More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0282 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0282  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 246 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.419752  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7112  LuxR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0985225  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  36.18 
 
 		 245 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0418  LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 242 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0402  regulatory protein, LuxR  37.77 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6378  LuxR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 248 aa  135  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6408  LuxR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 248 aa  135  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  35.12 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3321  LuxR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 240 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0702  LuxR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0627  LuxR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.253164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  118  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1766  transcriptional regulator, LuxR family  32.76 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  34.95 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5462  LuxR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 245 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  34.47 
 
 		 243 aa  112  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0350  LuxR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 253 aa  109  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2330  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 240 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2174  regulatory protein, LuxR  33.33 
 
 		 240 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4435  LuxR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2311  LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1443  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.47 
 
 		 238 aa  99  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0854  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.47 
 
 		 238 aa  99  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777865  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2171  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.47 
 
 		 238 aa  99  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0944598  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0444  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.47 
 
 		 238 aa  99  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0542  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.47 
 
 		 238 aa  99  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 260 aa  98.6  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1863  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.47 
 
 		 394 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00465528  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2247  LuxR family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.788747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45960  transcriptional regulator LasR  27.98 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9665  two-component transcriptional regulator LuxR family  29.13 
 
 		 240 aa  95.9  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.024682  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2957  transcriptional regulator protein  29.95 
 
 		 243 aa  95.5  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.923766  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3898  transcriptional regulator LasR  27.16 
 
 		 239 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.219668  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  30.98 
 
 		 254 aa  94.7  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2087  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.58 
 
 		 425 aa  94.7  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417065  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4396  LuxR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 228 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0441  regulatory protein LuxR  30.43 
 
 		 286 aa  92.8  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.923746  normal  0.0183899 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0965  transcriptional activator protein LuxR  27.42 
 
 		 248 aa  92  7e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.266935  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  33.5 
 
 		 253 aa  92  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2507  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal  0.509717 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0702  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  29.39 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.669136  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1576  LuxR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2128  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  29.39 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.423434  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0617  LuxR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0241474  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2215  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  29.39 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2024  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.39 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.896026  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4114  putative transcriptional activator  30.48 
 
 		 213 aa  90.1  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0805  LuxR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 230 aa  89.7  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3863  transcriptional regulator PsyR  26.42 
 
 		 247 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.831721  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0440  regulatory protein LuxR  34.29 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0539143 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0797  transcriptional regulator, LuxR family  27.63 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205827  normal  0.24043 
 
 
-
 
NC_003296  RS01929  transcriptional activator of quorum sensing autoinducer synthesis transcription regulator protein  31.06 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.746701 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1997  autoinducer-binding transcriptional regulator, LuxR family  32.31 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.448669  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1664  transcriptional regulator, LuxR family  32.31 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.888844 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0416  LuxR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 262 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1575  transcriptional regulator, LuxR family  36.02 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0918  transcriptional regulator LuxR family  30.73 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1622  LuxR transcriptional regulator  28.08 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831315  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3840  transcriptional regulator, LuxR family  29.33 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0958  transcriptional activator protein LuxR  28.57 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3500  LuxR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.547243 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0127  transcriptional regulator, LuxR family  26.63 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0548  transcriptional regulator, LuxR family  28.93 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49700  transcriptional regulator  32.13 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0260  LuxR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4374  transcriptional regulator LuxR family  27.05 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0122  LuxR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1758  autoinducer-binding domain-containing protein  33.87 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1686  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.87 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0643903  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2729  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.87 
 
 		 241 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0930619  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0641  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.87 
 
 		 241 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0312274  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2798  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.87 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.675669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2371  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.87 
 
 		 241 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440892  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2915  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.87 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2672  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.87 
 
 		 241 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0505  transcriptional regulator, LuxR family  28.51 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4539  transcriptional regulator, LuxR family, autoinducer-regulated  30.63 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4216  regulatory protein, LuxR  31.25 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4558  LuxR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534127  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1817  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.87 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.985291  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1709  autoinducer-binding domain-containing protein  32.97 
 
 		 233 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3971  LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000126265  normal  0.0321799 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0127  transcriptional regulator, LuxR family  29.08 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1407  LuxR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959158  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4279  LuxR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189781  normal  0.0123236 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  26 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5699  LuxR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0607724 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4168  transcriptional regulator, LuxR family  26.72 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1715  LuxR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00270807  hitchhiker  0.000116776 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1655  LuxR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1547  LuxR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0100  transcriptional regulator, LuxR family  23.9 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  26.61 
 
 		 307 aa  75.5  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>