267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2199 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2199  membrane-fusion protein-like protein  100 
 
 		 619 aa  1249    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291447 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1408  membrane-fusion protein-like  32.48 
 
 		 631 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.382309  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2177  GAF domain-containing protein  32.27 
 
 		 611 aa  203  6e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266529 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2400  GAF domain-containing protein  28.22 
 
 		 628 aa  182  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2359  putative phytochrome sensor protein  27.78 
 
 		 627 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0926  GAF domain-containing protein  29.19 
 
 		 614 aa  170  6e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1341  putative phytochrome sensor protein  29.91 
 
 		 612 aa  156  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0618  putative phytochrome sensor protein  27.75 
 
 		 615 aa  152  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3236  GAF domain-containing protein  28.27 
 
 		 578 aa  152  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0299  hypothetical protein  26.64 
 
 		 450 aa  73.2  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.251177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5410  hypothetical protein  25.49 
 
 		 449 aa  67.4  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288703  normal  0.36048 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1675  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.38 
 
 		 608 aa  66.6  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3968  hypothetical protein  26.22 
 
 		 727 aa  65.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0475594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0371  hypothetical protein  25.95 
 
 		 457 aa  63.9  0.000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.294814  normal  0.553229 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2055  hypothetical protein  26 
 
 		 442 aa  63.5  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2583  secretion protein HlyD family protein  26.59 
 
 		 437 aa  62.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.860708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3073  hypothetical protein  25.47 
 
 		 448 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  25.93 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  25.93 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0930  RND family efflux transporter MFP subunit  26.53 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2146  RND family efflux transporter MFP subunit  27.56 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0449485  normal  0.0115764 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  24.79 
 
 		 390 aa  59.3  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  27.93 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0883  RND family efflux transporter MFP subunit  27.62 
 
 		 363 aa  59.3  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2261  secretion protein HlyD family protein  26.4 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0232169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  21.13 
 
 		 394 aa  58.9  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0300  hypothetical protein  26.51 
 
 		 719 aa  58.2  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0133976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4285  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.83 
 
 		 458 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1036  RND family efflux transporter MFP subunit  24.47 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4307  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.83 
 
 		 458 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  29.44 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  26.24 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4295  RND family efflux transporter MFP subunit  27.72 
 
 		 466 aa  58.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.073476  normal  0.845427 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0568  hypothetical protein  28.49 
 
 		 442 aa  57.8  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1440  secretion protein HlyD  26.14 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  26.24 
 
 		 372 aa  57.4  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2732  RND family efflux transporter MFP subunit  21.37 
 
 		 361 aa  57  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0844309  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4154  secretion protein HlyD  26.48 
 
 		 458 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  23.3 
 
 		 354 aa  56.6  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0473  hypothetical protein  28.57 
 
 		 442 aa  55.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.796891  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1868  secretion protein HlyD  28.23 
 
 		 405 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.06 
 
 		 448 aa  56.2  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2953  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.56 
 
 		 360 aa  55.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4407  RND family efflux transporter MFP subunit  27.67 
 
 		 360 aa  56.2  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.68 
 
 		 404 aa  55.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3707  RND family efflux transporter MFP subunit  24.8 
 
 		 437 aa  55.1  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00914113 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3268  HlyD family secretion protein  26.29 
 
 		 372 aa  55.1  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1989  RND family efflux transporter MFP subunit  24.66 
 
 		 379 aa  54.7  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0767  RND family efflux transporter MFP subunit  28.71 
 
 		 372 aa  54.7  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00075698  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1203  RND family efflux transporter MFP subunit  27.65 
 
 		 621 aa  53.9  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3548  RND family efflux transporter MFP subunit  22.66 
 
 		 442 aa  53.9  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1877  RND family efflux transporter MFP subunit  28.51 
 
 		 405 aa  53.9  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  23.26 
 
 		 381 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0478  hypothetical protein  26.79 
 
 		 436 aa  53.5  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.8 
 
 		 405 aa  53.5  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  19.79 
 
 		 400 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  21.91 
 
 		 389 aa  53.5  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0567  RND family efflux transporter MFP subunit  26.34 
 
 		 424 aa  53.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1252  ABC transporter  26.78 
 
 		 304 aa  53.1  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2001  secretion protein HlyD  24.63 
 
 		 375 aa  52.4  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.167131  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0669  hypothetical protein  30 
 
 		 439 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02540  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.54 
 
 		 481 aa  52.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0229793  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.07 
 
 		 361 aa  52.8  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  26.37 
 
 		 349 aa  52.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1673  hypothetical protein  23.68 
 
 		 446 aa  52.4  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27195  normal  0.595527 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14330  Secretion protein HlyD family  27.81 
 
 		 401 aa  52.4  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774042  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2666  RND family efflux transporter MFP subunit  28.71 
 
 		 387 aa  52  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  25.37 
 
 		 421 aa  51.6  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6201  putative accessory protein to ABC-type macrolide transport protein MacB  24.88 
 
 		 430 aa  51.6  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31030  putative cation efflux system protein  24.22 
 
 		 409 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000427913  unclonable  4.33311e-22 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3176  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.89 
 
 		 426 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  20.96 
 
 		 390 aa  51.6  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  26.38 
 
 		 360 aa  51.2  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0709  macrolide-specific efflux protein macA  20.96 
 
 		 390 aa  51.2  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0878  secretion protein HlyD  25.71 
 
 		 263 aa  51.2  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0949246  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  26.48 
 
 		 451 aa  51.2  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.484161  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1064  macrolide-specific efflux protein macA  20.96 
 
 		 390 aa  51.2  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0267322  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.58 
 
 		 409 aa  51.2  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.4 
 
 		 512 aa  51.2  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  25.63 
 
 		 380 aa  50.8  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  25.39 
 
 		 367 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  25.78 
 
 		 367 aa  50.8  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0706  secretion protein HlyD  24.67 
 
 		 366 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000331728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4149  RND family efflux transporter MFP subunit  19.84 
 
 		 372 aa  50.4  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.815582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3130  secretion protein HlyD  25.7 
 
 		 473 aa  50.4  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.308652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1328  secretion protein HlyD  24.37 
 
 		 503 aa  50.4  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.918511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  23.81 
 
 		 351 aa  50.1  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  23.81 
 
 		 351 aa  49.7  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.31 
 
 		 334 aa  50.1  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4863  RND family efflux transporter MFP subunit  25.81 
 
 		 360 aa  50.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.176323  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  23.21 
 
 		 390 aa  50.4  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1354  HlyD family secretion protein  25.69 
 
 		 364 aa  50.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336467  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0318  secretion protein HlyD family protein  30.53 
 
 		 271 aa  50.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.844809  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3316  secretion protein HlyD family protein  30.66 
 
 		 423 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.226121 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2103  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 		 403 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0796794  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.55 
 
 		 400 aa  50.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0680  hypothetical protein  24.35 
 
 		 451 aa  50.1  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21021  leukotoxin secretion protein-like protein  23.31 
 
 		 376 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.825476 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1781  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 368 aa  49.3  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.253325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>