126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2701 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  100 
 
 		 291 aa  592  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  73.85 
 
 		 287 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  71.93 
 
 		 285 aa  426  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  50.52 
 
 		 285 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2575  amidohydrolase  51.07 
 
 		 281 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  50.71 
 
 		 283 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  49.11 
 
 		 283 aa  276  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  39.86 
 
 		 277 aa  176  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  36.36 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  34.32 
 
 		 312 aa  143  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  33.2 
 
 		 278 aa  142  9e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  33.47 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  32.04 
 
 		 279 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  32.2 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  31.78 
 
 		 278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  31.49 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  31.06 
 
 		 283 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3852  amidohydrolase 2  30.93 
 
 		 283 aa  105  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  33.05 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  29.11 
 
 		 287 aa  99  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  30.07 
 
 		 287 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  29.11 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  32.57 
 
 		 291 aa  94.7  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  32.63 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  32.64 
 
 		 278 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  31.36 
 
 		 299 aa  90.9  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  30.42 
 
 		 307 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  29.41 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  29.44 
 
 		 305 aa  89.7  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  30.9 
 
 		 279 aa  89.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  28.9 
 
 		 286 aa  89  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  27.82 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  27.82 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  28.31 
 
 		 287 aa  86.7  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  29.82 
 
 		 288 aa  86.3  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  27.85 
 
 		 291 aa  85.5  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  27.42 
 
 		 289 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  29.64 
 
 		 283 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  30.37 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  30.37 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  30.37 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  28.96 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  25.94 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  29.77 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  26.21 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  28.63 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  27.06 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  28.77 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  26.61 
 
 		 287 aa  79  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  28.5 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  29.01 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  24.39 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  25.81 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  25.81 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  28.05 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  25.65 
 
 		 269 aa  68.9  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2061  amidohydrolase 2  28.52 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.523278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  26.22 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  25.74 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  25.89 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  25.75 
 
 		 293 aa  58.9  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  26.98 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  27.75 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2888  amidohydrolase 2  27.62 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0545396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2574  amidohydrolase 2  25.2 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000906856  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  25.81 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  24.35 
 
 		 286 aa  54.3  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0918  amidohydrolase 2  25.43 
 
 		 265 aa  53.9  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146298  normal  0.0660058 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2036  amidohydrolase 2  23.44 
 
 		 218 aa  53.9  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1377  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 340 aa  53.9  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.895112  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6447  amidohydrolase 2  25 
 
 		 286 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469414  unclonable  4.69579e-18 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  23.35 
 
 		 287 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  26.47 
 
 		 258 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  24.18 
 
 		 285 aa  53.1  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  29.59 
 
 		 337 aa  52.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2642  amidohydrolase 2  27.31 
 
 		 338 aa  52.4  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4348  amidohydrolase 2  23.95 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  22.92 
 
 		 262 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1748  amidohydrolase 2  26.94 
 
 		 347 aa  50.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  24.26 
 
 		 277 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  24.26 
 
 		 277 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  24.68 
 
 		 277 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  25.71 
 
 		 310 aa  50.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  21.94 
 
 		 336 aa  50.1  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  21.94 
 
 		 336 aa  50.1  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  26.46 
 
 		 294 aa  49.7  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0143  amidohydrolase 2  24.54 
 
 		 280 aa  49.7  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  30.58 
 
 		 358 aa  49.3  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3634  putative amidohydrolase  24.07 
 
 		 345 aa  49.3  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.429944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  24.62 
 
 		 392 aa  49.3  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  26.54 
 
 		 246 aa  48.9  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3599  amidohydrolase 2  21.19 
 
 		 288 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548656  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2736  amidohydrolase family protein  25.85 
 
 		 266 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3496  amidohydrolase 2  26.05 
 
 		 336 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4405  amidohydrolase 2  24.89 
 
 		 341 aa  47.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.290728 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  26 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  30.28 
 
 		 341 aa  47  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  29.2 
 
 		 343 aa  47  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1996  amidohydrolase 2  24.05 
 
 		 279 aa  47  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>