More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0337 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0337  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 300 aa  617  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001369  putative transcriptional regulator LysR family protein  47.6 
 
 		 299 aa  295  5e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.388836  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06019  transcriptional regulator  47.24 
 
 		 302 aa  286  4e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3348  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 297 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0810  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 306 aa  192  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.735015  normal  0.22542 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5387  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 311 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.444509 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4899  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 311 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.988384 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3467  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 311 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4377  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 313 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394868 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4247  LysR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0098  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 298 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2963  LysR, substrate-binding  30.61 
 
 		 303 aa  139  7e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  32.63 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3571  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 317 aa  135  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.368621  normal  0.292883 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1689  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  27.24 
 
 		 300 aa  135  8e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3712  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 304 aa  135  9e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0547  transcriptional regulator, LysR family protein  29.69 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444887  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0604  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3968  LysR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1423  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  29.62 
 
 		 311 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4691  LysR family substrate binding transcriptional regulator  29.76 
 
 		 300 aa  129  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3156  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 303 aa  129  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000483738  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4124  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 303 aa  129  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.774115  decreased coverage  0.0000191033 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3439  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 303 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0327434  normal  0.240925 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0695  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 303 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000273507  normal  0.730196 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3327  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.114009  normal  0.9019 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3219  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00312841  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0839  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0579  LysR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.0538028 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0257  LysR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 299 aa  125  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0814  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 303 aa  125  7e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000116496  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3521  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 303 aa  125  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00124324  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0846  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 303 aa  125  7e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.579018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1509  putative transcriptional regulator  31.91 
 
 		 302 aa  125  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0839  transcriptional regulator, LysR family  30.17 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.771385  hitchhiker  0.0000128794 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2663  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3853  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2773  LysR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17380  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 302 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 303 aa  123  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2006  LysR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 290 aa  122  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.126264  normal  0.0111016 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3220  transcriptional regulator, LysR family  32.55 
 
 		 293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3325  transcriptional regulator, LysR family  31.62 
 
 		 312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1967  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256766 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2411  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.410162  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3607  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.36 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1787  transcriptional regulator, LysR family  30.71 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3391  transcriptional regulator, LysR family  27.68 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0564115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3690  transcriptional regulator, LysR family  28.92 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1169  LysR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.695965 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4060  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000026158 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3808  transcriptional regulator LysR family  28.28 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4209  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001225  transcriptional regulator LysR family  27.72 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.338504  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2498  transcription regulator protein  29.93 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal  0.394901 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  27.18 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0556  LysR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1033  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 298 aa  116  5e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  30.96 
 
 		 307 aa  115  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4262  LysR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 350 aa  115  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.294051  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2301  hypothetical protein  30.45 
 
 		 302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0938  transcriptional regulator, LysR family  27.91 
 
 		 306 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1124  LysR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 298 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960499  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2445  hypothetical protein  30.45 
 
 		 302 aa  115  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1366  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.89 
 
 		 298 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 298 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3029  LysR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 304 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686925 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1615  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86393  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1557  transcriptional regulator, LysR family  30.14 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1107  transcriptional regulator, LysR family  29.96 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4625  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00069577 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2350  LysR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0854  LysR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4162  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.711373 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0091  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 353 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1239  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.79 
 
 		 299 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1324  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 313 aa  113  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.230209 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1113  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 313 aa  112  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.800719  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1929  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 308 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3130  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 312 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.171352  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33170  putative transcriptional regulator  29.02 
 
 		 304 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.162388  hitchhiker  0.0024503 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  30.74 
 
 		 302 aa  112  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1682  putative transcriptional regulator  25.76 
 
 		 308 aa  112  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177927  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0830  transcriptional regulator, LysR family  30.97 
 
 		 302 aa  112  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.588944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0372  LysR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 292 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5571  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.48 
 
 		 326 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0922437  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2994  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2632  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2101  hypothetical protein  28.92 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1128  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>