145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5960 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5960  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 202 aa  394  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0718627  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5209  TPR repeat-containing protein  81.68 
 
 		 200 aa  304  6e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.221692  normal  0.106965 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2969  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  65.62 
 
 		 202 aa  207  6e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.742122 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2742  TPR repeat-containing protein  65 
 
 		 202 aa  206  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2864  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  64.38 
 
 		 201 aa  205  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0130  TPR repeat-containing protein  59.9 
 
 		 203 aa  191  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0984  TPR repeat-containing protein  40.76 
 
 		 221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.815768 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1787  TPR repeat-containing protein  42.6 
 
 		 290 aa  122  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1419  TPR repeat-containing protein  44.87 
 
 		 221 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1215  tetratricopeptide TPR_2  40.54 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1399  tetratricopeptide TPR_2  41.03 
 
 		 226 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2028  TPR repeat-containing protein  44.94 
 
 		 205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.287446  normal  0.576518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3988  tetratricopeptide TPR_2  40.1 
 
 		 219 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4676  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.38 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1657  hypothetical protein  38.62 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0086  TPR repeat-containing protein  39.1 
 
 		 307 aa  106  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3257  TPR repeat-containing protein  36.11 
 
 		 194 aa  105  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841733  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1747  TPR domain-containing protein  33.84 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1687  TPR domain-containing protein  36.48 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2675  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.679716  normal  0.152424 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1166  TPR repeat-containing protein  33 
 
 		 230 aa  102  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3277  TPR repeat-containing protein  34.81 
 
 		 204 aa  98.6  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3576  TPR repeat-containing protein  37.41 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316735  normal  0.110411 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2063  TPR repeat-containing protein  39.74 
 
 		 243 aa  95.1  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2421  hypothetical protein  34.83 
 
 		 190 aa  94.7  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.416486  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1084  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 175 aa  93.2  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1561  TPR repeat-containing protein  37.18 
 
 		 190 aa  92.8  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.707304  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0204  TPR repeat-containing protein  34.23 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3687  hypothetical protein  37.31 
 
 		 261 aa  86.3  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145402  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1829  TPR repeat-containing protein  36.77 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0782  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.46 
 
 		 188 aa  81.3  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0782775  normal  0.104271 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0572  tetratricopeptide TPR_2  35.63 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00850831  hitchhiker  0.0000040032 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4966  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.85 
 
 		 155 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0138  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000611488 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0141  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.1 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2533  TPR repeat-containing protein  35.43 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2056  tetratricopeptide TPR_2  30.77 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134429  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0175  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.39 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.723088 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3312  TPR protein  34.16 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000995394  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1201  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.2 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.564024  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3022  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246943 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4022  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 628 aa  59.7  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4894  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964612 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 927 aa  55.1  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  29.36 
 
 		 547 aa  55.1  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1598  hypothetical protein  34.57 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000392317  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  34 
 
 		 1096 aa  51.6  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0793  TPR repeat-containing protein  39.13 
 
 		 152 aa  51.2  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  25.47 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  34.74 
 
 		 662 aa  50.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1693  tetratricopeptide TPR_2  34.78 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.521297  normal  0.655187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.65 
 
 		 1022 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.71 
 
 		 1056 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 289 aa  48.5  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1025  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 156 aa  48.5  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  24.82 
 
 		 361 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 1421 aa  48.1  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  27.84 
 
 		 573 aa  48.1  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 3560 aa  47.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.94 
 
 		 458 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  29.07 
 
 		 882 aa  47.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 		 605 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  28.95 
 
 		 269 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  29.07 
 
 		 882 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 828 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 301 aa  47  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 		 289 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2723  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 		 342 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26129  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.67 
 
 		 784 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 		 4079 aa  46.2  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.09 
 
 		 166 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0240215 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03050  ubiquitin-protein ligase, putative  28.74 
 
 		 773 aa  45.8  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.96 
 
 		 730 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3390  TPR repeat-containing protein  28.09 
 
 		 166 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 833 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.16 
 
 		 237 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.17 
 
 		 541 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 828 aa  45.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2091  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.26 
 
 		 212 aa  45.4  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 		 279 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0858  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  20.62 
 
 		 479 aa  45.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  23.21 
 
 		 649 aa  45.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_8734  predicted protein  30.49 
 
 		 124 aa  45.4  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.662786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  32.1 
 
 		 1276 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 1192 aa  45.4  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  31.11 
 
 		 582 aa  45.1  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  23.76 
 
 		 523 aa  45.1  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 280 aa  45.1  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1798  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 211 aa  44.7  0.0009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.53381e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 		 280 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 265 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2626  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 169 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 		 3145 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 		 594 aa  44.3  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.14 
 
 		 1056 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1722  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.62 
 
 		 354 aa  43.9  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.59 
 
 		 265 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.05 
 
 		 528 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 371 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 		 331 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>