371 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  normal  0.0519457 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  28.33 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4701  amidohydrolase 2  29.34 
 
 		 348 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  27.65 
 
 		 276 aa  103  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4264  amidohydrolase 2  28.42 
 
 		 378 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1960  amidohydrolase 2  31.16 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0947  hypothetical protein  28.41 
 
 		 337 aa  99.4  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  27.76 
 
 		 285 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5345  amidohydrolase 2  29.25 
 
 		 374 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  29.8 
 
 		 279 aa  97.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2295  amidohydrolase 2  29.58 
 
 		 307 aa  95.9  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6032  amidohydrolase 2  28.36 
 
 		 348 aa  96.3  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0815871  normal  0.0588089 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4804  amidohydrolase 2  29.43 
 
 		 374 aa  95.9  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5469  amidohydrolase 2  28.4 
 
 		 348 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575813  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5393  amidohydrolase 2  28.4 
 
 		 348 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358895 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4877  amidohydrolase 2  28.06 
 
 		 348 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  28.34 
 
 		 283 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6104  amidohydrolase 2  24.4 
 
 		 349 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  29.03 
 
 		 285 aa  89.4  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1831  amidohydrolase 2  25.7 
 
 		 299 aa  89.4  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00149577  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  29.14 
 
 		 261 aa  88.2  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  28.38 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  29.43 
 
 		 276 aa  86.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  29.57 
 
 		 276 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  26.51 
 
 		 282 aa  85.9  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44258  predicted protein  28.15 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  26.62 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3483  amidohydrolase 2  24.18 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  30.66 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  30.54 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  27 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  30.66 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  30.66 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  27.48 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  26.91 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  30.66 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  30.66 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  30.66 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  27.89 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  23.47 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  22.56 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  21.66 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3153  amidohydrolase 2  28.62 
 
 		 281 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  28.19 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4879  amidohydrolase 2  28.29 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  27.48 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  26.52 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  26.69 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  25.25 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  27.12 
 
 		 277 aa  75.5  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  25.91 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  25.33 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  24.49 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  25.74 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3005  amidohydrolase 2  27.63 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.053896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  26.06 
 
 		 286 aa  72  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  29.39 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  25.64 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  28.62 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  24.75 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00670  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase, COG3618  25.9 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  23.95 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  26.42 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  25.64 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  21.5 
 
 		 276 aa  67  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0368  amidohydrolase 2  26.74 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>